怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙# Biology - 生物学
t*l
1 楼
不知道我的思路对不对，欢迎指点。
bioinfo推断出domain, 感觉是个transcription factor.
首先要找到这个transcription factor 的promoter,用CHIP-SEQ就可以。（之前可以用
GEL SHIFT确认这是一个DNA binding protein?有无必要）
但是就算CHIP-SEQ出来来结果，也只能说明这个PROTEIN是个DNA-BINDING PROTEIN，并
不能证明是一个transcription factor?
如果一个细胞endogenously 不表达这个transcription factor,然后我用一个VECTOR引
用，表达了，microarray出来发现gene expression 变化了。但是也不能只能这个是一
个transcription factor，只能说明这个protein对这些pathway有影响。
难道必须用生化的cell free system来证明？有没有什么实验能证明一个新的蛋白是
transcription factor?
bioinfo推断出domain, 感觉是个transcription factor.
首先要找到这个transcription factor 的promoter,用CHIP-SEQ就可以。（之前可以用
GEL SHIFT确认这是一个DNA binding protein?有无必要）
但是就算CHIP-SEQ出来来结果，也只能说明这个PROTEIN是个DNA-BINDING PROTEIN，并
不能证明是一个transcription factor?
如果一个细胞endogenously 不表达这个transcription factor,然后我用一个VECTOR引
用，表达了，microarray出来发现gene expression 变化了。但是也不能只能这个是一
个transcription factor，只能说明这个protein对这些pathway有影响。
难道必须用生化的cell free system来证明？有没有什么实验能证明一个新的蛋白是
transcription factor?