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请教了解450k 甲基化芯片分析的朋友
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请教了解450k 甲基化芯片分析的朋友# Biology - 生物学
x*e
1
Illumina HumanMethylation 450K BeadChip kit (Illumina, San Diego, CA, USA)
查到一篇文章里面有个我感兴趣的基因甲基化位点(CpG 位于基因的 5 UTR), 但是我
按照文章给出的位置 (Chromsome N,position XXXXX,)去NCBI找,对应的却不是我
感兴趣的基因,相差200kb。我又找了另外几个文章中的甲基化位置,自己在NCBI上找
了找,还是对不上,不知道什么原因。 难道那篇文章参照不是NCBI的数据?还是NCBI
数据更新了?先谢了!
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a*r
2
先确认genome的assembly version, ncbi好像已经全面升级到hg38(GRCh38)了, 我猜
你的450K还是hg19的吧。
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x*e
3
的确如此,多谢多谢!

【在 a**r 的大作中提到】
: 先确认genome的assembly version, ncbi好像已经全面升级到hg38(GRCh38)了, 我猜
: 你的450K还是hg19的吧。

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