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关于共转染实验,请教版上高人!
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关于共转染实验,请教版上高人!# Biology - 生物学
a*s
1
五个多月不到六个月,表上填5,还是算成5点几,还是6?
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c*n
2
太赤裸裸了, 完全就是老墨的共产党宣言吗, 要废除illegal immigrants, 全部共产
, 老黑用枪砸开人家玻璃被冠冕堂皇地当成光辉形象宣传
这个国家在我们退休之前肯定共产化 欧洲化
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m*d
3
这15%是搞不到了
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q*0
4
最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
)的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
transfection efficiency consistency更好?
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d*y
5
我就写5个月

【在 a*****s 的大作中提到】
: 五个多月不到六个月,表上填5,还是算成5点几,还是6?
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k*o
6
why?
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m*5
7
我也不大懂这个系统,借地问两句,听说现在有一种说法是这种实验如果作为主体很容
易被打回来,因为不是很科学的系统。 好文章现在这种实验都是藏在一个小pannel里
佐证一下
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b*c
8
why?
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q*0
9
我自己的切身体会也感觉到这个系统不科学,首先就不能保证几个plasmids进入同一个
细胞。

【在 m******5 的大作中提到】
: 我也不大懂这个系统,借地问两句,听说现在有一种说法是这种实验如果作为主体很容
: 易被打回来,因为不是很科学的系统。 好文章现在这种实验都是藏在一个小pannel里
: 佐证一下

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m*d
10
终于进去了,这个如果能拿到那15%,最后才是99,否则就是116

【在 k*****o 的大作中提到】
: why?
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b*8
11
顶楼主,我做dual luciferase reporter好久了,也碰到跟你一模一样的问题。我感觉
这套系统真的很不stable,因此不是很reliable,那些通过dual luciferase reporter
就能找到一个关键的cis elenmentary sequences的paper,让我看的好生羡慕和佩服啊
,我自己做promoter和3‘UTR的dual luciferase reporter,出来的数据从来都是忽高
忽低的,就算有差异,也只有40%左右,根本做不到人家paper上的那么significantly
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q*0
12
说实话,我现在就是在重复一个paper的结果,用的是一模一样的试验系统(除培养基
brand),但就是重复不出来,我的也是忽高忽低,一点也不consistency.真是纳闷的很呢,
请这方面有经验的高人指导一下吧,怎样做出稳定的数据呢?

reporter
significantly

【在 b**********8 的大作中提到】
: 顶楼主,我做dual luciferase reporter好久了,也碰到跟你一模一样的问题。我感觉
: 这套系统真的很不stable,因此不是很reliable,那些通过dual luciferase reporter
: 就能找到一个关键的cis elenmentary sequences的paper,让我看的好生羡慕和佩服啊
: ,我自己做promoter和3‘UTR的dual luciferase reporter,出来的数据从来都是忽高
: 忽低的,就算有差异,也只有40%左右,根本做不到人家paper上的那么significantly
: 。

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z*i
13
我们主要是做细胞方面的东西,reporter assay也做的比较多,经常会遇到你说的这种
情况,我个人觉得是transfection的影响,就是用空质粒补平了,也会出现。有这种情
况,在转染试剂一定量得情况下,共转两个质粒,一个质粒单转+空载体补平,你会发
现共转的表达强。
所以需要用其它的质粒去normalize。一般这种实验不是主要data,重复几次结果一致
就可以了。

【在 q**********0 的大作中提到】
: 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
: )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
: efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
: 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
: 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
: 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
: transfection efficiency consistency更好?

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z*i
14
你可以做IF染色看一下就知道了,基本上都是共转的,虽然其中的原理并不知道,所以
这个问题不用担心。
我们做stable cell lines的时候,载体上并没有抗性基因,就是共转一个抗性基因,
然后用药去筛,挑几个克隆,90%以上的都能表达。

【在 q**********0 的大作中提到】
: 我自己的切身体会也感觉到这个系统不科学,首先就不能保证几个plasmids进入同一个
: 细胞。

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B*o
15
我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞
,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的

【在 q**********0 的大作中提到】
: 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
: )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
: efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
: 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
: 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
: 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
: transfection efficiency consistency更好?

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b*8
16

你这个方法也是解决问题的一个办法,不过如果表达的外源蛋白对细胞的增殖有影响的
话,最终导致细胞数不一致,所以提取的总蛋白量也不一致,这样还可以来做
normalization吗?另外你这里说的蛋白量是蛋白浓度吗?还是其他?

【在 B******o 的大作中提到】
: 我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞
: ,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的

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B*o
17
第一次转染的时候用的reporter plasmid,reseed时候所有well里已经转染的细胞数是
一致的。第二次转染的时候再转你的transcription factor,即使它会促进细胞增殖,
我觉得不会对结果有多大影响,毕竟你的TF如果activate luciferase expression,差
别那是相当大(suppose你24 or 48hr收样品).细胞增殖的过程实际是你的vector在细胞
里被稀释过程,按照你的说法control background luciferase是应该降低的,如果在
这种情况下你能看到明显的activation,那一定是真的对吧
normalization可以用蛋白浓度(前提是上一样的量),和用上样的总蛋白量其实是一样的
道理
只是俺的拙见

【在 b**********8 的大作中提到】
:
: 你这个方法也是解决问题的一个办法,不过如果表达的外源蛋白对细胞的增殖有影响的
: 话,最终导致细胞数不一致,所以提取的总蛋白量也不一致,这样还可以来做
: normalization吗?另外你这里说的蛋白量是蛋白浓度吗?还是其他?

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q*0
18
谢谢回复!我也正想作个IF试试,只是很好奇,为什么所有plasmid倾向进入同一个细
胞。

【在 z********i 的大作中提到】
: 你可以做IF染色看一下就知道了,基本上都是共转的,虽然其中的原理并不知道,所以
: 这个问题不用担心。
: 我们做stable cell lines的时候,载体上并没有抗性基因,就是共转一个抗性基因,
: 然后用药去筛,挑几个克隆,90%以上的都能表达。

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q*0
19
谢谢回复!如果先将报告基因转染,在reseed细胞时,该plasmid可能会丢失的,又怎
么能观察到目的蛋白对报告基因启动子的影响呢?况且如果不同时转染的话,怎么能保
证两个plasmids进入同一个细胞呢?

【在 B******o 的大作中提到】
: 我觉得你如果对共转染的数据不是很有信心的话,可以先转一个质粒,然后reseed细胞
: ,再转你要表达的蛋白。读值的时候用蛋白量来normalization。这样也是可以的

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r*d
20
我也被同样的问题困扰。。
我不用转染TF,只是加药。。结果加了药以后renilla的读数成比例的上升,导致
firefly/renilla的比例还是不变甚至下降。我看到有些CELL paper,就直接做firefly,
不做renilla...

但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低

【在 q**********0 的大作中提到】
: 谢谢回复!如果先将报告基因转染,在reseed细胞时,该plasmid可能会丢失的,又怎
: 么能观察到目的蛋白对报告基因启动子的影响呢?况且如果不同时转染的话,怎么能保
: 证两个plasmids进入同一个细胞呢?

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W*9
21
use B=gal as control

【在 q**********0 的大作中提到】
: 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
: )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
: efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
: 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
: 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
: 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
: transfection efficiency consistency更好?

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w*e
22
我前段时间刚遇到过同样的问题。换成CMV promoter的renilla 会好很多。个人认为
我们研究的蛋白对TK promoter 有一定的特异激活作用。希望对你有帮助。

【在 q**********0 的大作中提到】
: 最近用共转染实验检测一蛋白对某promoter(firefly luciferase reporter
: )的激活作用。按照惯例,用Renilla Luciferase (TK promoter)作transfection
: efficiency control,但确发现Renilla control老是和firefly成比例的增高或降低,
: 查文献,没有任何线索表明会TK promoter被我们所调查的蛋白激活,以前用共转染实
: 验检测另一蛋白也遇到相似的问题,似乎这种体外表达的蛋白对任何一种promoter都有
: 非特异的激活or抑制,不知版上同仁是否遇到同样问题?用其他什么办法控制
: transfection efficiency consistency更好?

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f*n
23
我做过一次,制备了个稳定转染的细胞系(REPORT和目的质粒双转染)。
问题是只能用很短时间,然后数据就误差很大很大了。
是不是双转染不稳定,只能维持很短时间呢?
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y*6
24
Use CMV-gal as control.
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q*0
25
谢谢以上各位的回复。我也正想用CMV-Reilla试试,希望它不受目的蛋白的影响。
我们转染的目的蛋白和报告基因都是瞬时表达体系,不会整合进宿主基因。所以变异可
能还来自实验系统本身。对于稳定转染的细胞系,是否转染的目的蛋白和报告基因已经
丢失掉?
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