Re: 做hybridization的时候，怎么知道需要多长时间呀？# Biology - 生物学
s*e
1 楼
什么是hybridization? 是不是ligation(我是生物盲, 别笑, hehe)?
这个可以作些理论估计的:
hybridization时间可以分成几部分: T_d+T_s+T_l
其中T_d是diffusion time, 也就是两条链相遇的平均时间;
这个时间和分子浓度有关系, 大致是这个分子diffuse出分子平均占有体积的时间.
平均占有的体积是浓度的倒数. 随即扩散出一个一个特征距离x, 扩散理论的结果是:
x^2=D*t, D是扩散系数, t是扩散时间. 扩散系数和温度, 溶液粘滞系数, 扩散体的
尺寸有关系. 固定温度和固定溶液下, D和扩散分子的尺寸R成反比: D正比于R^(-1).
于是T_d正比于C^(-2/3)*R, R是链分子的coil size, 它和链长L的关系是:R=Sqrt[L*b],
b代表链的弯曲弹性---b越小, 链越软. 这里的结果对柔软的长链尤其正确.
于是对特定的分子和特定的浓度来说: T_d正比于L^(1/2).
T_s是self diffusion time, 也就是相遇后调整构型使得端对端相吻合的时间;
这个时间大致是分子