Omicron:毒王族谱(2022年10月16日更新)
文 | 拍老师
前言
以上每一个小圆点代表Omicron家族的一个子分支(sublineage); 由于BA.1已经彻底过气了,所以这棵树是从BA.2开始构建的,没有BA.1的位置; 由于现如今子分支太多,所以换成了radial diagram视角,不然用常规视角真放不下……总之,元祖版BA.2位于圆的中心,其他各个子分支离圆心越远,则突变数量越多; 不同颜色的小圆点分别属于各个不同的Omicron亚谱系; 红色的那些小圆点全部是跟Omicron相关的重组株(严格来说重组株并不应该出现在这棵演化树上,Cornelius小哥强行移花接木过来,主要是为了方便示意) 总之,上图距离元祖版BA.2演化距离最远的,是发生了德奥合并的XAW、XAY、XBA和XBC四款重组株,然后则是XBB子分支、BA.2.3.20子分支和BS子分支。
上面一共有51种重组株,占了Pango体系下所有重组株的大部分; 其他没上榜重组株包括XA、XB和XC三种Omicron时代以前的重组株、XD这种只涉及BA.1的重组株,以及XE这种相对于元祖版BA.2没有氨基酸变异的重组株; 上图所有重组株当中,XAY、XBB、XBC三种的增速最猛,以至于已经分化出各自的子毒株,即:XBB.1、XBB.2、XBB.3、XBB.1.1、XAY.1、XAY.2、XBC.1、XBC.2等; 抗原距离最远的,则是德奥合并产物XAW,并且XAW现在仍在保持蔓延——由于XAW重灾区俄罗斯测序能力严重拉胯,所以暂时还没法评估XAW的威胁度; 还有一款正在迅速蔓延的重组株,由于太新,所以暂时没入选,也就是之前抢跑过的香港首发的XBD。
关于XBB的介绍请见《XBB》; 关于XAY的介绍请见《近期变异株动态小结(印度·南非·特别篇)》; 关于XAW的介绍则请见《巴塞尔报告(第二期)》的第八部分。
大概率起源于菲律宾的BA.2.3.20,以及大概率起源于越南的BS.1,都是最近相对增长优势挺厉害的子分支,如今双双喜添新丁; 其中BA.2.3.20的子分支CM系列,值得高看一眼的是CM.3,相对于BA.2.3.20额外多出了刺突蛋白G485D; BS.1的子毒株BS.1.1,则相对于BS.1额外多出了刺突蛋白G257V和K356T; 关于BA.2.3.20的介绍请见《次世代毒王争霸赛已经揭开序幕(BQ.1.1、BA.2.3.20和XBB)》;关于BS.1的介绍则请见《巴塞尔报告(第五期,2022年9月19日)》。
以上所有黄色小圆点都属于BQ.1亚谱系,整整24个子毒株……其中增速最猛的,仍然是BQ.1.1,几乎属于第六阶的天花板。 此外,BA.5.3亚谱系下还有其他一些新丁,比如CC.1、CQ.1等。
重组株里面的XBB.1、XBB.1.1、XAW、XAY.1、XBD; BA.2亚谱系里面的CM.3和BS.1.1; BA.2.75亚谱系里面的CH.1.1、CJ.1、BM.1.1.2、CA.4,以及BN.1.1.2; BQ.1亚谱系里面的BQ.1.1; BA.4亚谱系里面的BA.4.6.3; BA.5亚谱系里面的BF.7.2和CT.1。
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来源: qq
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