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少量细胞PCR方法请教
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少量细胞PCR方法请教# Biology - 生物学
h*d
1
Freedom这个季度有5% in airline, 不知道用来share US airways 的miles 算不算?
有大牛知道吗?
谢谢!
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b*g
2
马上要海归,但是手头的房子是个头疼的事情
3年多前买的房子,现在找了一个Agent来看了,建议Listing的价格比我的贷款余额还
少5000$.
估计实际成交价格比这更低了。
老婆还想留着这房子,认为卖了亏大了。但是出租的话每个月还要亏损500块左右。而
且在国内也不好操作.
我的选择是卖掉. 觉得自己卖不划算,除了要倒找银行钱外,还要付agent fee什么的
。所以在考虑Short Sell。 如果版上各位有什么建议,或者知道Short Sell如果操作
,请指点。多谢。
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f*g
3
要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.
请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?
谢谢
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z*n
4
只能等待小白鼠实验报告了
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h*n
5
是不是一开始short sale的话,你就不用付月供了,白住到卖掉或你走人或银行
forclosure.
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i*0
6
你有email么?我可以给你一个protocol。
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f*s
7
应该是point charge吧,如果是肯定不算,我是等报消息,实在不行就准备用神卡
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c*1
8
Yes,find a agent.short sell is best
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w*d
9
我也想要,请给也发一份好吗?
多谢!
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z*i
10
应该是不算的 是points.com charge的
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D*a
11
你的pcr产物要干什么?
我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。
曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。
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h*z
12
请问定一张中美往返票费用是40(phone) + 50(processing fee) = 90, 还是还有别的
费用?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

【在 z*******i 的大作中提到】
: 应该是不算的 是points.com charge的
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l*y
13
这个数量的细胞pcr不难,简单点的用epicentre的quickextract solution,泡泡细胞就
可以直接用来pcr

【在 f******g 的大作中提到】
: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.
: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?
: 谢谢

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h*z
14
昨天买的,写的是 point us air miles

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

【在 z*******i 的大作中提到】
: 应该是不算的 是points.com charge的
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s*2
15
genotyping时用的细胞数大概是什么数量级的?没做过,请教一下。

【在 D*a 的大作中提到】
: 你的pcr产物要干什么?
: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。
: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。

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l*i
16
这个算还是不算?

【在 h**z 的大作中提到】
: 昨天买的,写的是 point us air miles
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

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D*a
17
一片耳朵洞,消化以后还有一大片,肉眼看不出跟消化前有什么区别。
以前用老鼠尾巴,也差不多。

【在 s**2 的大作中提到】
: genotyping时用的细胞数大概是什么数量级的?没做过,请教一下。
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h*d
18
thanks.

【在 h**z 的大作中提到】
: 昨天买的,写的是 point us air miles
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

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f*g
19
测序,

【在 D*a 的大作中提到】
: 你的pcr产物要干什么?
: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。
: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。

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D*0
20
Confirmed NO.
Got my Freedom statement today, "point us air miles" doesn't count as 5%.
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f*g
21
谢谢了

胞就

【在 l***y 的大作中提到】
: 这个数量的细胞pcr不难,简单点的用epicentre的quickextract solution,泡泡细胞就
: 可以直接用来pcr

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l*i
22
很不幸的消息, 只能用神卡了

【在 D*******0 的大作中提到】
: Confirmed NO.
: Got my Freedom statement today, "point us air miles" doesn't count as 5%.

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D*a
23
这回答,真简洁

【在 f******g 的大作中提到】
: 测序,
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z*i
24

如果能显示detail 想amex卡那样 就会看到17507377000LOYALTY
LOYALTY
1-877-999-6652
3708 AUSTIN CT
FLOWER MOUND
TX
75028-8702
UNITED STATES
查一下这个地址是points.com公司的

【在 h**z 的大作中提到】
: 昨天买的,写的是 point us air miles
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

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s*2
25
谢谢回答。还是估摸不出来大概多少细胞数目。

【在 D*a 的大作中提到】
: 一片耳朵洞,消化以后还有一大片,肉眼看不出跟消化前有什么区别。
: 以前用老鼠尾巴,也差不多。

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z*i
26

40应该是免的,因为没办法在网上订票。处理费免不了。剩下的就是燃油附加费了。

【在 h**z 的大作中提到】
: 请问定一张中美往返票费用是40(phone) + 50(processing fee) = 90, 还是还有别的
: 费用?
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7

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f*g
27
简洁,不简单

【在 D*a 的大作中提到】
: 这回答,真简洁
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D*a
28
我也不知道啊,你大概试试吧,反正不用太多。
如果细胞少,关键是别按protocol上那样加那么多液体,少加点别把dna稀释了。
我的经验是这东西也没有规定必须怎么样

【在 s**2 的大作中提到】
: 谢谢回答。还是估摸不出来大概多少细胞数目。
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f*g
29
能把你的试剂的配方或者catalog 发给我吗
谢谢

【在 D*a 的大作中提到】
: 你的pcr产物要干什么?
: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。
: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。

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D*a
30
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31538099.html
你的细胞少,少加点mix,减少一点digestion时间,比如2hours
先做做pcr 看看行不行。
pcr不行的话,一般是dna太稀了(mix加太多),或者digestion时间太长了。
用nested pcr测序
现在用的protocol是sigma Extract-N-Amp Tissue PCR Kit Catalog Numbers XNAT2,
XNAT2R
没测过序,但是pcr带挺漂亮的。想必配方也差不多。

【在 f******g 的大作中提到】
: 能把你的试剂的配方或者catalog 发给我吗
: 谢谢

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f*g
31


,

【在 D*a 的大作中提到】
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31538099.html
: 你的细胞少,少加点mix,减少一点digestion时间,比如2hours
: 先做做pcr 看看行不行。
: pcr不行的话,一般是dna太稀了(mix加太多),或者digestion时间太长了。
: 用nested pcr测序
: 现在用的protocol是sigma Extract-N-Amp Tissue PCR Kit Catalog Numbers XNAT2,
: XNAT2R
: 没测过序,但是pcr带挺漂亮的。想必配方也差不多。

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a*k
32
100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。
离心下细胞
加纯水20ul
用20ul枪头快速吹打20次
取2-5ul做PCR,20ul反应体系
PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cycles
Exo-SAP 30分钟,取5ul送测序。

【在 f******g 的大作中提到】
: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.
: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?
: 谢谢

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w*r
33
搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出
来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助

【在 f******g 的大作中提到】
: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.
: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?
: 谢谢

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f*g
34
谢谢,请问Exo-SAP什么意思?

率。

【在 a********k 的大作中提到】
: 100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。
: 离心下细胞
: 加纯水20ul
: 用20ul枪头快速吹打20次
: 取2-5ul做PCR,20ul反应体系
: PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cycles
: Exo-SAP 30分钟,取5ul送测序。

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f*g
35
in vivo筛选吗?
需要1k的条带吗?

【在 w*****r 的大作中提到】
: 搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出
: 来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助

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s*s
36
pcr purification用的酶。一般pcr好了以后懒得纯化就要测序
的,就要加这个

【在 f******g 的大作中提到】
: 谢谢,请问Exo-SAP什么意思?
:
: 率。

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s*s
37
杂带多的,用nested pcr. 大概就是先用外面一对引物p过,产物
纯化以后再用里面一对p

【在 w*****r 的大作中提到】
: 搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出
: 来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助

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f*g
38
谢谢

【在 s******s 的大作中提到】
: pcr purification用的酶。一般pcr好了以后懒得纯化就要测序
: 的,就要加这个

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a*a
39
这个好酷!
我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
不用跑胶的。
我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据
。做ddPCR的。貌似应该可以把。

率。

【在 a********k 的大作中提到】
: 100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。
: 离心下细胞
: 加纯水20ul
: 用20ul枪头快速吹打20次
: 取2-5ul做PCR,20ul反应体系
: PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cycles
: Exo-SAP 30分钟,取5ul送测序。

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f*g
40
有好结果,在这说一下,谢谢

【在 a******a 的大作中提到】
: 这个好酷!
: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
: 不用跑胶的。
: 我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据
: 。做ddPCR的。貌似应该可以把。
:
: 率。

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a*a
41
我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来
;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。
我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。
但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(
有没有建议?
另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有
什么好的protocol吗?

这个好酷!
我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
不用跑胶的。
我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据
。做ddPCR的。貌似应该可以把。
率。

【在 f******g 的大作中提到】
: 有好结果,在这说一下,谢谢
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r*g
42
加点水,一煮就行了
直接pcr
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a*k
43
我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。
基本类似方法
主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT
吹打破细胞
20uL加到clontech的EcoDry里面做RT
然后取4uL产物PCR

【在 a******a 的大作中提到】
: 这个好酷!
: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
: 不用跑胶的。
: 我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据
: 。做ddPCR的。貌似应该可以把。
:
: 率。

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a*k
44
病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR
如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时
100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。

【在 a******a 的大作中提到】
: 我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来
: ;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。
: 我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。
: 但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(
: 有没有建议?
: 另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有
: 什么好的protocol吗?
:
: 这个好酷!
: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。

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a*y
45
Phire direct PCR from Thermo
成功率高一点吧。普通taq可能被细胞里一些东西抑制。

【在 f******g 的大作中提到】
: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.
: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?
: 谢谢

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f*g
46
谢谢。
我这两天正在试quickExtraction solution 呢。
估计下周能看到结果

【在 a******a 的大作中提到】
: 我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来
: ;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。
: 我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。
: 但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(
: 有没有建议?
: 另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有
: 什么好的protocol吗?
:
: 这个好酷!
: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。

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f*g
47
谢谢

【在 a********k 的大作中提到】
: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。
: 基本类似方法
: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT
: 吹打破细胞
: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT
: 然后取4uL产物PCR

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f*g
48
谢谢

【在 a***y 的大作中提到】
: Phire direct PCR from Thermo
: 成功率高一点吧。普通taq可能被细胞里一些东西抑制。

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D*a
49
那不就是我那个方子

【在 a********k 的大作中提到】
: 病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR
: 如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时
: 100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。

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a*a
50
谢谢;)收藏了!

【在 a********k 的大作中提到】
: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。
: 基本类似方法
: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT
: 吹打破细胞
: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT
: 然后取4uL产物PCR

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a*a
51
像这些直接水解细胞用来做PCR的,样品稳定程度怎么样?caspases应该很容易被激活
分解掉DNA吧?
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G*a
52
95C人类细胞里的酶基本上都死翘翘了吧?

【在 a******a 的大作中提到】
: 像这些直接水解细胞用来做PCR的,样品稳定程度怎么样?caspases应该很容易被激活
: 分解掉DNA吧?

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a*k
53
记得大多数步骤冰上操作。。。

【在 a******a 的大作中提到】
: 谢谢;)收藏了!
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d*i
54

你好牛啊!这种方法稳定性如何?
96well的细胞是不是就太多了,一直想怎么样直接从96 well取细胞做realtime。现在
都是用24 well抽屉RNA,然后再做realtime。

【在 a********k 的大作中提到】
: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。
: 基本类似方法
: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT
: 吹打破细胞
: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT
: 然后取4uL产物PCR

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a*a
55
我做了一些,水解细胞,溶液直接加入pcr系统去。结果发现出现的都是假阳性信号。
当然我是读取taqman荧光信号来衡量pcr结果的,不是跑胶。
解释是,nucleases直接切掉probe上的fluorophores,所以出现的荧光信号都是假阳性。
那么对我来说,我这个系统(依靠读取荧光信号来判断pcr结果的)就最好先加tris
buffer和proteanse K来除掉nucleases,再水煮一下样品灭火protease K或者其他的酶
。之后加入PCR系统。
看看怎么样,这个方案可好?

【在 a********k 的大作中提到】
: 病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR
: 如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时
: 100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。

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