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吐槽一个bioinformatics老板

吐槽一个bioinformatics老板# Biology - 生物学

w*02014-09-12 07:09

1 楼

我work full-time，同时take part-time MBA。On H-1B with I-485 pending，暂时不
想启用EAD。目前找到一个part-time internship，与MBA很相关，但与我full-time工
作关系不大。如何作这个intern是合法的呢？谢谢

O*s2014-09-12 07:09

2 楼

老板自称是做translational bioinformatics的，
其phd也算是正宗machine learning出身的，
但是研究思路上真是不敢恭维，
做完一个database，上线，发个小文章，
再继续做另外一个生物信息database,做个网站，上线，发个文章；
已经拿这种思路申请了两次R01了，结果都没中（中了才怪呢！）
这种研究思路就是打浆糊，除了catalog别人的发现，毫无创新；
最近还要搞drug repurposing,
也是利用前人发的paper，做text mining, 在link到某些drug，
看看能不能把同一类的drug combine起来inhibit一个circuit，
做inhibition modeling,
这种研究思路非常危险，第一，你是假设以前的paper都是正确的；
第二，做modeling纯属意淫，没人去验证，没人会买账。
得赶紧准备走人了，这种老板真的伤不起，
在这种funding的气候下，我估计老板也早晚会变成泥菩萨
指望DoD给的仨瓜俩枣撑不了太久

c*e2014-09-12 07:09

3 楼

整个translational bioinformatics都是打酱油的。

【在 O******s 的大作中提到】

: 老板自称是做translational bioinformatics的，
: 其phd也算是正宗machine learning出身的，
: 但是研究思路上真是不敢恭维，
: 做完一个database，上线，发个小文章，
: 再继续做另外一个生物信息database,做个网站，上线，发个文章；
: 已经拿这种思路申请了两次R01了，结果都没中（中了才怪呢！）
: 这种研究思路就是打浆糊，除了catalog别人的发现，毫无创新；
: 最近还要搞drug repurposing,
: 也是利用前人发的paper，做text mining, 在link到某些drug，
: 看看能不能把同一类的drug combine起来inhibit一个circuit，

m*a2014-09-12 07:09

4 楼

那你来谈谈能搞什么思路？
除非有能力搞到牛逼实验室合作或者自己弄实验验证，大部分bioinformatics都是酱油
文章吧。

o*r2014-09-12 07:09

5 楼

bioinformatics如果没有牛到有人替你生成数据并且验证你的预测，也就打打酱油，分
一杯羹的命。

K*42014-09-12 07:09

6 楼

方法学还好了，比如blast, muscle, 什么的，都是有非常有意义的工作
这样的酱油是不好打的

【在 o********r 的大作中提到】

: bioinformatics如果没有牛到有人替你生成数据并且验证你的预测，也就打打酱油，分
: 一杯羹的命。

o*r2014-09-12 07:09

7 楼

做方法的也需要好的数据来提供思路以及实验验证，没有这些support也就是纸上谈兵
：通过模拟数据来说我的方法多好（问题是你知道自己方法的假设，如果设计出来的模
拟数据还不是最好的那就洗洗睡吧），然后最多在一个实际数据中运行，得到一些已知
的东西（说我的方法是有用的），然后有一点以前没有报道过的东西，说这个是新发现
（没有实验验证的话谁知道你那个是不是假阳性）。这种没有实验支持的方法也就是酱
油文，发表就是结束，基本没啥人会用。

【在 K**4 的大作中提到】

: 方法学还好了，比如blast, muscle, 什么的，都是有非常有意义的工作
: 这样的酱油是不好打的

M*P2014-09-12 07:09

8 楼

你不能指望所有人都跟li heng一样啊。

【在 o********r 的大作中提到】

: 做方法的也需要好的数据来提供思路以及实验验证，没有这些support也就是纸上谈兵
: ：通过模拟数据来说我的方法多好（问题是你知道自己方法的假设，如果设计出来的模
: 拟数据还不是最好的那就洗洗睡吧），然后最多在一个实际数据中运行，得到一些已知
: 的东西（说我的方法是有用的），然后有一点以前没有报道过的东西，说这个是新发现
: （没有实验验证的话谁知道你那个是不是假阳性）。这种没有实验支持的方法也就是酱
: 油文，发表就是结束，基本没啥人会用。

O*s2014-09-12 07:09

9 楼

好几天没来发现居然有几个回帖。
我感兴趣的生物信息研究方向是针对某个生物问题开发一些研究方法，算法或工具软件
出来；
对于那种针对NGS 数据cherry picking, 分析编故事的，我觉得大部分人就是自欺欺
人，然后去骗grant；这种所谓的研究对科学进步没什么作用，反而浪费了很多资源

【在 m********a 的大作中提到】

: 那你来谈谈能搞什么思路？
: 除非有能力搞到牛逼实验室合作或者自己弄实验验证，大部分bioinformatics都是酱油
: 文章吧。