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有人有兴趣讨论下这篇NB上的paper不?
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有人有兴趣讨论下这篇NB上的paper不?# Biology - 生物学
s*0
1
请问:在君之的方子里,奶油奶酪(cream cheese?),动物性淡奶油英文叫什么?在
walmart的大概什么位置可以找到?谢谢!
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w*e
2
Monoclonal antibodies isolated without screening by analyzing the variable-
gene repertoire of plasma
http://www.nature.com/nbt/journal/v28/n9/full/nbt.1673.html
感觉concept很不新吧。本质上都是evolution,强者dominate gene pool。
过去测序能力有限,所以要做多个round的selection,让强者的percentage提高
到一定程度才能看出来,现在一个round之后就有可能。这个concept同样使用
于各种display(小声说我一同事就在做类似的东西,不过稍微更fancy一点点),
selex,etc。
当然其实业内人应该知道,caveat也不少。比如starting library的size肯定
很小,估计最多10^9,不然sequencing的结果很可能不够显著。考虑到找到
best binder的几率跟pool size成正比,其实是大问题。另外每个unique
sequence的copy数要一致,除了target interaction造成的选择压之外其他
条件要对所有sequence一视同仁才能不引进bias(很不容易),最后的最后,
一个round就要结果,随机性的影响也很大。
当然这里都是从理论的角度考虑,实践上,这篇paper是不是克服了重要的
技术难题?或者有很高的应用价值?这些就不是我能判断的了。请达人评点
一下吧?
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c*u
3
奶油奶酪=cream cheese
动物性淡奶油英文=heavy cream or whipping cream
在奶制品的冷藏柜里

【在 s*********0 的大作中提到】
: 请问:在君之的方子里,奶油奶酪(cream cheese?),动物性淡奶油英文叫什么?在
: walmart的大概什么位置可以找到?谢谢!

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l*1
4
两三个月前扫了一眼,也没觉得有多有趣。其实原理很明显。唯一值得称到的是一步
evolution+NGS,快速得到高亲和力的抗体。时间上较传统的方法更具优势。存在的问题么,是不是所有的作用都是加合性质的,有没有可能存在negative synergy?
不过NGS+protein engineering似乎能成为一个卖点,Pluckthun最近也应该会出那么片文章应用NGS提高GPCR表达水平的文章。
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s*0
5
能人就是多!谢谢啊!

【在 c*******u 的大作中提到】
: 奶油奶酪=cream cheese
: 动物性淡奶油英文=heavy cream or whipping cream
: 在奶制品的冷藏柜里

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w*e
6
很奇怪为什么microdroplet HT platform为什么还没有成型。我还是最看好这个的
前景,直接测最终产物,不必依赖进化选择压。
话说不是gene expression level跟protein level的关系很复杂的吗?用NGS做
protein engineering的童鞋们真的都默认gene expression 高->protein level
高->适应性高吗?

问题么,是不是所有的作用都是加合性质的,有没有可能存在negative synergy?
么片文章应用NGS提高GPCR表达水平的文章。

【在 l*********1 的大作中提到】
: 两三个月前扫了一眼,也没觉得有多有趣。其实原理很明显。唯一值得称到的是一步
: evolution+NGS,快速得到高亲和力的抗体。时间上较传统的方法更具优势。存在的问题么,是不是所有的作用都是加合性质的,有没有可能存在negative synergy?
: 不过NGS+protein engineering似乎能成为一个卖点,Pluckthun最近也应该会出那么片文章应用NGS提高GPCR表达水平的文章。

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c*u
7
不客气:)

【在 s*********0 的大作中提到】
: 能人就是多!谢谢啊!
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s*a
8
Total antibody production is proportional to number of producing B cells,
and making antibody dominates the gene expression of those cells. The
correlation btw antibody mRNAs and proteins in a cell population does exist.
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