反转录起始的rna量不相同,可以比较内参做qpcr分析吗?# Biology - 生物学n*32014-06-26 07:061 楼qPCR做的比较少,没有经验,求高人指点。我现在有实验组和对照两个样品,反转录起始的rna量不相同,qpcr出来的结果内参和靶基因的ct, 可以比较吗?如何比较
m*f2014-06-26 07:065 楼有时候即使用同样量的RNA做RT, 做出来的内参也是差别很大(同一个细胞,不同处理)。【在 L****T 的大作中提到】: bias会比较大,有时候这样做出来的结果会很难repeat。你可以尝试把RNA量多的那个: 样品dilute到和RNA量少的那个样品同样浓度去做RT。
s*y2014-06-26 07:066 楼关键看看内参的差别有多大。如果内参的量做出来差别不超过四倍的话我觉得是可以用的。另外,反转录起始的RNA量说明不了什么的,因为很多都是不能被oligo-dT反转录的东西(rRNA,tRNA, etc.)。【在 n****3 的大作中提到】: qPCR做的比较少,没有经验,求高人指点。: 我现在有实验组和对照两个样品,反转录起始的rna量不相同,qpcr出来的结果内参和: 靶基因的ct, 可以比较吗?如何比较
m*o2014-06-26 07:069 楼跟帖问个基础问题,大家不要见笑。RNA 做RT 的时候,一个mRNA分子就逆转出一个cDNA吗?还是逆转录酶可以无限的bindingRNA,得到很多cDNA?
K*R2014-06-26 07:0610 楼你觉得用oligo dt 好还是random primer好呢?【在 s******y 的大作中提到】: 关键看看内参的差别有多大。如果内参的量做出来差别不超过四倍的话我觉得是可以用: 的。: 另外,反转录起始的RNA量说明不了什么的,因为很多都是不能被oligo-dT反转录的东: 西(rRNA,tRNA, etc.)。
r*e2014-06-26 07:0611 楼同问这个问题。internal control不就是来主要control这个用于qPCR的cDNA的量的么?cDNA多,内参的值就高;cDNA少,内参的值就低。当然要保证cDNA在合理的范围内,不能太低也不能太高。只要在合理浓度范围内,请问用内参有什么问题?有啥bias?【在 n****3 的大作中提到】: qPCR做的比较少,没有经验,求高人指点。: 我现在有实验组和对照两个样品,反转录起始的rna量不相同,qpcr出来的结果内参和: 靶基因的ct, 可以比较吗?如何比较