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请教一下NGS based 类似forensic的DNA fingerprinting的method

请教一下NGS based 类似forensic的DNA fingerprinting的method# Biology - 生物学

f*e2018-05-10 07:05

1 楼

还假装若无其事的~

s*s2018-05-10 07:05

2 楼

就是我们有来自不同地方的大量的病人NGS数据，打算分析一下
哪些病人其实是同一个人。
当然，标准的genotyping, 然后check relationship，比如用king也行，
不过这个计算量太大，有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
的方法？就是少量位点，快速比对的方法？最后有现成的工具，或者
文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦

Z*e2018-05-10 07:05

3 楼

这什么动物啊？能当宠物养？

【在 f**e 的大作中提到】

: 还假装若无其事的~

e*y2018-05-10 07:05

4 楼

可以试试 NCBI 的 GRAF (Genetic Relationship and Fingerprinting): https://www
.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi

【在 s******s 的大作中提到】

: 就是我们有来自不同地方的大量的病人NGS数据，打算分析一下
: 哪些病人其实是同一个人。
: 当然，标准的genotyping, 然后check relationship，比如用king也行，
: 不过这个计算量太大，有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
: 的方法？就是少量位点，快速比对的方法？最后有现成的工具，或者
: 文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦

t*12018-05-10 07:05

5 楼

raccoon啊。youtube上有视频，美国有人当宠物养。
太可爱了,youtube上还有视频，一只raccoon憨厚状地顶着一只猫对它脑袋地拍打，捧
了满满一把猫食去吃，也很可爱。http://www.youtube.com/watch?v=aJZMunpgOtI

【在 Z****e 的大作中提到】

: 这什么动物啊？能当宠物养？

s*s2018-05-10 07:05

6 楼

Thanks. nice stat framework.

www

【在 e*****y 的大作中提到】

: 可以试试 NCBI 的 GRAF (Genetic Relationship and Fingerprinting): https://www
: .ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi