谢谢分析 今年早些时候Genome Biology有一篇文章做了三家的比较,大致的结论是Illumina得最 好。观点是否有失偏颇尚待其他研究佐证。 Evaluation of NGS platforms for population targeted sequencing studies 我认为SOLiD的问题在它的color-space上面:它最终要死在它的这个color-code上面。 它这个color-code让搞生物的人很糊涂,甚至让搞数据分析的人也难把握其中奥妙。比 如说楼上所说的“b. solid用所有35bp作alignment,,最多允许6个mismatches”,我的 理解肯定是6个color space mismatches,而不是nucleotide space mismatches,大概 地说,一个nucleotide space mismatch 小于或这等于 2个 color space mismatches 。当然即便如此,允许6个color space mismatches in 35-bp 还是太多了。 SOLiD的技术小组已经注意到了这个问题,但是