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如何研究多个转录因子相互作用的kinetics？

如何研究多个转录因子相互作用的kinetics？# Biology - 生物学

u*e2011-11-29 08:11

1 楼

各位大佬，我们实验室发现某种激素能引起3个转录因子的相互作用（IP and DNA
pull dwon），并协同激活基因A的表达。现在我们下一步想研究这个3个转录因子相互
结合的kinetics。这三个蛋白之中任两个的相互作用都有人研究过了。大家有什么建议
？谢谢~

p*u2011-11-29 08:11

2 楼

建议看一下小说《三体》，肯定会有答案

l*12011-11-29 08:11

3 楼

if you want to try Synthetic biological approach
try go to Cell article:
[PDF]
Defining Network Topologies that Can Achieve Biochemical ...(2009)
http:\tang.ucsf.edu/publication/MaWCell.pdf
and SOM of it:
http://download.cell.com/mmcs/journals/0092-8674/PIIS0092867409
Figure S2 and S3 etc.

【在 u***e 的大作中提到】

: 各位大佬，我们实验室发现某种激素能引起3个转录因子的相互作用（IP and DNA
: pull dwon），并协同激活基因A的表达。现在我们下一步想研究这个3个转录因子相互
: 结合的kinetics。这三个蛋白之中任两个的相互作用都有人研究过了。大家有什么建议
: ？谢谢~

b*s2011-11-29 08:11

4 楼

这个回复让我想起我的一个疑问。我现在一直在做传统发育和细胞生物学。
考虑到未来的方向，不想在这么按部就班得做传统的东西。
Synthetic biology的概念看起来比较吸引我，但是看看网上的介绍，这个领域真是开
江湖大会，哪个门派都有。很多其实就是原来的bioengineering，改个名字而已。另一
些就是原来做modeling的人。我比较想更偏生物一些，具体想做什么还没想好。大约是
精确或尽可能定量化研究和测量生物系统。不过我现在既没有数学，也没有物理背景。
大牛们给说说可行不？有接触过相关领域的朋友能不能谈谈现状和前景？谢谢！

【在 l**********1 的大作中提到】

: if you want to try Synthetic biological approach
: try go to Cell article:
: [PDF]
: Defining Network Topologies that Can Achieve Biochemical ...(2009)
: http:\tang.ucsf.edu/publication/MaWCell.pdf
: and SOM of it:
: http://download.cell.com/mmcs/journals/0092-8674/PIIS0092867409
: Figure S2 and S3 etc.

c*b2011-11-29 08:11

5 楼

不是大牛，但是我觉得你发掘一个好的生物学model，然后自然找得到那些人合作。

【在 b******s 的大作中提到】

: 这个回复让我想起我的一个疑问。我现在一直在做传统发育和细胞生物学。
: 考虑到未来的方向，不想在这么按部就班得做传统的东西。
: Synthetic biology的概念看起来比较吸引我，但是看看网上的介绍，这个领域真是开
: 江湖大会，哪个门派都有。很多其实就是原来的bioengineering，改个名字而已。另一
: 些就是原来做modeling的人。我比较想更偏生物一些，具体想做什么还没想好。大约是
: 精确或尽可能定量化研究和测量生物系统。不过我现在既没有数学，也没有物理背景。
: 大牛们给说说可行不？有接触过相关领域的朋友能不能谈谈现状和前景？谢谢！

l*12011-11-29 08:11

6 楼

你可以试着联系下以下
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/15852903.html
介绍的牛门那边的华人千老或独立出去的发考题们
ZZ
发信人: zesta (最讨厌的饼干), 信区: Biology
标题: Math/Systems/Synthetic Biology 人物榜 ---- 浮沉篇
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 20 22:27:46 2010, 美东)
3年前的一月，因为天冷没地方去，我写了“Math/Systems/Synthetic Biology 人物榜
” （http://www.mitbbs.com/bbsann2/scitech.faq/Biology/greatbiologist/M.1169947574.O0/Math+Systems+Synthetic+Biology+...），引出不少有意思的讨论。neverthink还给了我20伪币（谢了）。三年后的今天，又有人把它翻出来了。我们都老了，物是人非，云彩回国and挨骂了，neverthink不说中文了，河马改名云舟了，demoner当斑竹了，decay想嫁人了，新的id也涌现了。那么这些曾经在我们视野中的所谓牛人都有什么新动态？又有什么新人涌现？我们又能从中学到些什么呢？
让我循着上次的顺序来吧
ignored

【在 b******s 的大作中提到】