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endocytosis 调控因子
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endocytosis 调控因子# Biology - 生物学
F*P
1 楼
这应该是高中利率计算的数学题，可是我忘了怎么计算的了。以下例子是一个$200，
000的房子,为什么30年的贷款每个月还$959而不是$1927呢？1927=(200000*0.96)*1.
04375**30/30/12...
Home Price: $ 200，000
Down Payment: $ 8，000(4%)
A. Loan B. Rate* C. Payments
A. 30 year fixed B. % 4.375 C. $959/mo
A. 15 year fixed B. % 3.375 C. $1,361/mo
A. 5/1 ARM B. % 2.625 C. $771/mo
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f*o
2 楼
Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update This
Year
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B*v
3 楼
我在做一个细胞表面受体，想检测一下endocytosis对这个受体细胞表面的表达和下游
信号通路的影响。我的问题是有哪些蛋白positively或者negatively调控endocytosis
？没做过endocytosis。我想用siRNA或者inhibitor（如果有的话）改变endocytosis
baseline，然后再研究我这个受体的行为。谢谢。或者推荐几篇参考文献也行。
还有我不确定这个受体蛋白进入细胞是通过传统的endocytosis，那如何分辨其他的机
制呢，比如pinocytosis或者caveolae？
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b*d
4 楼
给你一个Online的Calculator:
http://www.bankrate.com/calculators/mortgages/mortgage-calculat

【在 F********P 的大作中提到】
: 这应该是高中利率计算的数学题，可是我忘了怎么计算的了。以下例子是一个$200，
: 000的房子,为什么30年的贷款每个月还$959而不是$1927呢？1927=(200000*0.96)*1.
: 04375**30/30/12...
: Home Price: $ 200，000
: Down Payment: $ 8，000(4%)
: A. Loan B. Rate* C. Payments
: A. 30 year fixed B. % 4.375 C. $959/mo
: A. 15 year fixed B. % 3.375 C. $1,361/mo
: A. 5/1 ARM B. % 2.625 C. $771/mo
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b*e
5 楼
索南又买不起

This

【在 f******o 的大作中提到】
: Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
: Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update This
: Year
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b*e
7 楼
excel里专门有个函数
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f*o
8 楼

你太小看这里的索南了

【在 b*****e 的大作中提到】
: 索南又买不起
:
: This
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B*v
9 楼
我觉得你是对的。我开始也想这么做，花了很多时间研究crispr screening，用什么样
的readout，合作者都找好了，但老板不同意这么搞，所以我现在只能逐个分子摸索着
往前做。不过我这个蛋白进入细胞的途径应该依赖于endocytosis machinery.

子。

【在 v********a 的大作中提到】
: 我觉得你的课题，首先需要确定目标分子entry pathway，然后再确定其中的关键因子。
: 建议阅读： http://e-collection.library.ethz.ch/eserv/eth:4533/eth-4533-02.pdf
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M*t
11 楼
啥游戏需要22个core？
主要看显卡，换这货能快5%么？
说搞点正经的事情么这货又不支持ECC，SMP，Large Memory
Virtuallization么还被阉割
就是骗骗人的
不如上2699v4，eBay上价格还便宜些

This

【在 f******o 的大作中提到】
: Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
: Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update This
: Year
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B*v
12 楼
再次感谢，你这个论文不错啊，尤其是前面针对virus entry对endocytosis的介绍部分
，对我很有用。哎，老板的话还得听。这是个硕士还是博士论文？

子。

【在 v********a 的大作中提到】
: 我觉得你的课题，首先需要确定目标分子entry pathway，然后再确定其中的关键因子。
: 建议阅读： http://e-collection.library.ethz.ch/eserv/eth:4533/eth-4533-02.pdf
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f*o
13 楼
同学们 索南买8core的 不是22core的 22core是拿来流口水的 不是拿来用的
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a*a
14 楼
试试KO dynamin?
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m*g
15 楼
这又要换主板了？

This

【在 f******o 的大作中提到】
: Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
: Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update This
: Year
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c*g
16 楼
Conventional endocytosis is clathrin dependent.Macropinocytosis needs actin
polymerization. You can differentiate these pathways by combinging knockdown
clathrin/caveolae and actin polymerization inhibitors.
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f*o
17 楼

必须的

【在 m**********g 的大作中提到】
: 这又要换主板了？
:
: This
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n*w
18 楼
You can also do a detergent-free preparation of caveolae using sodium
carbonate. Using Western blot to detect caveolin-1, clathrin light chain and
your protein to see where your protein is primarily located.
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d*0
19 楼
14nm的垃圾

：Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
：Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update
This Year
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v*a
20 楼

我也觉得不错。这个group的大头儿，在CNS（不包括子刊）的文章差不多30多篇吧，像
灌水一样。
博士学位论文答辩。

【在 B***v 的大作中提到】
: 再次感谢，你这个论文不错啊，尤其是前面针对virus entry对endocytosis的介绍部分
: ，对我很有用。哎，老板的话还得听。这是个硕士还是博士论文？
:
: 子。
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f*o
21 楼

Z390
牙膏要留点下次挤

【在 d*****0 的大作中提到】
: 14nm的垃圾
:
: ：Intel’s Flagship Coffee Lake-S 8 Core CPUs Arriving in September on Z390
: ：Refresh Platform – Skylake-X Here To Stay, Will Get 22 Core CPU Update
: This Year
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B*v
22 楼
原来是Ari Helenius 的PhD.
Ari Helenius 非常有reputation，以前读过他不少东西

【在 v********a 的大作中提到】
:
: 我也觉得不错。这个group的大头儿，在CNS（不包括子刊）的文章差不多30多篇吧，像
: 灌水一样。
: 博士学位论文答辩。
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E*e
23 楼
Knock down Rab5 or overexpress Rab5-S35N

endocytosis

【在 B***v 的大作中提到】
: 我在做一个细胞表面受体，想检测一下endocytosis对这个受体细胞表面的表达和下游
: 信号通路的影响。我的问题是有哪些蛋白positively或者negatively调控endocytosis
: ？没做过endocytosis。我想用siRNA或者inhibitor（如果有的话）改变endocytosis
: baseline，然后再研究我这个受体的行为。谢谢。或者推荐几篇参考文献也行。
: 还有我不确定这个受体蛋白进入细胞是通过传统的endocytosis，那如何分辨其他的机
: 制呢，比如pinocytosis或者caveolae？
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B*v
24 楼
是个好建议，我正在建一个list, 列出对endocytosis有重要影响的分子，单对这领域
并不熟
Clathrin
SCF (βTrCP)
Jak2
Protein tyrosine phosphatase-1B (PTP-1B)
Caveolin-1
Dynamin
...
这个snap shot不错
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19379701

【在 a****a 的大作中提到】
: 试试KO dynamin?
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B*v
25 楼
1. clathrin knockdown ---> clathrin dependent endocytosis
2. caveolin knockdown ---> Caveolae-dependent Endocytosis
3. actin polymerization inhibition ---> macropinocytosis
是这个逻辑吧？
actin polymerization inhibition不会影响1和2吗？

actin
knockdown

【在 c******g 的大作中提到】
: Conventional endocytosis is clathrin dependent.Macropinocytosis needs actin
: polymerization. You can differentiate these pathways by combinging knockdown
: clathrin/caveolae and actin polymerization inhibitors.
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B*v
26 楼
好建议，记下了。
"During vesicle uncoating, primary endocytic vesicles may acquire Rab5, a
small GTPase involved in transport to early endosomes and in early endosome
docking and fusion. Primary endocytic vesicles are targeted to and fuse with
early endosomes expressing phosphatidylinositol(3)-phosphate, PI(3)P, in a
process dependent on Rab5 effector proteins and early endosomal SNAREs."
我觉得抑制endocytosis相对简单。比较困难的是还想找到有哪些靶点，通过对其调节
可以增加endocytosis呢？

【在 E******e 的大作中提到】
: Knock down Rab5 or overexpress Rab5-S35N
:
: endocytosis
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B*v
27 楼
谢谢。有现成的protocol我可以照着做吗？
按你说的就是用生化的方法分离出caveolin-1 fraction和no caveolin-1 fraction (
clathrin)，然后western blot这些分子对吧。我分离过ER, nucleus, mitochondria,
fractionation还是挺tricky的。

and

【在 n***w 的大作中提到】
: You can also do a detergent-free preparation of caveolae using sodium
: carbonate. Using Western blot to detect caveolin-1, clathrin light chain and
: your protein to see where your protein is primarily located.
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n*w
28 楼
check this article for methods.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8621645
basically, if you have pellets from 10cm plates, resuspend the pellets in
500ul 500 mM sodium carbonate (pH 11), sonicate (3X/15 s). The lysate is
mixed with an equal volume of MES-buffered saline containing 90% sucrose and
centrifuged on discontinuous sucrose gradient (45%, 35% and 5%) for 16 h at
175,000 g and fractions will be collected for analysis.

,

【在 B***v 的大作中提到】
: 谢谢。有现成的protocol我可以照着做吗？
: 按你说的就是用生化的方法分离出caveolin-1 fraction和no caveolin-1 fraction (
: clathrin)，然后western blot这些分子对吧。我分离过ER, nucleus, mitochondria,
: fractionation还是挺tricky的。
:
: and
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c*g
29 楼
Actin polymerization 不会影响1，2

：1. clathrin knockdown ---> clathrin dependent endocytosis
：2. caveolin knockdown ---> Caveolae-dependent Endocytosis
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B*v
30 楼
actin/myosin inhibition对clathrin/caveolin coated vesicle的形成没有影响，但
是对这些vesicle的trafficking和early endosome fusion应该有影响吧？

【在 c******g 的大作中提到】
: Actin polymerization 不会影响1，2
:
: ：1. clathrin knockdown ---> clathrin dependent endocytosis
: ：2. caveolin knockdown ---> Caveolae-dependent Endocytosis
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