G*G
2 楼
问个用genetic variant or mutants for biomarker的问题
假设,你发现了一个variant,它的高表达表示癌症,低表达表示正常
但是如果没有发现这个variant,则无法预测。
那么,你怎么能把这个biomarker用在blind testing set中呢?
因为testing set是blind,可能出现这个marker根本就不存在这个病人中
也就是无法预测。但是有时候,不存在和低表达之间很难区分,就是0和0.0005的关系。
而且不同的样本这个threshold很难一样。有的样本0.5才是低表达,有的样本0.00005
才是低表达。
请问这个问题如何解决?
假设,你发现了一个variant,它的高表达表示癌症,低表达表示正常
但是如果没有发现这个variant,则无法预测。
那么,你怎么能把这个biomarker用在blind testing set中呢?
因为testing set是blind,可能出现这个marker根本就不存在这个病人中
也就是无法预测。但是有时候,不存在和低表达之间很难区分,就是0和0.0005的关系。
而且不同的样本这个threshold很难一样。有的样本0.5才是低表达,有的样本0.00005
才是低表达。
请问这个问题如何解决?
相关阅读
一只小鹿生在我家后院(加照片了在15楼)how long could G418 solution still be stable?求comsol 3.5a hotfix1 和patch的mac版为什么IF 的green channel 无一抗的negative control还有较强的SIGNAL大家的paper是自己寫還是老板寫?感觉没有希望了蛋白染色问题请问非美国公民,也没有绿卡RNA降解的问题harvard的光环真不是人戴的怎样除掉酶反应混合物里的自由ATP?zt急功近利和SCI害中国的一例:中国的科学投资迄今主要刺激外国经汗了个去,我的引物出啥问题了为什么IF 的green channel 无一抗的negative control还有较强的SIGNAL博士生在作研究的过程中到底是什么角色问个小问题,这个图用什么软件做的?Life Technologies 这个公司怎么样? (转载)裙带关系能给发文章带来便利么?GFP in situbaozi for paper help@_@