少量细胞PCR方法请教# Biology - 生物学h*d2014-03-13 07:031 楼Freedom这个季度有5% in airline, 不知道用来share US airways 的miles 算不算?有大牛知道吗?谢谢!
b*g2014-03-13 07:032 楼马上要海归,但是手头的房子是个头疼的事情3年多前买的房子,现在找了一个Agent来看了,建议Listing的价格比我的贷款余额还少5000$.估计实际成交价格比这更低了。老婆还想留着这房子,认为卖了亏大了。但是出租的话每个月还要亏损500块左右。而且在国内也不好操作.我的选择是卖掉. 觉得自己卖不划算,除了要倒找银行钱外,还要付agent fee什么的。所以在考虑Short Sell。 如果版上各位有什么建议,或者知道Short Sell如果操作,请指点。多谢。
h*z2014-03-13 07:0312 楼请问定一张中美往返票费用是40(phone) + 50(processing fee) = 90, 还是还有别的费用?★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7【在 z*******i 的大作中提到】: 应该是不算的 是points.com charge的
l*y2014-03-13 07:0313 楼这个数量的细胞pcr不难,简单点的用epicentre的quickextract solution,泡泡细胞就可以直接用来pcr【在 f******g 的大作中提到】: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?: 谢谢
h*z2014-03-13 07:0314 楼昨天买的,写的是 point us air miles★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7【在 z*******i 的大作中提到】: 应该是不算的 是points.com charge的
s*22014-03-13 07:0315 楼genotyping时用的细胞数大概是什么数量级的?没做过,请教一下。【在 D*a 的大作中提到】: 你的pcr产物要干什么?: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。
l*i2014-03-13 07:0316 楼这个算还是不算?【在 h**z 的大作中提到】: 昨天买的,写的是 point us air miles: : ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
D*a2014-03-13 07:0317 楼一片耳朵洞,消化以后还有一大片,肉眼看不出跟消化前有什么区别。以前用老鼠尾巴,也差不多。【在 s**2 的大作中提到】: genotyping时用的细胞数大概是什么数量级的?没做过,请教一下。
h*d2014-03-13 07:0318 楼thanks.【在 h**z 的大作中提到】: 昨天买的,写的是 point us air miles: : ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
f*g2014-03-13 07:0319 楼测序,【在 D*a 的大作中提到】: 你的pcr产物要干什么?: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。
D*02014-03-13 07:0320 楼Confirmed NO.Got my Freedom statement today, "point us air miles" doesn't count as 5%.
f*g2014-03-13 07:0321 楼谢谢了胞就【在 l***y 的大作中提到】: 这个数量的细胞pcr不难,简单点的用epicentre的quickextract solution,泡泡细胞就: 可以直接用来pcr
l*i2014-03-13 07:0322 楼很不幸的消息, 只能用神卡了【在 D*******0 的大作中提到】: Confirmed NO.: Got my Freedom statement today, "point us air miles" doesn't count as 5%.
z*i2014-03-13 07:0324 楼如果能显示detail 想amex卡那样 就会看到17507377000LOYALTYLOYALTY1-877-999-66523708 AUSTIN CTFLOWER MOUNDTX75028-8702UNITED STATES查一下这个地址是points.com公司的【在 h**z 的大作中提到】: 昨天买的,写的是 point us air miles: : ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
s*22014-03-13 07:0325 楼谢谢回答。还是估摸不出来大概多少细胞数目。【在 D*a 的大作中提到】: 一片耳朵洞,消化以后还有一大片,肉眼看不出跟消化前有什么区别。: 以前用老鼠尾巴,也差不多。
z*i2014-03-13 07:0326 楼40应该是免的,因为没办法在网上订票。处理费免不了。剩下的就是燃油附加费了。【在 h**z 的大作中提到】: 请问定一张中美往返票费用是40(phone) + 50(processing fee) = 90, 还是还有别的: 费用?: : ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
D*a2014-03-13 07:0328 楼我也不知道啊,你大概试试吧,反正不用太多。如果细胞少,关键是别按protocol上那样加那么多液体,少加点别把dna稀释了。我的经验是这东西也没有规定必须怎么样【在 s**2 的大作中提到】: 谢谢回答。还是估摸不出来大概多少细胞数目。
f*g2014-03-13 07:0329 楼能把你的试剂的配方或者catalog 发给我吗谢谢【在 D*a 的大作中提到】: 你的pcr产物要干什么?: 我们genotype都不提dna,化化细胞就行了。: 曾经用genotype粗消化的dna做过测序,nested pcr,很干净。
D*a2014-03-13 07:0330 楼http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31538099.html你的细胞少,少加点mix,减少一点digestion时间,比如2hours先做做pcr 看看行不行。pcr不行的话,一般是dna太稀了(mix加太多),或者digestion时间太长了。用nested pcr测序现在用的protocol是sigma Extract-N-Amp Tissue PCR Kit Catalog Numbers XNAT2,XNAT2R没测过序,但是pcr带挺漂亮的。想必配方也差不多。【在 f******g 的大作中提到】: 能把你的试剂的配方或者catalog 发给我吗: 谢谢
f*g2014-03-13 07:0331 楼谢,【在 D*a 的大作中提到】: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31538099.html: 你的细胞少,少加点mix,减少一点digestion时间,比如2hours: 先做做pcr 看看行不行。: pcr不行的话,一般是dna太稀了(mix加太多),或者digestion时间太长了。: 用nested pcr测序: 现在用的protocol是sigma Extract-N-Amp Tissue PCR Kit Catalog Numbers XNAT2,: XNAT2R: 没测过序,但是pcr带挺漂亮的。想必配方也差不多。
a*k2014-03-13 07:0332 楼100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。离心下细胞加纯水20ul用20ul枪头快速吹打20次取2-5ul做PCR,20ul反应体系PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cyclesExo-SAP 30分钟,取5ul送测序。【在 f******g 的大作中提到】: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?: 谢谢
w*r2014-03-13 07:0333 楼搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助【在 f******g 的大作中提到】: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?: 谢谢
f*g2014-03-13 07:0334 楼谢谢,请问Exo-SAP什么意思?率。【在 a********k 的大作中提到】: 100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。: 离心下细胞: 加纯水20ul: 用20ul枪头快速吹打20次: 取2-5ul做PCR,20ul反应体系: PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cycles: Exo-SAP 30分钟,取5ul送测序。
f*g2014-03-13 07:0335 楼in vivo筛选吗?需要1k的条带吗?【在 w*****r 的大作中提到】: 搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出: 来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助
s*s2014-03-13 07:0336 楼pcr purification用的酶。一般pcr好了以后懒得纯化就要测序的,就要加这个【在 f******g 的大作中提到】: 谢谢,请问Exo-SAP什么意思?: : 率。
s*s2014-03-13 07:0337 楼杂带多的,用nested pcr. 大概就是先用外面一对引物p过,产物纯化以后再用里面一对p【在 w*****r 的大作中提到】: 搭车问PCR的问题,干细胞克隆筛选,几百个细胞,Viagen DirectPCR Lysis,只能P出: 来几百bp的片段,1kb以上的PCR就是各种杂带,乙醇沉淀纯化也没有帮助
a*a2014-03-13 07:0339 楼这个好酷!我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。不用跑胶的。我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据。做ddPCR的。貌似应该可以把。率。【在 a********k 的大作中提到】: 100细胞足够了,这是我的protocol,用genomic DNA把PCR条件摸好了基本100%成功率。: 离心下细胞: 加纯水20ul: 用20ul枪头快速吹打20次: 取2-5ul做PCR,20ul反应体系: PCR之前+95度五分钟,然后正常PCR的基础上+5cycles: Exo-SAP 30分钟,取5ul送测序。
f*g2014-03-13 07:0340 楼有好结果,在这说一下,谢谢【在 a******a 的大作中提到】: 这个好酷!: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。: 不用跑胶的。: 我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据: 。做ddPCR的。貌似应该可以把。: : 率。
a*a2014-03-13 07:0341 楼我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(有没有建议?另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有什么好的protocol吗?这个好酷!我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。不用跑胶的。我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据。做ddPCR的。貌似应该可以把。率。【在 f******g 的大作中提到】: 有好结果,在这说一下,谢谢
a*k2014-03-13 07:0343 楼我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。基本类似方法主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT吹打破细胞20uL加到clontech的EcoDry里面做RT然后取4uL产物PCR【在 a******a 的大作中提到】: 这个好酷!: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。: 不用跑胶的。: 我准备照你这个条件提取DNA,加REs消化下,然后就用来做PCR,看看能不能出来数据: 。做ddPCR的。貌似应该可以把。: : 率。
a*k2014-03-13 07:0344 楼病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。【在 a******a 的大作中提到】: 我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来: ;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。: 我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。: 但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(: 有没有建议?: 另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有: 什么好的protocol吗?: : 这个好酷!: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
a*y2014-03-13 07:0345 楼Phire direct PCR from Thermo成功率高一点吧。普通taq可能被细胞里一些东西抑制。【在 f******g 的大作中提到】: 要用少量细胞,大约1000-4000个细胞,来做PCR,片段大约200bp.: 请问大家有什么好的方法吗?好的kit能推荐一下吗?: 谢谢
f*g2014-03-13 07:0346 楼谢谢。我这两天正在试quickExtraction solution 呢。估计下周能看到结果【在 a******a 的大作中提到】: 我试了两次。一次结果和预计的差不多,10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来: ;另外一次就差些,有可能丢细胞比较明显。: 我的步骤就是:离心,加水20ul,p20枪头反复吸放20次,然后取3ul作pcr。: 但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 :(: 有没有建议?: 另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA,能否使用同样protocol?有人做过吗?有: 什么好的protocol吗?: : 这个好酷!: 我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据,应该可以吧。
f*g2014-03-13 07:0347 楼谢谢【在 a********k 的大作中提到】: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。: 基本类似方法: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT: 吹打破细胞: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT: 然后取4uL产物PCR
D*a2014-03-13 07:0349 楼那不就是我那个方子【在 a********k 的大作中提到】: 病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR: 如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时: 100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。
a*a2014-03-13 07:0350 楼谢谢;)收藏了!【在 a********k 的大作中提到】: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。: 基本类似方法: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT: 吹打破细胞: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT: 然后取4uL产物PCR
G*a2014-03-13 07:0352 楼95C人类细胞里的酶基本上都死翘翘了吧?【在 a******a 的大作中提到】: 像这些直接水解细胞用来做PCR的,样品稳定程度怎么样?caspases应该很容易被激活: 分解掉DNA吧?
d*i2014-03-13 07:0354 楼你好牛啊!这种方法稳定性如何?96well的细胞是不是就太多了,一直想怎么样直接从96 well取细胞做realtime。现在都是用24 well抽屉RNA,然后再做realtime。【在 a********k 的大作中提到】: 我其实还有20-100细胞做RT-PCR的protocol,基本成功率也是很高的。: 基本类似方法: 主要变化是19uLH2O+1uL RNaseOUT: 吹打破细胞: 20uL加到clontech的EcoDry里面做RT: 然后取4uL产物PCR
a*a2014-03-13 07:0355 楼我做了一些,水解细胞,溶液直接加入pcr系统去。结果发现出现的都是假阳性信号。当然我是读取taqman荧光信号来衡量pcr结果的,不是跑胶。解释是,nucleases直接切掉probe上的fluorophores,所以出现的荧光信号都是假阳性。那么对我来说,我这个系统(依靠读取荧光信号来判断pcr结果的)就最好先加trisbuffer和proteanse K来除掉nucleases,再水煮一下样品灭火protease K或者其他的酶。之后加入PCR系统。看看怎么样,这个方案可好?【在 a********k 的大作中提到】: 病理组织更简单,直接加水95度,然后做PCR: 如果细胞数量多,加Tris buffer+Protease K,消化1小时: 100个细胞如果你液体少的话就直接1uL放PCR里面,PCR系统很牛逼的。