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请教如何用z-score计算foldchange?
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请教如何用z-score计算foldchange?# Biology - 生物学
v*v
1
锛00k, seems not that good?
need to make decision on monday, advice please
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Z*5
2
因为要比较不同测序平台、不同课题组来源的数据,需要对各个样品进行z-score转换
,才能进行比较。
目前计算p value,q value都没问题;但是还需要计算基因的foldchange来进一步过滤
掉差异不显著的基因。但是原数据肯定是不能进行直接的计算,那么z-score标准化后
,如何计算foldchange呢?
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t*k
3
你在哪个州?
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s*s
4
z-score都标准化了,哪来的fold change
【 在 Zifeng85 (Zifeng9527) 的大作中提到: 】
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b*2
5
有点高,可以去我的俱乐部查询当天的利率。

【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please

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G*n
6
你说的z-score是指对每一个sample,所有gene放一起进行z transform,相当于z-
score normalization。 如果是这样的话,你可以用这个每一个gene 的z值,作为表达
量,或者说是相对表达量。然后across sample做DE。
但是这个方法,不好,建议用别的cross-platform normalization
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k*o
7
如果你的 case 很好,在加州,绝对高了,以 Friday 为例。
不妨访问我俱乐部的利率以供参考。

【在 v***v 的大作中提到】
: 锛00k, seems not that good?
: need to make decision on monday, advice please

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v*v
8
多谢楼上几位。。。。
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