冠状病毒当前，国内的“支援”要来了
沏一杯茶，犒劳一下自己---手填税表做完了
昨天就搞完了联邦税，今天把州税填完，能拿回来总共1800，够交五月份就要来的房地产税账单的三分之一了。。。
LOL，穷人就是这么计划着每分钱的用途的。今天带领导去看open house，真不错的房子，就是太贵啊，房地产税就比我现在的多出差不多一倍。问领导：你是愿意多干三年住这个房子呢，还是早三年退休？领导毫不犹豫地选择后者。。。
不错不错，春天来了，今天带领导去湖边走了一英里。懒虫走不动，我只好自己多走了几圈，四英里吧。马上可以种菜了，先把体力提升点，翻地有力气才行。领导问要不要买一卡车top soil，我说等退休后再买，现在没时间一桶一桶从driveway搬到房子后面的菜园子呢。。。
（二0二0年二月二十三日）
昨晚回家，给领导交待了家底
我家领导是甩手掌柜，从来不知道家里的财政状况的。她的口头禅就是：你办事，我放心。。。
这不，冠状病毒当前，昨晚整理完税表，准备今天寄出去的时候，就把她叫过来，在她的记事本上，写好各个账户的大致情况，从life insurance找雇主的那个部门，到退休账户的密码，再到银行户头的双重保护密码。。。看完了，人家鼻子一歪：我们账户不少，钱倒不多么。。。
斜了她一眼：不是让你多干两年么。。。
（二0二0年二月二十六日）
科普--冠状病毒的核酸检测
所谓病毒核酸检测，就是检测病毒的遗传物质。冠状病毒是RNA病毒，就是检测病人样品里有没有冠状病毒的特异RNA，原理上和犯罪现场检测犯人的DNA差不多：就是通过上世纪八十年代末九十年代初发明的PCR技术。
前面的科普提到DNA/RNA是由四种不同的核苷酸的单体形成的聚合物。有了一条现成的聚合物（X），它对应的另一条（Y）可以通过核苷酸的配对原则（A:T/U或者G:C）来合成。也就是现成的一条作为模板（X），合成另一条（Y）。新合成的一条（Y）在下一轮也可以作为模板，反过来合成最先的X。。。这个循环反复进行，一变二，二变四，四变八。。。条件容许一个X分子，经过30个循环，就可以变成2^30条X，自然可以达到检测需要的量了。
上面这个循环就叫Polymerase Chain Reaction(PCR)。它需要一个起始的小片断，我们叫引物。引物一般是20个左右的核苷酸组成的聚合物，只要引物找到配对的模板，Polymerase就根据模板的序列，在引物上面不停地按配对原则加核苷酸，把一个20左右核苷酸长度的引物变得和模板一样长。所以，是引物的特异性（序列）决定了PCR能扩增那个特异的DNA/RNA模板。假如一个引物的序列是：5’AGGTCGGATGCTCCTTAGGAG，21个核苷酸，按照配对原则，它找到的模板一定很难得。这就是知道了冠状病毒的RNA序列之后，可以很快设计出冠状病毒特异引物的原理。一个引物只能延伸出一条DNA链，要两条链都扩增，PCR就用两个引物，来回扩增。。。所以，保证这个扩增出来的PCR产物一定是冠状病毒的，有两个引物的特异性把关，还有PCR产物的大小也是已知的。
PCR的模板只能用DNA，不能用RNA。所以，对RNA病毒，用PCR方式来检测，就是先提取样品里的RNA，然后进行一步叫“逆转录”的反应，也是按核苷酸配对原则，合成DNA后，再PCR检测DNA。。。
从中国发表冠状病毒全序列后，核酸检测就可以实施了，所以核酸检测是最先实施的。一个有经验的博士后或技术员，一个分子生物学实验室就可以做，或者每个州的forensic实验室也基本能胜任。这个方法的问题出在病毒是RNA上----RNA没有DNA稳定。我早期在国内做RNA，都很仔细的，主要是降解RNA的RNase无处不在，还特稳定，所以，那时候装试剂的玻璃瓶都是摄氏400高温烤四个小时才能用的。现代实验室都是一次性塑料制品，好了很多。但就是现在我们用商业kit提取RNA后，都是负70度保存的。所以，从病人身上取样后，保存不好；或取样量不够；或病毒RNA被降解等等，就会检测不到。这个也是早期中国用核酸检测武汉病毒碰到的问题，很多阳性病人检测不出来。
PCR检测的另一个问题是样品污染。这个往往发生在试验操作人员的不小心上。PCR扩增产物是指数级增长的，一般我们作PCR循环，到了35个还检测不到，我们就定型阴性。如果还往上增加循环次数，往往就会有产物出来了，这样的结果我们度算不可靠的。一个实验室天天作同一个PCR产物，往往很容易产生交叉污染，阴性样品也会显示产品。所以，一般实验室会非常小心，经常会postive/negative control同时进行，确保PCR反映成功（positive control）；同时没有交叉污染（negativecontrol）。
RNA不稳定性决定了最好是拿到样品后马上处理检测。美国病人不多，也就没有紧迫感。武汉湖北可是太紧迫了。而核酸检测可以同时处理大量样品，几个小时就可以出结果。就是有一些不准确也值得啊。。。可以边做边调整边改进。
我们也常做细胞培养micoplasma污染的。用商业Kit的感觉是需要高污染才能检测到。很多时候我凭经验就知道很可能有污染了，但PCR的kit经常检测是没有污染。碰到这种情况我们往往人为地让细胞多长几天，不换medium，等micoplasma累积多了就能看出来。实验室无所谓。但针对这个疾病，应该是宁愿把阴性搞成阳性，然后再检测确认，也不能放过阳性的。所以，kit的设计思路上可以有很大的调整余地。另外，检测是有和无，是定性的，PCR现在可以定量或传统方式的半定性。如PCR方式的循环次数多少，就可以改变测试的灵敏度的。我没用过CDC的测试kit，就不能提具体建议了。
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前几天还有一个研究生找我请教，如何通过PCR，克隆一个人的基因。他们都知道我有magic，用计算机software设计好了，还找我改进。我看了一下他的思路，问明了他要克隆的人基因在细胞里表达量高低和基因的大小和结构，指出了他设计的PCR引物偏小，每个引物多加两三个核苷酸就好；然后让他在作逆转录时别用kit里提供的通用引物，而是改成他要的基因的specific引物。昨天给我看PCR结果，高兴坏了：都浪费了一百多块钱去买公司的产品，然后自己花了一个礼拜时间，最后发现根本就没有他要的基因。找公司，公司自己试了，最后承认是没有，产品下架。。。我这30分钟就解决了他的问题。。。我开玩笑说，20年前的老知识还是有用的。
（二0二0年二月二十七日）
领导?把我的生日忘了
昨晚都上床了，就听见电话铃响：“喝不喝一杯？” 电话那头是酒鬼。
“啊，这么晚了。。。听背景你在开车？” 我问。
“是。刚给学生上完讨论课，回家路上呢。”酒友说。
“我家领导忙着给她爹娘打电话呢。”
“哦，我以为她记得你生日呢。。。” 酒友玩笑着。
咱生日多，农历阳历农历推选的阳历，那个方便就过那个啦。。。所以，领导忘了往往有办法补救的。这不，今早一起来，领导就嚷嚷：生日今天过。我做馒头给你吃。。。
晚上叫上老酒友，两人分享了一瓶泸州老窖。
儿子大学第三年的financial aid package下来了
寒假的时候就抓住儿子赶紧把申请送进去，谁想FASFA送回来的confirm邮件，说的是2019-2020的数字。我们查了几遍，明明我们填的表格是2020-2021的。糊涂了，去儿子学校网站查，说申请收到，等FASFA的数据。。。只好给儿子说：3/31之前还能送一轮申请。万一FASFA搞错了，等你春假回来我们再填一次吧。。。
昨晚儿子短信把学校的结果转给我：两万奖学金，一万出头的grant，work-study 2200，还有就是loan 5000了。今天赶紧把学校的开销调出来，七万出头。。。算了算，除了loan，我还要掏35000呢。边喝咖啡边给领导汇报：到五月份我今年的工作合同结束，要完成的任务很重啊--儿子第三年的钱够了，可换房顶的钱，五月份要来的房地产税，还有夏天全家度假的钱还没着落呢。。。
给儿子短信：贷款是政府补贴的，虽然比上年多了很多，你四年下来的总数也就17000。如果象姐姐一样大学毕业就找到工作，应该不是问题。work-study的钱爹妈来cover，你挣多少就花多少。老爸老妈还是match你挣的钱，但必须放Roth IRA。。。
穷人家就是这么数着钱过日子的。。。
（二0二0年二月二十九日）
冠状病毒当前，国内的“支援”要来了
昨天接到国内北京朋友的微信，她儿子在这里上学，担心美国的冠状病毒扩散，要寄口罩来。怕儿子上课忙，校园人杂，要寄到我家。顺便给我们分一百个。。。呵呵，我家就没囤口罩，这下终于有了。。。
这个朋友其实以前不认识的。因儿子要来上学，邻居是我表妹，就介绍过来了。送儿子来的时候见过一面，再以后就是孩子有事找找我，过节我们有空就叫过来吃个饭。父母知道了，很客气，每次孩子回来都不忘带点礼品给我们。上次儿子的信用卡被盗用后，怕寄丢了麻烦，不敢邮寄，找我们帮忙。正好我有邻居在国内，回来路过北京，马上让他们联系上，带过来。寒假儿子回去后，还托儿子带茶叶给我邻居，我们也跟着沾光。
朋友也是慢慢处出来的。。。
（二0二0年三月一日）