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bioinformatics的基本要求

bioinformatics的基本要求# Biology - 生物学

m*t2017-03-23 07:03

1 楼

以后不要都自称会bioinformatics，来提几个基本要求：
1，系统性的学习过编程，本科课程就不说了，研究生基本的编译器，计算机体系结构
，算法等都要修过；
2，要在课外自发的联系过很多编程，leetcode的中等难度题目要基本会
3，遇到一种新的语言，要能很快适应，读别人的code要比较轻松，要能re-run别人的
package
4，有一定的实习经历，能再Google，Facebook这种工业界一流公司实习过，最好能到
FB AI research，MSR或者Google Brain等最前沿实习过，不过这个要求比较高，是个
Plus；
上边是硬性要求
5，要有self motivation，要经常看文献，不管生物上的最新技术最新进展在NATURE等
，还是CS上，尤其一些前沿的进展，比如NIPS和ICLR上的最新论文，要了解
6，要有biological intuitive，能即使结合最近的技术进展，来提出新方法开创新领域
7，对科研要有兴趣，能自发一周70小时
如果有满足以上条件的bioinformatics的fresh PhD的要找postdoc，我能给介绍，保证
NIH标准，保证不用杀老鼠。

n*92017-03-23 07:03

2 楼

这个要求有点低啊，看招人要求，C++ 和JAVA至少5年经验吧，最好有linux内核开发经
验的，R，PYTHON，PERL，SAS也至少5年经验吧，JavaScript，ajax之类前端也是必须
的。数据库方面更是重要，关系数据库，和非关系数据库也都要5年以上经验，hadoop,
spark至少要7年经验，毕竟生物是高科技，马虎不得。
生物方面，细胞生物学，分子生物学，都是必须的，随申请还要交3页研究计划和3封推
荐信

e*o2017-03-23 07:03

3 楼

确实
应该设计过 1到2门主流编程语言
写过主流数据库
参与过big data 顶级项目的开发
生物方面要至少发过CNS 一作引用得上万吧
PS：LZ 能不装b么

hadoop,

【在 n*******9 的大作中提到】

: 这个要求有点低啊，看招人要求，C++ 和JAVA至少5年经验吧，最好有linux内核开发经
: 验的，R，PYTHON，PERL，SAS也至少5年经验吧，JavaScript，ajax之类前端也是必须
: 的。数据库方面更是重要，关系数据库，和非关系数据库也都要5年以上经验，hadoop,
: spark至少要7年经验，毕竟生物是高科技，马虎不得。
: 生物方面，细胞生物学，分子生物学，都是必须的，随申请还要交3页研究计划和3封推
: 荐信

s*y2017-03-23 07:03

4 楼

不装逼他估计能死
生物信息绝大部分都不是他说的那种，默认的就是跑pipeline的，会统计模型还会算法
的那叫computational biology，还得是牛学校的。烂校的基本上也就是和生物搀和在一
起的，完犊子。

【在 e*******o 的大作中提到】

: 确实
: 应该设计过 1到2门主流编程语言
: 写过主流数据库
: 参与过big data 顶级项目的开发
: 生物方面要至少发过CNS 一作引用得上万吧
: PS：LZ 能不装b么
:
: hadoop,

l*62017-03-23 07:03

5 楼

我一直认为 computational biology = bioinformatics
按wikipedia的定义：
Computational biology involves the development and application of data-
analytical and theoretical methods, mathematical modeling and computational
simulation techniques to the study of biological, behavioral, and social
systems
Bioinformatics is an interdisciplinary field that develops methods and
software tools for understanding biological data.
其实，不少人宣称自己会bioinformatics主要是想强调自己的计算和编程能力，能让公
司误会自己会开发算法那就更好了。

算法
在一

【在 s******y 的大作中提到】

: 不装逼他估计能死
: 生物信息绝大部分都不是他说的那种，默认的就是跑pipeline的，会统计模型还会算法
: 的那叫computational biology，还得是牛学校的。烂校的基本上也就是和生物搀和在一
: 起的，完犊子。

w*22017-03-23 07:03

6 楼

Bioinformatician应该成功设计过：
1.一种全新的操作系统
2.一种全新的CPU芯片
3.一种全新的商业模式
Bill Gates还凑合。

s*y2017-03-23 07:03

7 楼

盖茨直接挂两条啊，操作系统不是他原创的，他是收购人家的，不是他设计的
CPU更没他啥事儿
第三条勉强算
不过很多job description确实恨不得这样写，看着都蛋疼

【在 w********2 的大作中提到】

: Bioinformatician应该成功设计过：
: 1.一种全新的操作系统
: 2.一种全新的CPU芯片
: 3.一种全新的商业模式
: Bill Gates还凑合。

f*n2017-03-23 07:03

8 楼

嗯。这年头，一定要同时拿到诺贝尔医学奖，图灵奖，奥斯卡奖，不然都不好意思声称
自己是bioinformatician
具体筛选如下：
import zhuangbility
bioinformatician=[]
qianlao=[name, property1, property2, property3]
if (qianlao[1]='Nobel in Physiology or Medicine' and
###Means this qianlao is biology bigbull
qianlao[2]='Turing Award' and
###Means this qianlao is computing genius
qianlao[3]='Oscar' ):
###Means this qianlao has excellent performance skills to chui-niu-bi
bioinformatician.append(qianlao[0])

【在 m*********t 的大作中提到】

: 以后不要都自称会bioinformatics，来提几个基本要求：
: 1，系统性的学习过编程，本科课程就不说了，研究生基本的编译器，计算机体系结构
: ，算法等都要修过；
: 2，要在课外自发的联系过很多编程，leetcode的中等难度题目要基本会
: 3，遇到一种新的语言，要能很快适应，读别人的code要比较轻松，要能re-run别人的
: package
: 4，有一定的实习经历，能再Google，Facebook这种工业界一流公司实习过，最好能到
: FB AI research，MSR或者Google Brain等最前沿实习过，不过这个要求比较高，是个
: Plus；
: 上边是硬性要求

t*z2017-03-23 07:03

9 楼

盖茨曾在飞机上手写一个操作系统。看看你们，行吗？你们这样子还好意思自称
bioinformatician？

【在 s******y 的大作中提到】

: 盖茨直接挂两条啊，操作系统不是他原创的，他是收购人家的，不是他设计的
: CPU更没他啥事儿
: 第三条勉强算
: 不过很多job description确实恨不得这样写，看着都蛋疼

s*s2017-03-23 07:03

10 楼

点赞，啊哈哈

【在 e*******o 的大作中提到】

c*e2017-03-23 07:03

11 楼

要进化到COMPUTATIONNAL BIOLOGIST,还需要
有更先进的算法，比如不使用任何和CORRELATION相关的算法
会直接使用外星智慧电脑的内存进行运算。
能精确预测各个实验室未来十年的试验结果。
结果要有意义，每天自动出paper, 人类科研进步十年。

【在 w********2 的大作中提到】

: Bioinformatician应该成功设计过：
: 1.一种全新的操作系统
: 2.一种全新的CPU芯片
: 3.一种全新的商业模式
: Bill Gates还凑合。

K*n2017-03-23 07:03

12 楼

凭胸而论
lz 的 1,2,3,4,5 我觉得还是有道理的
70 个小时有点太长了，不过跨学科两边都要 follow，可能也是难免的

y*i2017-03-23 07:03

13 楼

2,3,5,6的确是一个好的生信狗需要的，只不过掌握了这么多，花了这么多心血，挣
得却太少。