求教: 细菌genome分析 - 未名空间MITBBS历史存档

n*e2011-01-09 08:01

1 楼

我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
.....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

E*c2011-01-09 08:01

2 楼

黑，可以，但说话也要注意分寸。眼看路人们都被你们逼成了粉。。。。

a*y2011-01-09 08:01

3 楼

通知如下，遵照站方指示，今后将封杀xiuxin2在wisdom的一切活动。
寄信人: deliver (自动发信系统)
标题: 未名空间举报结果通知
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 24 02:20:02 2010)
来源: mitbbs.com
您被举报的信息如下:

j*z2011-01-09 08:01

4 楼

Just wonder why nobody is interested in HTC Flyer. Although it is Andriod 2.
3, it has some very interesting features like handwriting, notetaker, text
highlighting. These features are currently not available in any tablets in
market so far.

r*y2011-01-09 08:01

5 楼

哪位做过的大侠给讲讲基本步骤啊
俺现在是有了genome的DNA序列，第一步是蛋白预测
看文献是用critica，generation， glimmer预测，在有手工fix
这些分析都是在哪做的？就在NCBI上找到了Glimmer
另外两个谁用过？是免费的软件么？
还有就是有些文献上讲IMG这个组织给手工curation
谁知道这个组织是咋回事？是免费的还是要给钱？
从来没接触过bioinformation的人在做基因组分析
内牛满面啊

c*t2011-01-09 08:01

6 楼

当然是冷水了，那还用问。

w*w2011-01-09 08:01

7 楼

我是来顶那姐的~~

p*s2011-01-09 08:01

8 楼

软件android还不是通用的如果兼容的话
没什么稀罕的糊弄一下没用过android的

2.

【在 j*********z 的大作中提到】

: Just wonder why nobody is interested in HTC Flyer. Although it is Andriod 2.
: 3, it has some very interesting features like handwriting, notetaker, text
: highlighting. These features are currently not available in any tablets in
: market so far.

w*e2011-01-09 08:01

9 楼

Well, why don't you just run glimmer at first? how are you going to use the
predicted protein sequences?

s*d2011-01-09 08:01

10 楼

当然是冷水了，那还用问。
我们孩子都是从三四个月就喝冷水冷奶的。

f*k2011-01-09 08:01

11 楼

他们说不定是高级粉。
其实不是他们这么昧了心的一路踩过来，我真不太会变成粉。我向来是不爱激动，这辈
子还没粉过谁呢。

j*z2011-01-09 08:01

12 楼

关键现有的tablet从hardware上不支持Stylus handwriting, or stylus notetaker.
许多人可能没有认识到这一点。这是HTC flyer的买点。再说，HTC FLYER，能在任何地
方加标注，对于看书看网页尤其重要。

r*y2011-01-09 08:01

13 楼

其实问题问错了，这些是预测基因的
序列还得等个把月，一个同事在做
俺是准备用Gilmmer了
但是俺老板让俺搞清别的办法怎么回事
他也从来没做过，帮不上什么
蛋白出来后主要是要跟一个同种的发表了的genome比较
能比较出什么来还不知道
这还只是第一步
俺想的是第二步就是预测蛋白了吧
又是一堆不知道，看不懂的软件，郁闷

the

【在 w********e 的大作中提到】

: Well, why don't you just run glimmer at first? how are you going to use the
: predicted protein sequences?

t*g2011-01-09 08:01

14 楼

关键是你打算让孩子像你们一样的习惯生活到多大呢？一辈子吗？大点怕是要招同学笑
话。

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

p*s2011-01-09 08:01

15 楼

具体展开说说都是电容屏有什么区别? 配的电容笔又有什么特殊的? 莫非其他电容屏
不能用?
tablet能handwriting 本来就是个常识不管用电阻笔还是电容笔
e人e本的电磁感应倒是有特色

【在 j*********z 的大作中提到】

: 关键现有的tablet从hardware上不支持Stylus handwriting, or stylus notetaker.
: 许多人可能没有认识到这一点。这是HTC flyer的买点。再说，HTC FLYER，能在任何地
: 方加标注，对于看书看网页尤其重要。

w*e2011-01-09 08:01

16 楼

for gene prediction, there are many tools. If you don't want to miss any
genes,use ORF finder.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/
I think there should be other versions that allow you to set M as the
starting amino acid of ORF.
To see the difference on genes between two genomes, you can run a orthologs
comparison between two genomes. There are a number of those sites too, just
google.

【在 r*****y 的大作中提到】

: 其实问题问错了，这些是预测基因的
: 序列还得等个把月，一个同事在做
: 俺是准备用Gilmmer了
: 但是俺老板让俺搞清别的办法怎么回事
: 他也从来没做过，帮不上什么
: 蛋白出来后主要是要跟一个同种的发表了的genome比较
: 能比较出什么来还不知道
: 这还只是第一步
: 俺想的是第二步就是预测蛋白了吧
: 又是一堆不知道，看不懂的软件，郁闷

b*t2011-01-09 08:01

17 楼

听上去你还没有ready把孩子送出去。
我们孩子从newborn就喝冰箱里拿出来的奶。。。

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

j*z2011-01-09 08:01

18 楼

I am not clear, either. But it is true most tablets do not support stylus
input. Have a look at this article:
http://liliputing.com/2011/02/could-stylus-input-for-tablets-be

C*e2011-01-09 08:01

19 楼

IMG不是一个组织
是Joint Genome Institute的一个软件
按照对象的不同还分IMG-EDU（education），IMG-ER(expert)之类
http://www.jgi.doe.gov/software/
你在这个链接可以找到
不过你的genome在哪里测的序啊？
要用IMG的话你的序列必须在它的数据库里
如果不是在JGI测的，而且是刚测出来的还没有发表的，估计不在那个数据库里

【在 r*****y 的大作中提到】

: 哪位做过的大侠给讲讲基本步骤啊
: 俺现在是有了genome的DNA序列，第一步是蛋白预测
: 看文献是用critica，generation， glimmer预测，在有手工fix
: 这些分析都是在哪做的？就在NCBI上找到了Glimmer
: 另外两个谁用过？是免费的软件么？
: 还有就是有些文献上讲IMG这个组织给手工curation
: 谁知道这个组织是咋回事？是免费的还是要给钱？
: 从来没接触过bioinformation的人在做基因组分析
: 内牛满面啊

R*i2011-01-09 08:01

20 楼

daycare 肯定喝冷水。你的要求可以和老师商量。各个daycare的policy不一样的。

C*a2011-01-09 08:01

21 楼

flyer是电容屏+压感

【在 p******s 的大作中提到】

: 具体展开说说都是电容屏有什么区别? 配的电容笔又有什么特殊的? 莫非其他电容屏
: 不能用?
: tablet能handwriting 本来就是个常识不管用电阻笔还是电容笔
: e人e本的电磁感应倒是有特色

r*y2011-01-09 08:01

22 楼

多谢mm，通过我这几天的研究似乎也发现了这个问题。我的genome是在澳洲本地测的，
没发表，看来用不了IMG在线的分析。现在我的理解是得用critica，glimmer，
genemark之类的预测了之后手动fix。

【在 C*******e 的大作中提到】

: IMG不是一个组织
: 是Joint Genome Institute的一个软件
: 按照对象的不同还分IMG-EDU（education），IMG-ER(expert)之类
: http://www.jgi.doe.gov/software/
: 你在这个链接可以找到
: 不过你的genome在哪里测的序啊？
: 要用IMG的话你的序列必须在它的数据库里
: 如果不是在JGI测的，而且是刚测出来的还没有发表的，估计不在那个数据库里

y*u2011-01-09 08:01

23 楼

连水都要喝温的？我觉得热奶就够麻烦的了。在daycare还不是直接喝冷奶。那喝果汁
怎么办？我家baby时期喝水就没喝过温的，现在娃娃大些都直接喝冰水了，下馆子人家
还不是直接冰水冰果汁端来了。

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

w*w2011-01-09 08:01

24 楼

手写的功能看着还不错啊。不过youtube上有个video看着好像不怎么流畅啊

【在 C*********a 的大作中提到】

: flyer是电容屏+压感

r*y2011-01-09 08:01

25 楼

Thanks

orthologs
just

【在 w********e 的大作中提到】

: for gene prediction, there are many tools. If you don't want to miss any
: genes,use ORF finder.
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/
: I think there should be other versions that allow you to set M as the
: starting amino acid of ORF.
: To see the difference on genes between two genomes, you can run a orthologs
: comparison between two genomes. There are a number of those sites too, just
: google.

r*f2011-01-09 08:01

26 楼

而且这个天, 只有喝冰的舒服...

【在 y****u 的大作中提到】

: 连水都要喝温的？我觉得热奶就够麻烦的了。在daycare还不是直接喝冷奶。那喝果汁
: 怎么办？我家baby时期喝水就没喝过温的，现在娃娃大些都直接喝冰水了，下馆子人家
: 还不是直接冰水冰果汁端来了。
:
: daycare
: 想.
: 水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
: 够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
: 人跟在后面逮着机会就灌啊

P*X2011-01-09 08:01

27 楼

7寸直接pass

r*y2011-01-09 08:01

28 楼

bao zi fa le

m*t2011-01-09 08:01

29 楼

这个最好入乡随俗吧。以后孩子大部分时间呆在学校里，还是要适应的。

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

C*e2011-01-09 08:01

30 楼

不客气
还有谢谢你的包子！

【在 r*****y 的大作中提到】

: 多谢mm，通过我这几天的研究似乎也发现了这个问题。我的genome是在澳洲本地测的，
: 没发表，看来用不了IMG在线的分析。现在我的理解是得用critica，glimmer，
: genemark之类的预测了之后手动fix。

c*u2011-01-09 08:01

31 楼

这个，习惯了就好了。我们都是喝冰的。

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

j*f2011-01-09 08:01

32 楼

多大的孩子喝温水？一个月？

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

p*i2011-01-09 08:01

33 楼

幼儿园一直冷牛奶

daycare
想.
水？汤？或者
水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似
daycare 就两次
喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

n*y2011-01-09 08:01

34 楼

首先敬佩一下儿拿出祖父母精神来当爹妈的精神。
然后觉得这些事情都可以跟daycare商量，看人家咋说。

I*e2011-01-09 08:01

35 楼

Please do your kid a favor and don't use the way you were brought up...I
wish my parents let me drink ice cold water and didn't cover my stomach
whenever it was cold when I was a kid. Now I am so not robust compard to
Americans. 中国人动不动就是"睡觉没关窗, 所以感冒了", "喝的水太冷了, 所以肚子
不舒服"...我认识的美国人连听都没听说过这样的事.
BTW, don't get me wrong - 很多我们小的时候的习惯都很好, 我觉得在美国出生的宝宝应该沿袭. 就这个不能喝冷水什么的习惯真是害人不浅...

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

j*a2011-01-09 08:01

36 楼

我以前跟你一个调调，直到儿子只要睡觉没关窗第二天就感冒咳嗽。。。三次五次我还
不幸，七次八次我就招了。有些体质，还是练不出来的。

宝宝应该沿袭. 就这个不能喝冷水什么的习惯真是害人不浅...

【在 I********e 的大作中提到】

: Please do your kid a favor and don't use the way you were brought up...I
: wish my parents let me drink ice cold water and didn't cover my stomach
: whenever it was cold when I was a kid. Now I am so not robust compard to
: Americans. 中国人动不动就是"睡觉没关窗, 所以感冒了", "喝的水太冷了, 所以肚子
: 不舒服"...我认识的美国人连听都没听说过这样的事.
: BTW, don't get me wrong - 很多我们小的时候的习惯都很好, 我觉得在美国出生的宝宝应该沿袭. 就这个不能喝冷水什么的习惯真是害人不浅...
:
: daycare
: 想.
: 水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不

y*i2011-01-09 08:01

37 楼

嗯。。。合乎环境就成了

【在 t*g 的大作中提到】

: 关键是你打算让孩子像你们一样的习惯生活到多大呢？一辈子吗？大点怕是要招同学笑
: 话。
:
: daycare
: 想.
: 水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
: 够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
: 人跟在后面逮着机会就灌啊

q*m2011-01-09 08:01

38 楼

在daycare好多都是吃冷的，习惯了就好。

l*r2011-01-09 08:01

39 楼

真希望我的宝宝从一开始就是我们自己带。
现在什么都是国内老人那一套，过两个月要上幼儿园了，还得慢慢适应，一开始肯定受
苦。

d*n2011-01-09 08:01

40 楼

除了饭菜不是冰箱里直接拿出来的,其它都是.我劝你现在就在家里给孩子喝冷的水
,冷的奶,适应起来.

daycare
想.
水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不
够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大
人跟在后面逮着机会就灌啊

【在 n******e 的大作中提到】

: 我們在家一直都喝温水，而且是一般热水一般凉开水兑的温水。今天去问了，daycare
: 是上午下午吃 snack 的时候给一杯水喝。没来得及问，不过应该就是凉水了。我在想.
: .....我可不可以带瓶保温的温水，让老師给我家娃娃喝啊？不要喝凉水行不行啊？我
: 还是很希望娃娃的饮食习惯和我們一样
: 另外，好像美国小孩中饭都自带了drink。我們家这个吃中餐，我要不要给他准备点水？汤？或者水果就好？不知道他们午饭时候供不供应水，主要怕娃娃一天下来喝水不够。貌似 daycare 就两次喝水的机会，他要是不喝就错过没有了。在家里都是我們大人跟在后面逮着机会就灌啊

w*t2011-01-09 08:01

41 楼

趁现在夏天天气热，赶紧让他练习喝冷水，不是很好吗？
难道一直这么喝温水下去？中国人大人夏天也不喝温水吧？

p*n2011-01-09 08:01

42 楼

孩子适应能力很强的，我儿子冬天进度daycare，喝冷水根本没问题。原来在家都是和
温开水。现在习惯冷水，温水和汤都不喜欢喝了。

【在 l********r 的大作中提到】

: 真希望我的宝宝从一开始就是我们自己带。
: 现在什么都是国内老人那一套，过两个月要上幼儿园了，还得慢慢适应，一开始肯定受
: 苦。