菜鸟发包子求教：如何看特定的一段氨基酸序列在蛋白质结构里的位置？# Biology - 生物学
x*o
1 楼
本来我以为别人都送祝福，只有她是个难得代表大众说实话的好人，会痛批小三和渣男的
金姐最近的言论有点反常，本来觉得她是娱乐圈少数天不怕地不怕想说什么说什么的人
金姐最近的言论有点反常，本来觉得她是娱乐圈少数天不怕地不怕想说什么说什么的人
H*7
2 楼
o*e
3 楼
好几天了。是不是因为六四？
N*w
4 楼
IBM develops 'instantaneous' memory, 100x faster than flash
http://www.engadget.com/2011/06/30/embargo-ibm-develops-instant
This time it's a new kind of phase change memory (PCM) that reads and writes
100 times faster than flash, stays reliable for millions of write-cycles (
as opposed to just thousands with flash), and is cheap enough to be used in
anything from enterprise-level servers all the way down to mobile phones.
http://www.engadget.com/2011/06/30/embargo-ibm-develops-instant
This time it's a new kind of phase change memory (PCM) that reads and writes
100 times faster than flash, stays reliable for millions of write-cycles (
as opposed to just thousands with flash), and is cheap enough to be used in
anything from enterprise-level servers all the way down to mobile phones.
s*n
5 楼
知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
多谢了先！
蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
多谢了先！
d*d
6 楼
图？
【在 H******7 的大作中提到】
【在 H******7 的大作中提到】
N*w
7 楼
test chip about 400Kbits... 50KB hoho
Using that technique, the IBM scientists were able to mitigate drift and
demonstrate long- term retention of bits stored in a subarray of 200,000
cells of their PCM test chip, fabricated in 90-nanometer CMOS technology.
Using that technique, the IBM scientists were able to mitigate drift and
demonstrate long- term retention of bits stored in a subarray of 200,000
cells of their PCM test chip, fabricated in 90-nanometer CMOS technology.
p*s
8 楼
我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
s*s
9 楼
it's not the first time, IBM release some news about something like this.
lol
lol
f*e
10 楼
use rasmol
open molecule
(in console)
select 103-107 (if the segment is AA 103-107)
color red
then you can see the segment colored in red, then you can tell
open molecule
(in console)
select 103-107 (if the segment is AA 103-107)
color red
then you can see the segment colored in red, then you can tell
a*e
11 楼
这东西电流不小的说
writes
in
【在 N****w 的大作中提到】
: IBM develops 'instantaneous' memory, 100x faster than flash
: http://www.engadget.com/2011/06/30/embargo-ibm-develops-instant
: This time it's a new kind of phase change memory (PCM) that reads and writes
: 100 times faster than flash, stays reliable for millions of write-cycles (
: as opposed to just thousands with flash), and is cheap enough to be used in
: anything from enterprise-level servers all the way down to mobile phones.
writes
in
【在 N****w 的大作中提到】
: IBM develops 'instantaneous' memory, 100x faster than flash
: http://www.engadget.com/2011/06/30/embargo-ibm-develops-instant
: This time it's a new kind of phase change memory (PCM) that reads and writes
: 100 times faster than flash, stays reliable for millions of write-cycles (
: as opposed to just thousands with flash), and is cheap enough to be used in
: anything from enterprise-level servers all the way down to mobile phones.
s*n
12 楼
你可以下载一个3D structure的viewer，如PyMol, foldit都可以，导入你的蛋白A的结
构，然后显示那段序列就可以了。
构，然后显示那段序列就可以了。
j*x
13 楼
有一种可能：
Induced Conformational Change
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
Induced Conformational Change
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
s*n
14 楼
如果tunnel算内部的话...
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
z*8
15 楼
怎么预测两个蛋白可能相互作用？ 谢谢！
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
j*x
16 楼
bioinfor目前的未解难题之一，各种水这么多年倒是来来回回灌了很多，但结果基本靠蒙
【在 z********8 的大作中提到】
: 怎么预测两个蛋白可能相互作用？ 谢谢！
【在 z********8 的大作中提到】
: 怎么预测两个蛋白可能相互作用？ 谢谢！
s*e
17 楼
有结构的蛋白好办，结构没发表的蛋白还是靠生化实验证据吧，计算恐怕还是不可靠的
n*7
18 楼
知道结构吗？
知道的话，直接算下solvent accessible area
不知道就只能根据seq预测了
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
知道的话，直接算下solvent accessible area
不知道就只能根据seq预测了
【在 s********n 的大作中提到】
: 知道protein A的一段氨基酸序列可能和protein B相结合，但是不知道这段氨基酸是在
: 蛋白的内部，还是暴露在表面。请问那个网站可以查询？能具体说一下如何操作么？
: 多谢了先！
s*n
19 楼
知道结构，在pubmed上能看到。怎么算啊？
多谢！
【在 n******7 的大作中提到】
: 知道结构吗？
: 知道的话，直接算下solvent accessible area
: 不知道就只能根据seq预测了
多谢！
【在 n******7 的大作中提到】
: 知道结构吗？
: 知道的话，直接算下solvent accessible area
: 不知道就只能根据seq预测了
s*n
20 楼
哦，对不起啊，我没说清楚，是预测的两个蛋白可能结合，初步的生化实验也证实了，
现在就是想确定是哪段序列。用软件预测是有两段可能结合，我不知道它们是不是在蛋
白内部。
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
现在就是想确定是哪段序列。用软件预测是有两段可能结合，我不知道它们是不是在蛋
白内部。
A
【在 p****s 的大作中提到】
: 我就不要包子了，就有一个问题，既然能和另一个蛋白结合，那这段序列怎么可能在A
: 蛋白内部呢？表面积多少算内部呀？
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