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做mutation calling的时候，一般用什么genome做reference？

做mutation calling的时候，一般用什么genome做reference？# Biology - 生物学

j*e2014-06-24 07:06

1 楼

上周猫草大丰收，Mello每天吃一点。有时候我看她好像不得要领，总是咬咬而已，吃
不到，我脾气比较急，看不下去了，就亲自拔下几根喂给她。最近一周是每天早晚，拔
一小撮新鲜猫草放猫饭盒里。
可是怎么到现在还是没吐出半个毛球？
我家里都找遍了，有点近视，还戴眼镜找，也还是没有。
大概多久会吐毛毛啊？？

x*m2014-06-24 07:06

2 楼

我的sample是cancer patient的。用normal tissue还是hg16做reference？

A*R2014-06-24 07:06

3 楼

我家两猫都爱吃草，一个吃完了很快就吐，还吐在相同的地方，另一个从不吐，好像BB
里有拉出来，大概不一定所有的猫都吐吧。不一定对，但他从没吐过毛。

s*x2014-06-24 07:06

4 楼

hg16?
at least hg19 and there is a version used by 1000Genome

x*u2014-06-24 07:06

5 楼

"我家里都找遍了，有点近视，还戴眼镜找，也还是没有。"
hahaha

x*d2014-06-24 07:06

6 楼

比较稳妥的是nomral tissue和cancer patient都用hg19做reference，然后在cancer
patients里面的mutation排除掉normal tissue里面的mutation

p*f2014-06-24 07:06

7 楼

不一定都吐。还有通过排便出来的。猫草的作用就是让毛毛出来。至于从上还是从下就
因猫而异了。

p*12014-06-24 07:06

8 楼

是这样的，我家两王八蛋就是一个吐，一个拉，拉的那个拉毛的时候经常会便秘，要使
劲用力才能拉出来，所以有时候会掺和着几滴鲜血，我还为此捧着热乎乎的那佗宝贝去
见VET,被it 们嘲笑。。。

BB

【在 A*********R 的大作中提到】

: 我家两猫都爱吃草，一个吃完了很快就吐，还吐在相同的地方，另一个从不吐，好像BB
: 里有拉出来，大概不一定所有的猫都吐吧。不一定对，但他从没吐过毛。

j*e2014-06-24 07:06

9 楼

原来是这样，看来我家的是从下的是了。。。恶。。。

【在 p********f 的大作中提到】

: 不一定都吐。还有通过排便出来的。猫草的作用就是让毛毛出来。至于从上还是从下就
: 因猫而异了。

j*e2014-06-24 07:06

10 楼

这么凄惨。。。你真可爱@@
开来还是吐的踏实啊

【在 p********1 的大作中提到】

: 是这样的，我家两王八蛋就是一个吐，一个拉，拉的那个拉毛的时候经常会便秘，要使
: 劲用力才能拉出来，所以有时候会掺和着几滴鲜血，我还为此捧着热乎乎的那佗宝贝去
: 见VET,被it 们嘲笑。。。
:
: BB

b*i2014-06-24 07:06

11 楼

有的拉出来
话说上几天笨笨当我面把3寸长的金属+塑料丝给吞进去了（软的，比棉线硬）
我就玩命给他吃猫草
结果都拉出来了，一点没吐
另外塑廖+金属丝也出来了
让我长吁一口气

【在 j*****e 的大作中提到】

: 上周猫草大丰收，Mello每天吃一点。有时候我看她好像不得要领，总是咬咬而已，吃
: 不到，我脾气比较急，看不下去了，就亲自拔下几根喂给她。最近一周是每天早晚，拔
: 一小撮新鲜猫草放猫饭盒里。
: 可是怎么到现在还是没吐出半个毛球？
: 我家里都找遍了，有点近视，还戴眼镜找，也还是没有。
: 大概多久会吐毛毛啊？？

i*i2014-06-24 07:06

12 楼

神胃

【在 b********i 的大作中提到】

: 有的拉出来
: 话说上几天笨笨当我面把3寸长的金属+塑料丝给吞进去了（软的，比棉线硬）
: 我就玩命给他吃猫草
: 结果都拉出来了，一点没吐
: 另外塑廖+金属丝也出来了
: 让我长吁一口气

m*h2014-06-24 07:06

13 楼

not every cat has hairball!

【在 j*****e 的大作中提到】

j*e2014-06-24 07:06

14 楼

这个神了……

【在 b********i 的大作中提到】

T*h2014-06-24 07:06

15 楼

you are right.
我朋友有个猫，从没有吃过化毛膏，也不吃草，6岁了从没有得过hairball.

【在 m***h 的大作中提到】

: not every cat has hairball!

b*i2014-06-24 07:06

16 楼

what "shen le"?

【在 j*****e 的大作中提到】

: 这个神了……

j*e2014-06-24 07:06

17 楼

"塑廖+金属丝也出来了"
强大啊！金属丝啊！

【在 b********i 的大作中提到】

: what "shen le"?

i*p2014-06-24 07:06

18 楼

@@ 3寸长。。。这个吓人

【在 b********i 的大作中提到】

x*n2014-06-24 07:06

19 楼

寒。。。
vet 可能也见怪不怪了。

【在 p********1 的大作中提到】

b*i2014-06-24 07:06

20 楼

没有那么玄乎吧？
3寸长很长了么？
可能你们以为是很硬的那种
其实比较软的
有点像圣诞树上挂的有金属光泽的穗子的一根
里面塑料外面镀金属
可怜我自打他吃进去后就天天外面拔草回来给他吃
回来要把草洗得非常干净
因为怕有弓形虫
然后每次他一拉粑粑我就高兴
戴手套一点一点掰开了看有没有那个穗子
计划着如果1周内找不到就去看兽医了
第一、二天都是草，基本上是整根，
然后里面又有一团一团的毛球
第三天终于发现那个穗子出来了
不过表面的金属已经没有了
估计是被腐蚀然后吸收了。。。
就剩里面熟料条
我确定是那个穗子，因为一拉拉不断，呈透明状，，断了之后打卷
我够有科研精神吧
不过还是挺悬的

【在 i*****p 的大作中提到】

: @@ 3寸长。。。这个吓人

j*e2014-06-24 07:06

21 楼

这么一解释，更加佩服你了。。。
你们的猫草就是外面普通的草吗？

【在 b********i 的大作中提到】

: 没有那么玄乎吧？
: 3寸长很长了么？
: 可能你们以为是很硬的那种
: 其实比较软的
: 有点像圣诞树上挂的有金属光泽的穗子的一根
: 里面塑料外面镀金属
: 可怜我自打他吃进去后就天天外面拔草回来给他吃
: 回来要把草洗得非常干净
: 因为怕有弓形虫
: 然后每次他一拉粑粑我就高兴

c*e2014-06-24 07:06

22 楼

哈哈哈

【在 p********1 的大作中提到】