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急问QPCR引物efficiency在不同细胞系怎么不一样?
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急问QPCR引物efficiency在不同细胞系怎么不一样?# Biology - 生物学
w*e
1
还是说没offer的就不给消息了?
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H*1
2
小弟设计了一些primer,用来做RT-QPCR,检测几个基因的mRNA在WT和KD细胞的变化。
设计好了primer,小弟先在WT和KO细胞测试引物的efficiency。
小弟把cDNA稀释成1:5,1:10,1:20,1:40,然后做QPCR,计算efficiency。
结果发现同一个引物,在两个细胞系的efficiency居然不同。
请教这是为什么?
着急。
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s*a
3
去年十月onsite的目前还没给我消息,也没拒信

【在 w***e 的大作中提到】
: 还是说没offer的就不给消息了?
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h*y
4
First, you dilution range is not big enough (8x) to get an accurate estimate
of the PCR efficiency.
Second, your samples are different, even though they are all cDNA. Keep in
mind that they come from different cells.

【在 H**1 的大作中提到】
: 小弟设计了一些primer,用来做RT-QPCR,检测几个基因的mRNA在WT和KD细胞的变化。
: 设计好了primer,小弟先在WT和KO细胞测试引物的efficiency。
: 小弟把cDNA稀释成1:5,1:10,1:20,1:40,然后做QPCR,计算efficiency。
: 结果发现同一个引物,在两个细胞系的efficiency居然不同。
: 请教这是为什么?
: 着急。

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w*x
5
这个公司太搞了。是不是发了邮件,进了你的垃圾箱里?

【在 s**a 的大作中提到】
: 去年十月onsite的目前还没给我消息,也没拒信
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A*y
6
RT-PCR linearity is 5 fold dilution for 5 times i.e. 1/5, 1/25, 1/125, 1/625
, 1/(625*5). There is a possibility that your target mRNA fall out of you
linear range due to different in absolute mRNA copies.

【在 H**1 的大作中提到】
: 小弟设计了一些primer,用来做RT-QPCR,检测几个基因的mRNA在WT和KD细胞的变化。
: 设计好了primer,小弟先在WT和KO细胞测试引物的efficiency。
: 小弟把cDNA稀释成1:5,1:10,1:20,1:40,然后做QPCR,计算efficiency。
: 结果发现同一个引物,在两个细胞系的efficiency居然不同。
: 请教这是为什么?
: 着急。

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f*h
7
我的是今年一月份面的,followup的Email从HR到HM都是音信全无的。。

【在 w**x 的大作中提到】
: 这个公司太搞了。是不是发了邮件,进了你的垃圾箱里?
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