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请教一个关于epistasis analysis的问题

请教一个关于epistasis analysis的问题# Biology - 生物学

g*n2017-01-12 08:01

1 楼

我想确认一下两个基因的上下游关系。假设我研究的wildtype细胞size是20 unit,
mutant A的size是30, mutant B的是10, 双突变的size是24，这种情况怎么样确定上下
游关系啊？如果这个实验没法确定的话有没有其他什么实验能来验证？谢谢
PS: A和B的突变体都是null，但不知道它的homolog在这个功能上有没有redundant
function。

S*h2017-01-12 08:01

2 楼

你这样无法确认上下游关系，因为mutant B自己有表型。你看到双突变体的表型居中，
可能是简单叠加的效果。当然，你也可以claim是b可能在a的下游。

g*n2017-01-12 08:01

3 楼

我也觉得因为表型居中所以难以判断哪个suppress哪个。请问有没有什么实验可以进一
步验证？

S*h2017-01-12 08:01

4 楼

我都没考虑也可以认为是a 抑制b. 做些在突变体背景中过表达的实验。epistatic
analysis 很多时候很难明确给出上下游关系。也可以尝试用表型不明显的weak
allele，但你double 不一定会看到抑制。还有就是辅助看蛋白的定位，表达之类。

: 我也觉得因为表型居中所以难以判断哪个suppress哪个。请问有没有什么
实验可
以进一

: 步验证？

【在 g*****n 的大作中提到】