How to compare three gene lists, each with expression value or relationship? - 未名空间MITBBS历史存档

国际科技财经博客移民网络热点娱乐民生时事公众号

Redian新闻

>未名空间

>Biology - 生物学

How to compare three gene lists, each with expression value or relationship?

How to compare three gene lists, each with expression value or relationship?# Biology - 生物学

z*r2012-10-09 07:10

1 楼

一个客户跟俺说的，一个只要$49，出厂价，裸机！不知道哪个山寨厂的，反正是国内的

T*g2012-10-09 07:10

2 楼

I have three lists of genes, the number of identity of genes are not exactly
same in each list. And each gene has it's own expresion value or
relationship. I would like to know which two lists with expression values
are closer or more similar. How can I get the answer? Which bioinformatic
tool can I use? Thanks.

c*l2012-10-09 07:10

3 楼

比起前两天ZTE的$30还要便宜？

内的

【在 z**r 的大作中提到】

: 一个客户跟俺说的，一个只要$49，出厂价，裸机！不知道哪个山寨厂的，反正是国内的

a*x2012-10-09 07:10

4 楼

可以把每个基因作为一个坐标轴，然后算3个点的距离吧。
如果基因不平权，就给对应的坐标乘以一个系数。

exactly

【在 T********g 的大作中提到】

: I have three lists of genes, the number of identity of genes are not exactly
: same in each list. And each gene has it's own expresion value or
: relationship. I would like to know which two lists with expression values
: are closer or more similar. How can I get the answer? Which bioinformatic
: tool can I use? Thanks.

d*g2012-10-09 07:10

5 楼

ZET $30没有Vitality $50 kit便宜。kit卖掉相当于-$20了

【在 c********l 的大作中提到】

: 比起前两天ZTE的$30还要便宜？
:
: 内的

T*g2012-10-09 07:10

6 楼

我统计不好，你讲的我不全懂。有没有现成的工具可以用？

z*r2012-10-09 07:10

7 楼

ZTE的那个是临时的，或者促销或者清仓啊，这个就是出厂价

【在 c********l 的大作中提到】

: 比起前两天ZTE的$30还要便宜？
:
: 内的

w*e2012-10-09 07:10

8 楼

exactly
Pearson correlation, spearman correlation

【在 T********g 的大作中提到】

f*52012-10-09 07:10

9 楼

they raised the bar this year. Trying to push 1000-rmb phone down to 700-rmb
.

【在 z**r 的大作中提到】

: ZTE的那个是临时的，或者促销或者清仓啊，这个就是出厂价

h*g2012-10-09 07:10

10 楼

A couple of R packages might be useful for you
OrderedList (in Bioconductor)
RankAggreg
Both packages work for the ranked list.

exactly

【在 T********g 的大作中提到】