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H*g
2
一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
致信息含量减少)。
换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
基因组并没有都变成一堆乱码?
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T*e
3
你至少要估计一下熵增加的速率才能提出这个问题吧

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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R*a
4
总共才几亿年,帝哥眼里也就一眨眼功夫而已

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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H*g
5
这个很不好估啊。我的意思是,我可以看到很多破坏基因组的因素,但是似乎理论上基
因组产生有用的东西就靠碰运气。这两个变化似乎很不平衡啊。
再说,你看人的基因组一共26000个蛋白质基因,似乎个个都有点用。要怎么样才能演
化出来新的功能基因呢?
一个可能的机制:
历史上(哺乳?)动物的老祖宗似乎有个变成四倍体又变回二倍体的事件,所以很多当
时被复制的基因变成新基因了。是不是说其实基因组基本稳定的物种,其实都是在消亡
的路上慢慢爬,而未来属于某个畸形儿童的后代呢?

【在 T******e 的大作中提到】
: 你至少要估计一下熵增加的速率才能提出这个问题吧
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n*d
6
把病毒攻击的残迹看成是人体的一部分

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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R*a
7
对,猴子说,你们人类都是某个脱毛症患者猴子的后代

【在 H********g 的大作中提到】
: 这个很不好估啊。我的意思是,我可以看到很多破坏基因组的因素,但是似乎理论上基
: 因组产生有用的东西就靠碰运气。这两个变化似乎很不平衡啊。
: 再说,你看人的基因组一共26000个蛋白质基因,似乎个个都有点用。要怎么样才能演
: 化出来新的功能基因呢?
: 一个可能的机制:
: 历史上(哺乳?)动物的老祖宗似乎有个变成四倍体又变回二倍体的事件,所以很多当
: 时被复制的基因变成新基因了。是不是说其实基因组基本稳定的物种,其实都是在消亡
: 的路上慢慢爬,而未来属于某个畸形儿童的后代呢?

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H*g
8
猴子和人之间的差别还是很小的,如果恐龙灭绝那样的事情再来一次,人和猴子得一块
儿玩完。需要眼光再放远一点,步子再迈大一点。搞点量子跃迁式的突变,为人类的未
来埋下伏笔。

【在 R***a 的大作中提到】
: 对,猴子说,你们人类都是某个脱毛症患者猴子的后代
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T*e
9
这个问题太深了,不懂

【在 H********g 的大作中提到】
: 这个很不好估啊。我的意思是,我可以看到很多破坏基因组的因素,但是似乎理论上基
: 因组产生有用的东西就靠碰运气。这两个变化似乎很不平衡啊。
: 再说,你看人的基因组一共26000个蛋白质基因,似乎个个都有点用。要怎么样才能演
: 化出来新的功能基因呢?
: 一个可能的机制:
: 历史上(哺乳?)动物的老祖宗似乎有个变成四倍体又变回二倍体的事件,所以很多当
: 时被复制的基因变成新基因了。是不是说其实基因组基本稳定的物种,其实都是在消亡
: 的路上慢慢爬,而未来属于某个畸形儿童的后代呢?

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R*a
10
步子再大就不是人类的未来了啊,说不定是现在某只苍蝇的后代了。
另外,码公写的product code实际上就是一种DNA,一个机器人按程序
生产下一个机器人就是繁殖。机器人稍微聪明点儿会自己改code就是变异。
所以AI实际上是可以形成跟生物圈非常类似的自我繁殖自我进步的生态环境的。
这个跃进显然比目前生物史上哪次跃进都大

【在 H********g 的大作中提到】
: 猴子和人之间的差别还是很小的,如果恐龙灭绝那样的事情再来一次,人和猴子得一块
: 儿玩完。需要眼光再放远一点,步子再迈大一点。搞点量子跃迁式的突变,为人类的未
: 来埋下伏笔。

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H*g
11
有一集futurama就是他们一伙人扔的智能小虫子两三天之间走完了进化进程。

【在 R***a 的大作中提到】
: 步子再大就不是人类的未来了啊,说不定是现在某只苍蝇的后代了。
: 另外,码公写的product code实际上就是一种DNA,一个机器人按程序
: 生产下一个机器人就是繁殖。机器人稍微聪明点儿会自己改code就是变异。
: 所以AI实际上是可以形成跟生物圈非常类似的自我繁殖自我进步的生态环境的。
: 这个跃进显然比目前生物史上哪次跃进都大

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H*g
12
再有,据说每天(还是每分钟,不记得了,george carlin说的)地球上消失25个物种
。可是地球上同期产生了25个物种吗?那地球上现在有这么多物种都是哪里来的?如果
不承认是帝哥造的,那么显然历史上就有物种大爆发的阶段,现在只是在吃老本。
那么物种大爆发到底是怎么回事呢?

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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R*a
13
现在就是吃老本啊,只有物种大灭绝的阶段,和物种大灭绝以后新物种迅速填补的阶段。

【在 H********g 的大作中提到】
: 再有,据说每天(还是每分钟,不记得了,george carlin说的)地球上消失25个物种
: 。可是地球上同期产生了25个物种吗?那地球上现在有这么多物种都是哪里来的?如果
: 不承认是帝哥造的,那么显然历史上就有物种大爆发的阶段,现在只是在吃老本。
: 那么物种大爆发到底是怎么回事呢?

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d*o
14
所以突变率不能太高
不然会mutational meltdown

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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H*g
15
你不是非千老吗,怎么懂这么高深的词?

【在 d****o 的大作中提到】
: 所以突变率不能太高
: 不然会mutational meltdown

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d*o
16
以前做复杂系统的时候学过
还有什么遗传算法之类的

【在 H********g 的大作中提到】
: 你不是非千老吗,怎么懂这么高深的词?
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H*g
17
看样子我今天琢磨的事搞数学和计算的肯定都琢磨过了。

【在 d****o 的大作中提到】
: 以前做复杂系统的时候学过
: 还有什么遗传算法之类的

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d*o
18
孔老二说
学而不思则罔
思而不学则殆
还是有道理的
你们术版大佬讨论也算开交叉学科seminar了

【在 H********g 的大作中提到】
: 看样子我今天琢磨的事搞数学和计算的肯定都琢磨过了。
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a*a
19
人二三十岁生完孩子之后,再咋蜕变,doesnt matter了。

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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q*n
20
笨,拥为有能量的输入啊

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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i*i
21
哥,搜molecular clock

【在 T******e 的大作中提到】
: 你至少要估计一下熵增加的速率才能提出这个问题吧
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s*l
22
把攻击看成对有序化的加强?外行瞎猜。

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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s*s
23
要点就是两个字:进化。
熵这种东西是统计概念,实际随机过程中虽然大部分混乱度增加,但是少部分
混乱度减少,总体熵上升。但是进化淘汰了这些混乱度增大的,剩下部分熵减
少的形成了新的群体,造成了下一代实际是熵减少。

【在 H********g 的大作中提到】
: 一个物种的基因组一直受到各种外界的攻击。比如人的基因组里50%以上都是反转录因
: 子(ie 病毒)的残迹,甚至还有活的。还有系统性的把C变成T这样的慢慢的变化(导
: 致信息含量减少)。
: 换句话说,从可观测到的尺度看,我个人觉得一个物种的基因组一直是在熵增的。那么
: 问题是,为什么生命可以在地球上一直坚持到今天?也就是说,为什么地球上的物种的
: 基因组并没有都变成一堆乱码?

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H*g
24
那为什么人基因组里到现在还是一半都是垃圾?为啥没有选出来编码效率更好的?

【在 s******s 的大作中提到】
: 要点就是两个字:进化。
: 熵这种东西是统计概念,实际随机过程中虽然大部分混乱度增加,但是少部分
: 混乱度减少,总体熵上升。但是进化淘汰了这些混乱度增大的,剩下部分熵减
: 少的形成了新的群体,造成了下一代实际是熵减少。

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s*s
25
攻击也是有作用的。虽然随机插入是一个无序过程,但是插入的序列本来就是
有序的,而且可能越是有序越是插入效率高。所以一个有序的东西里面随机
插入大量有序的东西,很难说熵增大还是减少,要量化分析。我感觉大多数
情况还是熵增大,因为病毒只是简单有序

【在 s*l 的大作中提到】
: 把攻击看成对有序化的加强?外行瞎猜。
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H*g
26
如果给人装个超级兔子,把人基因组里的垃圾清一清,究竟是会做出来轻装版的人,还
是会把人搞死机?
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s*s
27
那个不是垃圾,那是进化的基础。或者从熵的角度说,重要的功能序列
随机突变多半是熵增大,这些没啥用的序列随机突变造成熵减少的可能
更高。

【在 H********g 的大作中提到】
: 那为什么人基因组里到现在还是一半都是垃圾?为啥没有选出来编码效率更好的?
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s*s
28
对于个人没问题。对于群体来说,就该灭亡了。
因为缺少diversity,难以应对环境变化;更重要的是,进化的材料没有了

【在 H********g 的大作中提到】
: 如果给人装个超级兔子,把人基因组里的垃圾清一清,究竟是会做出来轻装版的人,还
: 是会把人搞死机?

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H*g
29
明明一半都是历史上的病毒尸体嘛

【在 s******s 的大作中提到】
: 那个不是垃圾,那是进化的基础。或者从熵的角度说,重要的功能序列
: 随机突变多半是熵增大,这些没啥用的序列随机突变造成熵减少的可能
: 更高。

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H*g
30
这样说倒是略有些道理。不过从这些高度重复的序列里进化出功能基因的几率是不是略
低啊?

【在 s******s 的大作中提到】
: 对于个人没问题。对于群体来说,就该灭亡了。
: 因为缺少diversity,难以应对环境变化;更重要的是,进化的材料没有了

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s*s
31
这种乱插入扩大基因组容量速度快啊;而且无数重组造成各种缺失和重复
突变。尤其是重复突变,一个功能基因变两个,其中一个可以保留功能,
另一个可以随便开发新功能

【在 H********g 的大作中提到】
: 这样说倒是略有些道理。不过从这些高度重复的序列里进化出功能基因的几率是不是略
: 低啊?

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s*l
32
建筑垃圾?

【在 H********g 的大作中提到】
: 明明一半都是历史上的病毒尸体嘛
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