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RNA-seq样品量少,做扩增靠谱吗?
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RNA-seq样品量少,做扩增靠谱吗?# Biology - 生物学
w*d
1
RD 03/09/2011
这马上都三个月了
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c*7
2
哦也
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b*s
3
带荧光的细胞,估计最多只能拿到几百个。在国内做RNA-seq,国内小公司要求扩增一
下。
对结果影响大吗?
谢谢!
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r*e
4
冲进太空了!

【在 c*******7 的大作中提到】
: 哦也
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O*a
5
不就是 SMARTer Kit吗?
能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞,应该没问题吧。
RNA seq要测至少6个生物学重复。

【在 b******s 的大作中提到】
: 带荧光的细胞,估计最多只能拿到几百个。在国内做RNA-seq,国内小公司要求扩增一
: 下。
: 对结果影响大吗?
: 谢谢!

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b*s
6
实际中,大家都是每个样6个生物学重复?
这样做起来好贵啊。

【在 O**********a 的大作中提到】
: 不就是 SMARTer Kit吗?
: 能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞,应该没问题吧。
: RNA seq要测至少6个生物学重复。

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G*n
7
6 个sample是统计上结合coverage之后比较好的情况,虽然大家大多数目前还是1个或
者3个……

【在 b******s 的大作中提到】
: 实际中,大家都是每个样6个生物学重复?
: 这样做起来好贵啊。

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k*a
8
哪里说RNA-seq 要测至少6个生物学重复? reference please

【在 O**********a 的大作中提到】
: 不就是 SMARTer Kit吗?
: 能用来测单细胞到一千个细胞。你的情况是测几百个细胞,应该没问题吧。
: RNA seq要测至少6个生物学重复。

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s*s
10
竟然三个作者都认识,汗!
结论是,多replicate比deeper更cost effective,

【在 x***u 的大作中提到】
: RNA-seq differential expression studies: more sequence or more replication?
: Yuwen Liu,1,2 Jie Zhou,1,3 and Kevin P. White1,2,3,*
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3904521/

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