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图像荧光强度积分

图像荧光强度积分# Biology - 生物学

b*32012-12-02 08:12

1 楼

弱弱地问，想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来，然后进行粗略的量化比
较，请问什么软件可以最简单地实现？基本操作能否说明一下，imageJ应该可以，试了
两次没搞出来，请指教，谢谢

j*l2012-12-02 08:12

2 楼

如果用matlab最简单的是用tiffread读出原始数据，比如一个512x512 matrix，然后
sum up 所有pixel intensity，希望有用。

【在 b**********3 的大作中提到】

: 弱弱地问，想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来，然后进行粗略的量化比
: 较，请问什么软件可以最简单地实现？基本操作能否说明一下，imageJ应该可以，试了
: 两次没搞出来，请指教，谢谢

A*y2012-12-02 08:12

3 楼

Google imageJ western blot quantification...same procedure. You should use
a plate reader though to do it correctly.

【在 b**********3 的大作中提到】

Z*92012-12-02 08:12

4 楼

不知道你说的积分值得是强度总和不？如果是的话，可以用imagej或者FIJI和容易算出
来。
可以设一个threshold，然后算就可以了。可以在set measurement 那里设置你需要算
的参数，比如强度面积等

【在 b**********3 的大作中提到】

b*32012-12-02 08:12

5 楼

谢谢楼上各位，今晚再试试matlab和imagej

S*s2012-12-02 08:12

6 楼

最近发现PE出的volocity很好用。
一般买荧光显微镜自带的，需要买license.后来发现他们提供free demo，除了不能输
出live image的video之外，其他功能都有。
免费注册得到unlock code后即可使用，功能挺强大。
其中就可measure 荧光强度，有各种线条，形状可选(see picture for ref.)。
http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v

【在 b**********3 的大作中提到】

s*j2012-12-02 08:12

7 楼

这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.

【在 S*********s 的大作中提到】

: 最近发现PE出的volocity很好用。
: 一般买荧光显微镜自带的，需要买license.后来发现他们提供free demo，除了不能输
: 出live image的video之外，其他功能都有。
: 免费注册得到unlock code后即可使用，功能挺强大。
: 其中就可measure 荧光强度，有各种线条，形状可选(see picture for ref.)。
: http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v

S*s2012-12-02 08:12

8 楼

我比较挫，改天试试看
可以算time course吗？

【在 s*****j 的大作中提到】

: 这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.

s*j2012-12-02 08:12

9 楼

什么都能算. 就是得花工夫学.
你要是用 Volocity 用得舒服的话, 就接着用吧.

【在 S*********s 的大作中提到】

: 我比较挫，改天试试看
: 可以算time course吗？