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谁告诉我这个systems biology到底是做什么的啊?
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谁告诉我这个systems biology到底是做什么的啊?# Biology - 生物学
t*a
1
看国航的,年底的1100多,明年初快到2000,怎么回事?都是这样吗?
还有,国泰航空公司是不是没有JFK-香港--大陆的航班了?
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r*z
2
有没有什么规定,墙上最多挂多重的?如果自己不知道怎么挂安全(比较重的一类),
找谁来挂?
那种金色框的,就算SIZE差不多,价钱差别也很大,怎么知道哪种物有所值?什么质地
的框比较好?WOOD? METAL?
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f*r
3
7999
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R*s
4
去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。
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s*t
5
唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
辑。
可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
这个系统生物学到底是要解决什么问题?
已经有哪些研究手段哪些研究方法?
系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
蛋白一个通路。
这等于没回答。
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m*3
6
发错版了?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

【在 t****a 的大作中提到】
: 看国航的,年底的1100多,明年初快到2000,怎么回事?都是这样吗?
: 还有,国泰航空公司是不是没有JFK-香港--大陆的航班了?

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t*c
7
个人喜欢第2.3 or 4
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d*e
8
谁垫砖啊?

【在 f******r 的大作中提到】
: 7999
: 抢

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e*g
9
婚姻是情投意合、想生活在一起的俩个人相互的照顾和奉献,是责任,不是摆脱剩下的
手段。

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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T*t
10
我就知道是Systems Biology,不是system biology。多了就不了解了。有个这个专题
的俱乐部的,你去那里问问看。
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D*C
11
我12年1月的机票,1200阿

【在 t****a 的大作中提到】
: 看国航的,年底的1100多,明年初快到2000,怎么回事?都是这样吗?
: 还有,国泰航空公司是不是没有JFK-香港--大陆的航班了?

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J*i
12
吃什么大补丸了

【在 f******r 的大作中提到】
: 7999
: 抢

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s*y
13
家里的事你操心,这样你lg不是省心了,对他还是有利的
mm管得太多了,为什么不让你lg去管?
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s*t
14
果然 。。。唉。更迷惑了

【在 T**********t 的大作中提到】
: 我就知道是Systems Biology,不是system biology。多了就不了解了。有个这个专题
: 的俱乐部的,你去那里问问看。

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J*i
15
伤害你

【在 d********e 的大作中提到】
: 谁垫砖啊?
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M*o
16
上个礼拜跑步 那个跑步的已婚男说 快乐程度应该是这样排名的
1.快乐的婚姻
2.快乐的单身汉
3.痛苦的婚姻
既然mm选择放弃做2,那就争取努力upgrade到1。如果实在觉得无法释放压力的话,可
以去学校心理中心找个therapist聊聊。
keep positive!不要老是觉得自己depressed,遇到觉得特烦的事情,可以这样想blah
blah blah but it doesn't matter。加油!
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a*g
17
净整些虚的
用些数学统计模型啥的研究调控网络之类的东西
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f*r
18
没有做事,内疚加烦躁

【在 J********i 的大作中提到】
: 吃什么大补丸了
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r*a
19
对婚姻寄予的希望太高,自然失望了。

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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s*y
20
用数学方法来全局性看问题的一种解决方法
我认为其实就是digitalized physiology

【在 s*********t 的大作中提到】
: 唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
: 辑。
: 可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
: 有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
: 这个系统生物学到底是要解决什么问题?
: 已经有哪些研究手段哪些研究方法?
: 系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
: 不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
: 蛋白一个通路。
: 这等于没回答。

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f*r
21
我来

【在 J********i 的大作中提到】
: 伤害你
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f*k
22
你的依赖性太强, 你所嫁之人的能力又不够被你依赖。
这样, 把你所要做和想做的事情列个清单,比如毕业论文,找工作,家务,和朋友倾
诉,健身,shopping, 和你钦慕或崇拜的人吃顿饭什么的, 等等。
然后把这些事情按重要性排序 --- 注意要把能让自己关注并开心的事尽量向前排。
最后你要明白,无论已婚或单身,都要事事先考虑你自己想要什么,再考虑其他的。
不然你迟早会沦为一个得忧郁症的怨妇。

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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S*M
23
感觉这个领域相当的杂
哈佛有个系就叫systems biology
里面干什么的都有

【在 s*********t 的大作中提到】
: 唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
: 辑。
: 可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
: 有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
: 这个系统生物学到底是要解决什么问题?
: 已经有哪些研究手段哪些研究方法?
: 系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
: 不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
: 蛋白一个通路。
: 这等于没回答。

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J*i
24
喝茶

【在 f******r 的大作中提到】
: 没有做事,内疚加烦躁
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a*0
25
嗯,“可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫他做的事情”。
他做你叫他做的事情不是替你分忧了么,不是你倚靠他把事办了么?
算了,跟女人没法讲逻辑。
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m*2
26
哈佛那是在探索前沿,所以各种方向各种方法都有探索。
具体现在在应用层面上,就是从海量的各类信息中综合归纳出可以somehow指导你的生
产实践或者科研
的假说,方案等等。这个信息包括各种-omics的data,所有的publication,patent,各种
生理病理
临床数据等等等等。我不知道这个和专家的定义一样不一样,但是我们部门每天干的就
是这个,我们挂
的牌子就是systems biology。

【在 S*M 的大作中提到】
: 感觉这个领域相当的杂
: 哈佛有个系就叫systems biology
: 里面干什么的都有

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J*i
27
加油

【在 f******r 的大作中提到】
: 我来
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l*g
28
估计你老公是土相星座吧!
实用派的,挺好的

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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s*t
29
那systems biologist是自己产生各种-omics的数据,还是利用别人的数据?
怎么利用这些数据,归纳综合(也就是常用神马研究手段)?是否需要做实验验证呢?
一般得出的结论都是神马样子滴?(比如传统生物学的结论往往是A蛋白和B蛋白相互作
用调节C的表达进
而影响某个生理过程比如干细胞分化)

【在 m**********2 的大作中提到】
: 哈佛那是在探索前沿,所以各种方向各种方法都有探索。
: 具体现在在应用层面上,就是从海量的各类信息中综合归纳出可以somehow指导你的生
: 产实践或者科研
: 的假说,方案等等。这个信息包括各种-omics的data,所有的publication,patent,各种
: 生理病理
: 临床数据等等等等。我不知道这个和专家的定义一样不一样,但是我们部门每天干的就
: 是这个,我们挂
: 的牌子就是systems biology。

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f*r
30
那也烦

【在 J********i 的大作中提到】
: 喝茶
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m*n
31
婚姻就这样,没办法。
如果不喜欢,生个孩子后离了吧。
这是一种要个孩子的方法。

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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s*l
32
Just read a few paper in the current issue of Cell. You should get sense. It
is better to do that homework than just ask here.
Many discussions here for systems biology are often based on personal
feeling, further, many of people here did not read anything about systems
biology, purely based on personal feelings, which can't be objective and
comprehensive.
This Cell issue covers more comprehensive review about this field, it is
better to read them to know what is going on and what is the next.
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f*r
33
算了,差太多了

【在 J********i 的大作中提到】
: 加油
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w*6
34
典型的围城
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d*0
35
2nd this!

It

【在 s******l 的大作中提到】
: Just read a few paper in the current issue of Cell. You should get sense. It
: is better to do that homework than just ask here.
: Many discussions here for systems biology are often based on personal
: feeling, further, many of people here did not read anything about systems
: biology, purely based on personal feelings, which can't be objective and
: comprehensive.
: This Cell issue covers more comprehensive review about this field, it is
: better to read them to know what is going on and what is the next.

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J*i
36
把事情写下来

【在 f******r 的大作中提到】
: 那也烦
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R*s
37
谢谢各位,恩!大家说都很一针见血!很有用!恩,老公的却是土相星座的,mm太厉害
了。
我真的是秉承着奉献的精神走入婚姻的,事实上我也是这么做的。可是当婚姻中一个人
总是付出的时间和精力比另一个人多地时候,真的觉得好累。我不想做家里所有事情的
总指挥,即使是总指挥也需要军师阿。现在我不仅要做指挥,还要做军师,很多不懂的
事情又只能去和朋友商量。我尝试交流,但收效甚微。想要改变一个人太难,可总是改
变自己,又太压抑,家庭婚姻真的太复杂了。
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y*t
38
去Institute of Systems Biology看一下吧。 这个领域是有不少人跟风忽悠,但也有
不少认真做
海量实验的。 有了那么多的各类数据,当然会出现很多新的东西和启发。 和传统生物
有个基本的观点
不同,系统生物学从数据发现新东西,所谓的data driven,不是先有假设再来验证。
但在这个事情
上往往观点冲突很大,大牛们也不断吵架,感觉跟以前纯数学攻击统计学一样。 个人
不觉得谁比谁正
确,但系统生物学更注重实用,而且和工程系合作空前紧密,会推动新技术新设备的发
展。

【在 s*********t 的大作中提到】
: 唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
: 辑。
: 可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
: 有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
: 这个系统生物学到底是要解决什么问题?
: 已经有哪些研究手段哪些研究方法?
: 系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
: 不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
: 蛋白一个通路。
: 这等于没回答。

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J*i
39
要迎难而上

【在 f******r 的大作中提到】
: 算了,差太多了
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w*6
40
MM要记住一点,两性关系中,没必要付出太多,照顾好自己,你付出越多,男人越烦
的,人家又没让你付出那么多,适可而止大家都不累,你付出一多了,就会不平衡,抱
怨,很正常。有点时间自己看看电影,买买东西,读读书,逛逛网
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r*e
41
用数学模型研究生物体代谢通路和网络。研究生物大分子相互作用以及他们在生物功能
上的关系。其他的东西很多也能归到系统生物学里面

【在 s*********t 的大作中提到】
: 唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
: 辑。
: 可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
: 有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
: 这个系统生物学到底是要解决什么问题?
: 已经有哪些研究手段哪些研究方法?
: 系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
: 不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
: 蛋白一个通路。
: 这等于没回答。

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O*y
42
我也没做事,一点也不内疚。晚上再加班

【在 f******r 的大作中提到】
: 没有做事,内疚加烦躁
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l*n
43
你老公是绿色性格,可惜你不是黄色性格
和lzmm相反。我是黄色性格,当总指挥兼军师我就觉得很舒服。如果家里我不能作主,
我会生活得非常不爽。
我现在真是越来越相信婚姻中性格的合拍了。别人觉得很不舒服的事情,另外性格的人
恰好需要这样的。而且改变很难。
这就是为什么有的人很合得来,有的人就是合不来。其实换成其他性格的人,倒会很合
得来
可惜人的性格是天生的,而且lzmm已经结婚了。那么只能改变自己,来适应他人。勇敢
的挑起家庭的作主权来!

【在 R********s 的大作中提到】
: 谢谢各位,恩!大家说都很一针见血!很有用!恩,老公的却是土相星座的,mm太厉害
: 了。
: 我真的是秉承着奉献的精神走入婚姻的,事实上我也是这么做的。可是当婚姻中一个人
: 总是付出的时间和精力比另一个人多地时候,真的觉得好累。我不想做家里所有事情的
: 总指挥,即使是总指挥也需要军师阿。现在我不仅要做指挥,还要做军师,很多不懂的
: 事情又只能去和朋友商量。我尝试交流,但收效甚微。想要改变一个人太难,可总是改
: 变自己,又太压抑,家庭婚姻真的太复杂了。

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d*y
44
俺们建模型的时候就认为系统生物学就是干这个的。可是现在月来越多的omics的工作
也变成系统生物学的内容了。

【在 r**********e 的大作中提到】
: 用数学模型研究生物体代谢通路和网络。研究生物大分子相互作用以及他们在生物功能
: 上的关系。其他的东西很多也能归到系统生物学里面

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f*r
45
就一件事,做不来

【在 J********i 的大作中提到】
: 把事情写下来
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s*3
46
让自己变的有弹性一些未尝不好;改变自己比改变别人更容易
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m*c
47
In a broader sense, systems biology is to study biology at systems level.
What does system defines? It saids that, based on my understanding, is a
level up from single molecules or pathways. The research model has to be at
least at single living cell, that means you read out the results of whole
cell response no matter what input has been given.
There are many approaches of studying systems biology, please don't confuse
with definition of systems biology, such as computational approaches,
tranditional wet lab high throuput approaches or conbionation of them and so
on. Main thing of systems biology is to understand the biology at systems
level from single living cell to a cell complex or organ.
MIT is the first institute in the world that established a ph.d program for
systems biology. The professors at this program are Peter sorger, Douglas A.
Lauffenburger and etc. Sorger moved to harvard systems biology department
because of some political issues. There are many good guys in MIT who
established their lab for at least partially studying systems biology.
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O*y
48
那找人帮忙啊

【在 f******r 的大作中提到】
: 就一件事,做不来
avatar
c*o
49
有个小兵,任劳任怨的听你指挥难道不好吗?~
再说了,结婚,不单单只是找个人来照顾你,你也要去照顾对方的,所有的事情都是相
互的

【在 R********s 的大作中提到】
: 谢谢各位,恩!大家说都很一针见血!很有用!恩,老公的却是土相星座的,mm太厉害
: 了。
: 我真的是秉承着奉献的精神走入婚姻的,事实上我也是这么做的。可是当婚姻中一个人
: 总是付出的时间和精力比另一个人多地时候,真的觉得好累。我不想做家里所有事情的
: 总指挥,即使是总指挥也需要军师阿。现在我不仅要做指挥,还要做军师,很多不懂的
: 事情又只能去和朋友商量。我尝试交流,但收效甚微。想要改变一个人太难,可总是改
: 变自己,又太压抑,家庭婚姻真的太复杂了。

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w*m
50
make sense!
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f*r
51
你先来

【在 J********i 的大作中提到】
: 要迎难而上
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S*t
52
赞同。
2个人在一起是为了开心,舒畅的生活,而不是压抑自己。

【在 e****g 的大作中提到】
: 婚姻是情投意合、想生活在一起的俩个人相互的照顾和奉献,是责任,不是摆脱剩下的
: 手段。
:
: so

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y*u
53
Are you sure the first one in at MIT not at Harvard Medical School by Mac
Kirschner?

at
confuse
so

【在 m***c 的大作中提到】
: In a broader sense, systems biology is to study biology at systems level.
: What does system defines? It saids that, based on my understanding, is a
: level up from single molecules or pathways. The research model has to be at
: least at single living cell, that means you read out the results of whole
: cell response no matter what input has been given.
: There are many approaches of studying systems biology, please don't confuse
: with definition of systems biology, such as computational approaches,
: tranditional wet lab high throuput approaches or conbionation of them and so
: on. Main thing of systems biology is to understand the biology at systems
: level from single living cell to a cell complex or organ.

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f*r
54
还有人比我厉害?

【在 O**y 的大作中提到】
: 那找人帮忙啊
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I*e
55
单身比在一个不好的婚姻里强. 可惜太多人, 尤其是女人, 都不理解这一点.

so

【在 R********s 的大作中提到】
: 去年刚结婚的。没结婚之前,总觉得自己剩着很悲哀。终于把自己嫁出去了,可是有了
: 婚姻,生活好像更加难了,很窒息。家里的大小事务都要操心,又在毕业关口,压力so
: 大,每天都很depress。可是老公也并不能替我分忧,他只知道忙自己的事业和做我叫
: 他做的事情。难道婚姻都是这样么,难道婚姻不是那种相互依靠,不开心的时候可以倾
: 诉,遇见事情大家商量,每个人都把这个家放在心上的么。为什么结婚了,我除了操心
: 自己,心情不好还是一个排解,还要受一大堆因为了家庭而来的压力呢。男人,丈夫,
: 看来真是不能依靠的吧,那我们为什么要结婚呢。

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m*c
56
100%
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J*i
57
那歇吧

【在 f******r 的大作中提到】
: 就一件事,做不来
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P*d
58
凑个热闹。
首先声明:1本人是离系统生物学比较近的外行;2本文只有批判,没有建设。看完之
后,你会明白为什么本人不可能提出建设性的看法。
我觉得squirrabbit的问题中,最重要的就是“这个系统生物学到底是要解决什么问题
?”作为新生事物,系统生物学受到置疑并不奇怪。当年Delbruck一干人提出分子生物
学,也受到Chargaff的嘲弄。但是那一批人有着明确的问题:1遗传的物质基础是什么
;2遗传物质如何编码信息;3遗传信息如何转化成生命活动。这些问题直指生命现象
的核心,所以这些问题的答案(DNA, double helix, codon, central dogma and
operon)就开启了生物学的新时代。
相比之下,系统生物学要解决什么问题?我还没有看到象当年分子生物学那样明确,令
人信服的agenda。上面的回贴,大部分也都回避了这个问题。从这一点上看,现在的系
统生物学,恐怕不会象六十年前的分子生物学那样开创一个新时代。
先挖个坑,回头再来谈我觉得现在的系统生物学是什么。
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J*i
59
上谁?

【在 f******r 的大作中提到】
: 你先来
avatar
r*t
60
崇拜,我觉得你看的很明白。

【在 P****d 的大作中提到】
: 凑个热闹。
: 首先声明:1本人是离系统生物学比较近的外行;2本文只有批判,没有建设。看完之
: 后,你会明白为什么本人不可能提出建设性的看法。
: 我觉得squirrabbit的问题中,最重要的就是“这个系统生物学到底是要解决什么问题
: ?”作为新生事物,系统生物学受到置疑并不奇怪。当年Delbruck一干人提出分子生物
: 学,也受到Chargaff的嘲弄。但是那一批人有着明确的问题:1遗传的物质基础是什么
: ;2遗传物质如何编码信息;3遗传信息如何转化成生命活动。这些问题直指生命现象
: 的核心,所以这些问题的答案(DNA, double helix, codon, central dogma and
: operon)就开启了生物学的新时代。
: 相比之下,系统生物学要解决什么问题?我还没有看到象当年分子生物学那样明确,令

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f*r
61


【在 J********i 的大作中提到】
: 那歇吧
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M*s
62
其实系统生物学要解决的其中一个问题 是 物理学上一直在努力解决的问题
complexity and emergency phenomenon
因为我们对于简单的现象和低层级的behavior比较了解的情况下,比如生物分子之间是
如何运作的,但是一旦由很多分
子组织到一起,就出现了很复杂的行为,但是我们并不知道 也无法预测 也无法精确地
重现和改变 这些复杂的现象。
就像 craig venter 做出来的 细菌,虽然我们能做出来,但是我们对于为啥这个基因
组可以boot up一个生命体,还是不
知道,尽管我们知道 genome structure,central dogma,蛋白如何生成 如何fold 如
何讲解,分子之间如何反应。。
。然而即便知道了 这些基础的knowledge 并不能让你充分理解 细胞运行的情况,比如
让你从头设计基因序列来产生足
够功能的蛋白然后形成稳定的可以自我遗传和进化的基因组就目前来说还是天方夜谭。
所以说systems biology 并不应该是单纯的 genome wide study 而应该是 multi-
scale research 从 single
molecule level 到 molecular systems 接近于 single cell level 再到 multi-
cellular study
我觉得 人们想提出 systems biology 大概是想解决类似这种问题吧。只不过因为这个
问题很复杂,所以需要更多其他的
领域的帮助。。。。也很难有特别大的进展,对于应用来说更远。。。
(systems biology 想解决的问题 是 blueprint between genotype and phenotype
更像是 分子生物学家一直追寻的
问题 因为如果systems biology的问题解决了 生物学的很多其他问题都不大会成为问
题了,可以说是most
fundamental的终极问题 )
不管如何,相对于还原论研究那种把 multiple component system 分解成单个问题研
究,把multi scale problems 分
成单层尺度来研究 还是有一些意义的。

【在 P****d 的大作中提到】
: 凑个热闹。
: 首先声明:1本人是离系统生物学比较近的外行;2本文只有批判,没有建设。看完之
: 后,你会明白为什么本人不可能提出建设性的看法。
: 我觉得squirrabbit的问题中,最重要的就是“这个系统生物学到底是要解决什么问题
: ?”作为新生事物,系统生物学受到置疑并不奇怪。当年Delbruck一干人提出分子生物
: 学,也受到Chargaff的嘲弄。但是那一批人有着明确的问题:1遗传的物质基础是什么
: ;2遗传物质如何编码信息;3遗传信息如何转化成生命活动。这些问题直指生命现象
: 的核心,所以这些问题的答案(DNA, double helix, codon, central dogma and
: operon)就开启了生物学的新时代。
: 相比之下,系统生物学要解决什么问题?我还没有看到象当年分子生物学那样明确,令

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f*r
63
你春节点

【在 J********i 的大作中提到】
: 上谁?
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f*u
64
你说的emergency property以及multi-scale study是绝对的重大问题。
一般来说只要问题是在同一个scale内,就都比较好办。
所以很多时候两个相邻的scale都搞得挺清楚了,就是没法把两个scale联系起来。
举个版上大部分人能理解的例子,有关染色质的高级结构。
在分子水平上,DNA和组蛋白的结构都已经非常清楚了,核小体的结构也有了。
在亚细胞水平上,染色体的行为研究也已经一百多年了,搞得很清楚了。
但是这两个scale就是没法联系起来,所以现在染色质的高级结构就是不清楚。
在两个不同scale中间的东西就是尴尬,如果小一点,可以用X晶体看得很清楚,
如果大一点,显微镜可以看得清楚。可是它偏偏要大不大要小不小的。
X晶体的话太复杂做不了,显微镜又看不见他是什么样子。
谁要是解决了这个,估计够好几个诺贝尔奖了。
这个还只是从分子水平到亚细胞水平,
你说得bridge phenotype and genotype可以算是终极目标了吧。
我觉得认识到这个问题的人恐怕还是不少的,关键是怎么解决这个问题。
我还没有看到好的解决方案,不知道你只不知道这方面好的个例。
目前所谓的很多systems biology感觉就是genome wide study,
就算是尝试把两个不同的scale给联起来也只是很简单得correlation而已。

【在 M*******s 的大作中提到】
: 其实系统生物学要解决的其中一个问题 是 物理学上一直在努力解决的问题
: complexity and emergency phenomenon
: 因为我们对于简单的现象和低层级的behavior比较了解的情况下,比如生物分子之间是
: 如何运作的,但是一旦由很多分
: 子组织到一起,就出现了很复杂的行为,但是我们并不知道 也无法预测 也无法精确地
: 重现和改变 这些复杂的现象。
: 就像 craig venter 做出来的 细菌,虽然我们能做出来,但是我们对于为啥这个基因
: 组可以boot up一个生命体,还是不
: 知道,尽管我们知道 genome structure,central dogma,蛋白如何生成 如何fold 如
: 何讲解,分子之间如何反应。。

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O*y
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天外有天,人上有人

【在 f******r 的大作中提到】
: 还有人比我厉害?
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s*y
66
洗耳恭听。
我对这个方向一直有兴趣但是一直搞不懂他们在干什么。
我的直觉是他们试图用数学工具来把已知的生物信息(包括各个层次)来统一组织起来,
然后从系统分析的角度来分析生物体作为多个作用力的综合结果。
但是我对此一直有很大的疑问。比方说有不少人试图把各种细胞骨架蛋白的作用都
统一起来搞一个统一的动态分析系统。但是我对此总觉得不舒服,比方说我觉得很多
文献里面的测量结果其实都不是那么可靠。这么强行把那些数据放在一起,结果能可靠么?

【在 P****d 的大作中提到】
: 凑个热闹。
: 首先声明:1本人是离系统生物学比较近的外行;2本文只有批判,没有建设。看完之
: 后,你会明白为什么本人不可能提出建设性的看法。
: 我觉得squirrabbit的问题中,最重要的就是“这个系统生物学到底是要解决什么问题
: ?”作为新生事物,系统生物学受到置疑并不奇怪。当年Delbruck一干人提出分子生物
: 学,也受到Chargaff的嘲弄。但是那一批人有着明确的问题:1遗传的物质基础是什么
: ;2遗传物质如何编码信息;3遗传信息如何转化成生命活动。这些问题直指生命现象
: 的核心,所以这些问题的答案(DNA, double helix, codon, central dogma and
: operon)就开启了生物学的新时代。
: 相比之下,系统生物学要解决什么问题?我还没有看到象当年分子生物学那样明确,令

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f*r
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我们上面没人

【在 O**y 的大作中提到】
: 天外有天,人上有人
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S*M
68
可以看看MIT的Oudenaarden
他们组网页上说他们是Systems Biology Lab
去年发了一堆CNS

【在 s*********t 的大作中提到】
: 唉。我认识的一个人以前是做生化的,现在说他要去做这个了。这一期的Cell也出了专
: 辑。
: 可是我到现在都弄不明白这个systems biology到底是研究什么的,到底是不是忽悠。
: 有没有人能简单又清晰的告诉我啊。
: 这个系统生物学到底是要解决什么问题?
: 已经有哪些研究手段哪些研究方法?
: 系统生物学能给传统的生物学研究带来什么新的东西和启发?
: 不要告诉我这个是要用系统的不同于还原论的手段综合解决,不再局限于一个基因一个
: 蛋白一个通路。
: 这等于没回答。

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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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f*r
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d*e
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恭喜这位同学

【在 f******r 的大作中提到】
: 8
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O*y
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苦命的孩子,没有大腿抱

【在 f******r 的大作中提到】
: 我们上面没人
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d*e
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你也不要太嚣张了

【在 O**y 的大作中提到】
: 苦命的孩子,没有大腿抱
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O*y
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当心被举报了。。。

【在 d********e 的大作中提到】
: 恭喜这位同学
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d*e
95
这也怕那还混个p

【在 O**y 的大作中提到】
: 当心被举报了。。。
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O*y
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真是条汉子

【在 d********e 的大作中提到】
: 这也怕那还混个p
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d*e
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可惜你们不争气,都没一个帅的

【在 O**y 的大作中提到】
: 真是条汉子
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J*i
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帅能当泡面吃?

【在 d********e 的大作中提到】
: 可惜你们不争气,都没一个帅的
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d*e
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我可以拿你们吹牛啊

【在 J********i 的大作中提到】
: 帅能当泡面吃?
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J*i
100
认识莲花就够了

【在 d********e 的大作中提到】
: 我可以拿你们吹牛啊
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d*e
101
不是祝福过你们了么?怎么还来显摆

【在 J********i 的大作中提到】
: 认识莲花就够了
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O*y
102
吹一个看看先

【在 d********e 的大作中提到】
: 我可以拿你们吹牛啊
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d*e
103
你们谁敢骂我我就让obey奔一个恶心死你!

【在 O**y 的大作中提到】
: 吹一个看看先
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O*y
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这样的人选,版上有的是吧

【在 d********e 的大作中提到】
: 你们谁敢骂我我就让obey奔一个恶心死你!
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f*r
105
看把你季度的

【在 O**y 的大作中提到】
: 这样的人选,版上有的是吧
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O*y
106
唉,总是不能出人头地

【在 f******r 的大作中提到】
: 看把你季度的
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f*r
107
恶心人的机会我让他们都不要和你抢

【在 O**y 的大作中提到】
: 唉,总是不能出人头地
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O*y
108
多找几个女id让我出手

【在 f******r 的大作中提到】
: 恶心人的机会我让他们都不要和你抢
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f*r
109
好,等瓜妹来

【在 O**y 的大作中提到】
: 多找几个女id让我出手
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O*y
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说好不让他们和我抢的

【在 f******r 的大作中提到】
: 好,等瓜妹来
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f*r
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瓜妹是女id

【在 O**y 的大作中提到】
: 说好不让他们和我抢的
avatar
O*y
112
你给了他恶心人的机会

【在 f******r 的大作中提到】
: 瓜妹是女id
avatar
f*r
113
看把你季度的

【在 O**y 的大作中提到】
: 你给了他恶心人的机会
avatar
m*o
114
又来晚了。。。
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h*e
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over le?
8001
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