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请教做过体外泛素化的版友
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请教做过体外泛素化的版友# Biology - 生物学
c*s
1
新买的吸尘器,吸力超强。前天吸了一次地毯,trash tray里全是毛。
请问会不会把地毯吸坏?
谢谢
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l*o
2
本人的project中有个很重要的实验,是做药物对已知蛋白泛素化的影响。
先买了一个boston 公司ENZO的kits,拿着试剂盒中的阳性control,按照其说明书做,
神马阳性条带都没有见到,跟那个公司你来我往交流了一个多月,他们公司还继续给我
做了张漂亮的图,我这边换了个人做,还是啥泛素化条带都没有见到,我们实验室得出
的结论是试剂盒有问题。
接下来就换了家有口碑的boston biochem,买了p53 Ubiquitination Kit这个试剂盒,
说起来这种实验应该是很简单的,见了鬼了,依然是两个人做了两次还是阳性对照都出
不来。我觉得像这家公司试剂应该是问题不大的,但是我实在是找不到原因。
不知道有没有做过类似实验的版友给些好的建议,或者提醒我有什么tricks,或者再给
我推荐个用过的试剂盒。
谢谢!
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z*n
3
地毯掉毛,劣质产品,呵呵
常见于卖家临卖前装修所用

【在 c********s 的大作中提到】
: 新买的吸尘器,吸力超强。前天吸了一次地毯,trash tray里全是毛。
: 请问会不会把地毯吸坏?
: 谢谢

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l*o
4
顶起求助!
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c*s
5
新房子,有warranty,请问要找builder吗?
谢谢

【在 z*********n 的大作中提到】
: 地毯掉毛,劣质产品,呵呵
: 常见于卖家临卖前装修所用

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s*y
6
体外泛素化很难作的。即使是老手也容易出岔子,更不用说新手了。
不知道你们的kit 是否把所有component 都放进去了。
首先从最容易出岔子的地方来说吧,你们用什么检测方法?
如果用放射同位素标记的泛素还还容易看出带一些。
如果是用western blot的话,很难用蛋白本身的抗体直接看出ladder的。
我们一般都是把His-tagged 蛋白纯化之后再用anti-ubiquitin来看。
另外一个要点是,跑胶的时候最好要用4-15% gradient gel, 然后30伏
转膜过夜。如果高压短时间转膜几乎转不出好看的带来。

【在 l****o 的大作中提到】
: 本人的project中有个很重要的实验,是做药物对已知蛋白泛素化的影响。
: 先买了一个boston 公司ENZO的kits,拿着试剂盒中的阳性control,按照其说明书做,
: 神马阳性条带都没有见到,跟那个公司你来我往交流了一个多月,他们公司还继续给我
: 做了张漂亮的图,我这边换了个人做,还是啥泛素化条带都没有见到,我们实验室得出
: 的结论是试剂盒有问题。
: 接下来就换了家有口碑的boston biochem,买了p53 Ubiquitination Kit这个试剂盒,
: 说起来这种实验应该是很简单的,见了鬼了,依然是两个人做了两次还是阳性对照都出
: 不来。我觉得像这家公司试剂应该是问题不大的,但是我实在是找不到原因。
: 不知道有没有做过类似实验的版友给些好的建议,或者提醒我有什么tricks,或者再给
: 我推荐个用过的试剂盒。

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r*g
7
如果是新的地毯, 掉毛正常吧 - 特别如果是羊毛。
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W*C
8
我们不但目标蛋白是flag tag, ubiquitin也加了HA TAG。
按理说加了多个ubi的蛋白会降解掉, 我看很多protocol里也没抑制降解
, ladder还能出的很漂亮。。。
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c*s
9
我再吸几次看看, 如果再有就去找builder。
谢谢

【在 r*****g 的大作中提到】
: 如果是新的地毯, 掉毛正常吧 - 特别如果是羊毛。
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s*y
10
在体外作的时候常常不降解的。
在体内做的时候则需要加抑制剂。



【在 W****C 的大作中提到】
: 我们不但目标蛋白是flag tag, ubiquitin也加了HA TAG。
: 按理说加了多个ubi的蛋白会降解掉, 我看很多protocol里也没抑制降解
: , ladder还能出的很漂亮。。。

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a*s
11
羊毛地毯没经过"pre-vacuum"掉毛很正常。吸吸就没有了。
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e*s
12
计划做类似的试验,还没开始。
为什么用蛋白本身的抗体很难直接看出Ladder来?

【在 s******y 的大作中提到】
: 体外泛素化很难作的。即使是老手也容易出岔子,更不用说新手了。
: 不知道你们的kit 是否把所有component 都放进去了。
: 首先从最容易出岔子的地方来说吧,你们用什么检测方法?
: 如果用放射同位素标记的泛素还还容易看出带一些。
: 如果是用western blot的话,很难用蛋白本身的抗体直接看出ladder的。
: 我们一般都是把His-tagged 蛋白纯化之后再用anti-ubiquitin来看。
: 另外一个要点是,跑胶的时候最好要用4-15% gradient gel, 然后30伏
: 转膜过夜。如果高压短时间转膜几乎转不出好看的带来。

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n*i
13
完全正常,地毯就是这样的啊。
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s*y
14
因为泛素化的蛋白只占总蛋白的一小部分。而且,有些时候,泛素化会妨碍
抗体对蛋白的识别

【在 e****s 的大作中提到】
: 计划做类似的试验,还没开始。
: 为什么用蛋白本身的抗体很难直接看出Ladder来?

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c*s
15
看样子是以前的吸尘器太烂了。谢谢
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l*o
16
谢谢sunnyday,除了抗体以外的所有成分都是公司提供的。
我们没有用同位素的方法检测,用的是目标蛋白p53的抗体以及ubiquitin的抗体。
转膜条件倒是30v过夜,并且用的是公司推荐的一个适合大分子转膜的一个配方。
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S*l
17
如果地毯的绒毛比较长,头上部分很容易被老式强力洗尘器卷掉,甚至会拉扯其他的部
分。注意买洗尘器的性能哦。
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a*g
18
你再提供点实验过程和kit的具体信息。看不到ubiquitination,p53总看得到吧,是不
是level一点都没变?ubiquitin也是,总看得到free ubiquitin吧?

【在 l****o 的大作中提到】
: 谢谢sunnyday,除了抗体以外的所有成分都是公司提供的。
: 我们没有用同位素的方法检测,用的是目标蛋白p53的抗体以及ubiquitin的抗体。
: 转膜条件倒是30v过夜,并且用的是公司推荐的一个适合大分子转膜的一个配方。

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y*o
19
错! 新地毯shredding很正常。再好的地毯刚装上都这样。时间长了就没有了。

【在 z*********n 的大作中提到】
: 地毯掉毛,劣质产品,呵呵
: 常见于卖家临卖前装修所用

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W*C
20

体内你用mg132抑制多久? 太久细胞估计就死啦

【在 s******y 的大作中提到】
: 在体外作的时候常常不降解的。
: 在体内做的时候则需要加抑制剂。
:
: 。

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l*o
21
我的实验用的是这个试剂盒(http://www.bostonbiochem.com/product/k-200)分组和说明书一样的。
用p53特异性抗体WB检测,条带清晰,但各组p53的水平没有明显变化,说明书上泛素化
组是明显下降的。free Ub是很清晰的。
谢谢。

【在 a******g 的大作中提到】
: 你再提供点实验过程和kit的具体信息。看不到ubiquitination,p53总看得到吧,是不
: 是level一点都没变?ubiquitin也是,总看得到free ubiquitin吧?

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l*o
22
体内实验我也做过,呵呵,我用过MG132抑制过12小时以上的,浓度10微摩,细胞并没
有死。

【在 W****C 的大作中提到】
:
: 体内你用mg132抑制多久? 太久细胞估计就死啦

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s*y
23
我一向都只加5~6个小时。

【在 W****C 的大作中提到】
:
: 体内你用mg132抑制多久? 太久细胞估计就死啦

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a*g
24
我看了一下protocol,+/-ATP的条件你是怎么做到的?貌似kit components里面只有一
个reaction buffer。
另外你确保E1 E2 E3 ub还有p53都加了?

【在 l****o 的大作中提到】
: 我的实验用的是这个试剂盒(http://www.bostonbiochem.com/product/k-200)分组和说明书一样的。
: 用p53特异性抗体WB检测,条带清晰,但各组p53的水平没有明显变化,说明书上泛素化
: 组是明显下降的。free Ub是很清晰的。
: 谢谢。

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Z*N
25
你加fresh ATP了没?
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l*o
26
没有加,buffer里面有的。

【在 Z*****N 的大作中提到】
: 你加fresh ATP了没?
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l*o
27
所有成分当然是加了,呵呵。+/- ATP就是+/- reaction buffer.

【在 a******g 的大作中提到】
: 我看了一下protocol,+/-ATP的条件你是怎么做到的?貌似kit components里面只有一
: 个reaction buffer。
: 另外你确保E1 E2 E3 ub还有p53都加了?

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a*g
28
那这个就很诡异了,建议联系boston biochem

【在 l****o 的大作中提到】
: 所有成分当然是加了,呵呵。+/- ATP就是+/- reaction buffer.
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