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请教做genome structural variation/CNV的牛人有哪些

请教做genome structural variation/CNV的牛人有哪些# Biology - 生物学

A*n2012-03-06 08:03

1 楼

随着《唐人街探案》系列票房和口碑均占据了天时地利人和，导演陈思成开始事业的巅
峰期，演员演而优则导的不少，但是真正成功的没几个，毕竟还是要根据作品说话，当
《唐人街探案2》的票房数据还在持续上涨时，导演陈思诚名利双收，这本身是一种成
功者的定义。陈思成是一个自信而聪明的人，从小家庭优渥，没吃过苦，也没有受过贫
穷的折磨，所以陈思成的童年幸福而快乐。成年后的他凭借自己的实力去演戏，导演，
制作电影，一次次的用票房刷新着优异的成绩。
陈思成的婚姻幸福，娶了干净清纯的新疆姑娘佟丽娅，还有一个可爱的孩子朵朵，要风
得风要雨得雨的日子充斥着浮躁，陈思成留恋夜店和辣妹同进同出，陈思成的婚姻变得
岌岌可危，他和丫丫的感情别得脆弱。但是打碎牙往肚子咽的丫丫只能睁一只眼闭一只
眼，不会和他离婚的。《唐人街探案2》制作精良，故事严谨，主要还是导演选角选得
好。刘浩然，王宝强和肖央为观众奉献了非常棒的演技。在一片笑声中也掺杂着复杂的
探案剧情。烧脑刺激。但是作为商人，他是成功的，作为丈夫就很难说了。

a*u2012-03-06 08:03

2 楼

顿悟啊。
有反对的吗？

u*12012-03-06 08:03

3 楼

如题。尤其是和disease相关的；研究strcutural variation/copy number variation在disease（尤其是
neurological disease)相关的牛人有哪些？
我知道的一个是UW的Evan Eichler；一个是BCM的James Lupski
不晓得还有什么牛人？
另外不晓得大家对这个方向（medical genomics）的前景如何看的
谢谢！

z*e2012-03-06 08:03

4 楼

对iPhone5的任何评价都不重要，看明年iPhone6出来什么样子吧，那个决定iPhone的走
势和市场占有率。

n*w2012-03-06 08:03

5 楼

乍一看还以为是choroidal neovascularization.
心想，这咋和genome structural variation联系上。。。lol

a*u2012-03-06 08:03

6 楼

就这么定了

d*m2012-03-06 08:03

7 楼

cshl有一个，做了开创性工作，具体名字忘了，LZ可以去找找

i*n2012-03-06 08:03

8 楼

希望屏幕在大点

u*12012-03-06 08:03

9 楼

你咋会想到choroidal neovascularization的呢

【在 n***w 的大作中提到】

: 乍一看还以为是choroidal neovascularization.
: 心想，这咋和genome structural variation联系上。。。lol

a*u2012-03-06 08:03

10 楼

搞什么鬼啊。。

M*n2012-03-06 08:03

11 楼

you are late.
this field is already crowded.

n*72012-03-06 08:03

12 楼

jonathan sebat 算个小牛吧

u*12012-03-06 08:03

13 楼

Then can you tell me which field is NOT crowded?

【在 M*****n 的大作中提到】

: you are late.
: this field is already crowded.

M*n2012-03-06 08:03

14 楼

俺给你指个明路吧。
为什么说这个有点挤了，因为俺们这儿的human genetics近几年已经找了几个作这个的AP faculty了。俺们division去年刚刚也找了一个新faculty作这个的。
你要继续作science，就要找新的underdeveloped field。眼光不要光放在大牛身上，
注意一下年轻的小牛，比如peoplem，oncogene这些人在干什么。
大牛的弟子无数，你得跟师兄师姐们竞争。如果投到小牛门下，你说不定是开山大弟子
，前景广阔。
这种东西其实应该是你的mentor给你指导的。mentor不光是指导你做实验，也应该指导
你怎么develop science career.

【在 u*********1 的大作中提到】

: Then can you tell me which field is NOT crowded?

d*m2012-03-06 08:03

15 楼

跟小牛风险太高，炮灰or开山大弟子，全看人品造化了。

【在 M*****n 的大作中提到】

: 俺给你指个明路吧。
: 为什么说这个有点挤了，因为俺们这儿的human genetics近几年已经找了几个作这个的AP faculty了。俺们division去年刚刚也找了一个新faculty作这个的。
: 你要继续作science，就要找新的underdeveloped field。眼光不要光放在大牛身上，
: 注意一下年轻的小牛，比如peoplem，oncogene这些人在干什么。
: 大牛的弟子无数，你得跟师兄师姐们竞争。如果投到小牛门下，你说不定是开山大弟子
: ，前景广阔。
: 这种东西其实应该是你的mentor给你指导的。mentor不光是指导你做实验，也应该指导
: 你怎么develop science career.

M*n2012-03-06 08:03

16 楼

俺见到的小牛，都很成功啊。
找牛校的AP，还是比较好的选择。
当然你自己的造化，全在你自己手里了。如果你自己不用功，神仙也帮不了你。

【在 d********m 的大作中提到】

: 跟小牛风险太高，炮灰or开山大弟子，全看人品造化了。

u*12012-03-06 08:03

17 楼

我倒不一定想做science
只是觉得这涉及很多的sequencing/genomics/bioinformatics,一方面很有趣；另外好
像找工作（不管是学校还是industry）是不是比较有前景？
所以想接受这方面（sequencing/bioinformatics)的训练
另外我在烂校，老板MD-PHD的AP；但老板的老板是超级大牛
按照你的说法，什么方向都是人满为患，大家都不用做了。
而且我读了一些paper，现在published的各种疾病的whole-genome structural
variants的研究，比较靠谱的结果还仅仅是基于array CGH的成果；而不是next-gen sequencing，因为一方面next-gen sequencing还是比较贵的，做不了大规模;另外基于sequencing data的各种鉴定软件的结果根本都自相矛盾，还需要软件进一步的开发当然更重要的是测序技术本身的发展（比如更大的read length）
当然了，我上面说的估计牛人们早开始谋划了，只不过还没publish出来
个人想法，说的不对请指正

的AP faculty了。俺们division去年刚刚也找了一个新faculty作这个的。

【在 M*****n 的大作中提到】

M*n2012-03-06 08:03

18 楼

的确俺们division这个AP靠array分析CNV起家的，现在也开始做next-gen了,human
genetics的也在作CNV 和next-gen。
看来你是挺有眼光的，也许你有更好的idea,可以beat them.
good luck!

sequencing，因为一方面next-gen sequencing还是比较贵的，做不了大规模;另外基于
sequencing data的各种鉴定软件的结果根本都自相矛盾，还需要软件进一步的开发当
然更重要的是测序技术本身的发展（比如更大的read length）

【在 u*********1 的大作中提到】

: 我倒不一定想做science
: 只是觉得这涉及很多的sequencing/genomics/bioinformatics,一方面很有趣；另外好
: 像找工作（不管是学校还是industry）是不是比较有前景？
: 所以想接受这方面（sequencing/bioinformatics)的训练
: 另外我在烂校，老板MD-PHD的AP；但老板的老板是超级大牛
: 按照你的说法，什么方向都是人满为患，大家都不用做了。
: 而且我读了一些paper，现在published的各种疾病的whole-genome structural
: variants的研究，比较靠谱的结果还仅仅是基于array CGH的成果；而不是next-gen sequencing，因为一方面next-gen sequencing还是比较贵的，做不了大规模;另外基于sequencing data的各种鉴定软件的结果根本都自相矛盾，还需要软件进一步的开发当然更重要的是测序技术本身的发展（比如更大的read length）
: 当然了，我上面说的估计牛人们早开始谋划了，只不过还没publish出来
: 个人想法，说的不对请指正

n*72012-03-06 08:03

19 楼

确实，都在往sequencing上转，毕竟提供的resolution是不一样的
我知道一个lab刚投了一个基于sequencing的CNV detecting算法，杂志很好，羡慕嫉妒恨

sequencing，因为一方面next-gen sequencing还是比较贵的，做不了大规模;另外基于
sequencing data的各种鉴定软件的结果根本都自相矛盾，还需要软件进一步的开发当
然更重要的是测序技术本身的发展（比如更大的read length）

【在 u*********1 的大作中提到】

u*12012-03-06 08:03

20 楼

啥杂志？
CNS，还是nature genetics还是genome research？
我觉得问题是，CNV detecting的算法都基于不同的algorithm，没有一种algorithm是
完美的，最后的结果都相互冲突，一堆artifact

妒恨

【在 n******7 的大作中提到】

: 确实，都在往sequencing上转，毕竟提供的resolution是不一样的
: 我知道一个lab刚投了一个基于sequencing的CNV detecting算法，杂志很好，羡慕嫉妒恨
:
: sequencing，因为一方面next-gen sequencing还是比较贵的，做不了大规模;另外基于
: sequencing data的各种鉴定软件的结果根本都自相矛盾，还需要软件进一步的开发当
: 然更重要的是测序技术本身的发展（比如更大的read length）

M*n2012-03-06 08:03

21 楼

至少是NG.

【在 u*********1 的大作中提到】

: 啥杂志？
: CNS，还是nature genetics还是genome research？
: 我觉得问题是，CNV detecting的算法都基于不同的algorithm，没有一种algorithm是
: 完美的，最后的结果都相互冲突，一堆artifact
:
: 妒恨

m*c2012-03-06 08:03

22 楼

+1: matt hurles @ sanger

variation在disease（尤其是

【在 u*********1 的大作中提到】

: 如题。尤其是和disease相关的；研究strcutural variation/copy number variation在disease（尤其是
: neurological disease)相关的牛人有哪些？
: 我知道的一个是UW的Evan Eichler；一个是BCM的James Lupski
: 不晓得还有什么牛人？
: 另外不晓得大家对这个方向（medical genomics）的前景如何看的
: 谢谢！

p*n2012-03-06 08:03

23 楼

现在published的disease genome的CNV为啥都不靠谱？很多都很靠谱啊，很多都用了
independent的实验验证了。