s*s
2 楼
就是我们有来自不同地方的大量的病人NGS数据,打算分析一下
哪些病人其实是同一个人。
当然,标准的genotyping, 然后check relationship,比如用king也行,
不过这个计算量太大,有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
的方法?就是少量位点,快速比对的方法?最后有现成的工具,或者
文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦
哪些病人其实是同一个人。
当然,标准的genotyping, 然后check relationship,比如用king也行,
不过这个计算量太大,有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
的方法?就是少量位点,快速比对的方法?最后有现成的工具,或者
文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦
e*y
4 楼
可以试试 NCBI 的 GRAF (Genetic Relationship and Fingerprinting): https://www
.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi
【在 s******s 的大作中提到】
: 就是我们有来自不同地方的大量的病人NGS数据,打算分析一下
: 哪些病人其实是同一个人。
: 当然,标准的genotyping, 然后check relationship,比如用king也行,
: 不过这个计算量太大,有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
: 的方法?就是少量位点,快速比对的方法?最后有现成的工具,或者
: 文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦
.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi
【在 s******s 的大作中提到】
: 就是我们有来自不同地方的大量的病人NGS数据,打算分析一下
: 哪些病人其实是同一个人。
: 当然,标准的genotyping, 然后check relationship,比如用king也行,
: 不过这个计算量太大,有没有类似Forensic里面DNA fingerprinting
: 的方法?就是少量位点,快速比对的方法?最后有现成的工具,或者
: 文章也行。否则要自己根据AF做个stat model实在太麻烦
t*1
5 楼
raccoon啊。youtube上有视频,美国有人当宠物养。
太可爱了,youtube上还有视频,一只raccoon憨厚状地顶着一只猫对它脑袋地拍打,捧
了满满一把猫食去吃,也很可爱。http://www.youtube.com/watch?v=aJZMunpgOtI
【在 Z****e 的大作中提到】
: 这什么动物啊? 能当宠物养?
太可爱了,youtube上还有视频,一只raccoon憨厚状地顶着一只猫对它脑袋地拍打,捧
了满满一把猫食去吃,也很可爱。http://www.youtube.com/watch?v=aJZMunpgOtI
【在 Z****e 的大作中提到】
: 这什么动物啊? 能当宠物养?
s*s
6 楼
Thanks. nice stat framework.
www
【在 e*****y 的大作中提到】
: 可以试试 NCBI 的 GRAF (Genetic Relationship and Fingerprinting): https://www
: .ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi
www
【在 e*****y 的大作中提到】
: 可以试试 NCBI 的 GRAF (Genetic Relationship and Fingerprinting): https://www
: .ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/Software.cgi
c*p
7 楼
可爱!这个东西其实凶起来的时候很可怕
t*d
8 楼
浣熊能养得家吗?
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