系统生物学大牛们zz# Biology - 生物学
i*g
1 楼
http://loyalyang.blog.163.com/blog/static/164764085201110240388
系统生物学大牛们
2011-11-24 12:38:08| 分类: 默认分类 |字号 订阅
这个推荐给以后想做系统生物学的同学,大概是我这两年半的时间里,看过的一些文章
的通讯作者。因为系统生物学本身暂时没有一个特别固定的研究套路,但是会有几个比
较有前途的方向,list里面的这些人大都是系统生物学领域里提出过很多新方法和新想
法的人,当然系统生物学并不是一个新的学科,只是系统生物学这个名词出现于1999年
左右,因为目前深入到分子水平以后,生物系统的复杂性超出人们的想象。所以目前我
们所说的系统生物学只是处于起始阶段,有很多人提出了很多种观点和研究方法,也有
很多人风光一时,但是后来又被时代的马车抛弃了。
鉴于我水平有限,这个只是介绍一下我知道的一些实验室,大部分是通过读文章了解的
,所以应该也比较有限,也许会涉及到一些Synthetic Biology的,不会太多。
Leroy [email protected]
此人就是第一个系统生物学研究所的所长,现在貌似做董事去了。。。Hood是比较早提
出系统生物学概念的人,追求高通量技术。。。不过我认为这个太依赖于技术的发展了
,看高通量技术何时能够高精度的quantitatively测量生物系统再说。。。Hood最近好
像在搞microfluidic方面的东西,他很有商业头脑,diagnostic是一个利润非常大的领
域,ISB站在前端。。。
类似的还有
Douglas [email protected]
Micheal [email protected]
* Tony [email protected]
这个并没有特别强调过systems biology的概念,但是做的都是高通量的研究,而且主
功信号转导方向。。。有很多重要的结果,比如最近的那个信号转到系统是以domain为
基础的进化的论文,在science signaling上的
Stanislas [email protected]
此人及其牛,是因为他座下出了三个牛人,下面会说。。。这个mitbbs上有人说他天才
级人物。。。
这三个人物分别是:
* Micheal [email protected]
* Uri [email protected] Institute
Peter [email protected]
这三个人都是他的弟子,尤其是前两个在系统生物学里面做的风声水起,虽然师出同门
但是做的研究方向却不同,而且三个人的研究方向是三个philosophically different
areas…而且这三个方向都是源于Stanislas的研究领域
跟Peter Swain相似的研究方向的是
* Johan [email protected]
这个人是数学出身,曾在乌普萨拉大学一年拿了数学和生物的双硕士学位然后在剑桥读
的博士,普林斯顿做的薄厚,在普林斯顿的时候,一个人发表了那片 summing up the
noise in gene network。。。一篇数学文章发表在Nature。基本上所有做
stochasticity in biological systems的人都会知道他了。不过现在在Harvard比较受
限于数学背景,做试验要跟其他lab合作,很不爽,现在在招生物背景的人,估计想实
验理论两手抓。。。Peter Swain跟他是同样的处境而且做的方向比较相近
* Sunney [email protected]
Sunney Xie 是北大物理出来的,非常牛的一个人,做单分子荧光的,不要跟我辩论单
分子荧光跟系统生物学有什么关系,囧。。。这个谢晓亮(他的中文名)算是生物光学
领域里的执牛耳者了。。。具体可以去看一下他的文章,实验,技术,理论。。。各个
都是牛X得很,他不仅做单细胞单分子实验研究生物系统的dynamics,也做物理仪器方
面的光学实验研究,还有生物大分子动力学方面的理论研究。。。对这个人仰慕的一塌
糊涂。。。确实是牛人,一个人居然在三个领域都如此精通而且做到最前沿,,,无语
了。
Zhuang [email protected] 这个跟Sunney Xie是相似领域,不过专注于RNA
* James [email protected]
这个人么我就不介绍了,也是很风云的一个人物
Jeff [email protected] 是他的弟子
Bernhard [email protected]
这个人原来做metabolism二十多年前就一直认为整个代谢系统应该从整体的角度上考虑
,他那个flux balance analysis解决代谢系统很有效。。。
* Adam [email protected] Berkeley
* Frances H. [email protected]
非常elegant的一个大婶(从照片上看),做的研究也很elegant。。。而且这个大婶桃
李满天下,有二三十个现在在做PI。。。里面我知道的一个是
* Linchong [email protected] 是Arnold的弟子,
大学毕业那年的暑假去北大听讲座就有他讲,当时还跟他谈了几句,很nice 的一个人
* van [email protected]
不说了,牛的一塌糊涂
** Wendell [email protected]
下面隆重介绍我认为最make sense的一个人的研究,Wendell Lim原来是做structure的
,然后focus在信号转导领域,他做过一系列的scaffold protein的研究,发表的那些
文章perfect,而且他最近的一篇review讲的想法就是我原来一直希望能够出现的。。
。以后详尽介绍一下Wendell Lim的研究工作。
PS:给陈JQ同学推荐一下Tony Pawson和Wendell Lim的研究工作,他们两个做信号转导
,但是并不是单纯的阐明某个蛋白的机制,怎么影响其他蛋白,而是想的是更深层次的
问题,可以详细的看看他们的文章。。。
备注:1)这个list不全阿,有很多其他国家的都没有考虑进去ETH就貌似有两位做的很
出色。
2)其他还有很多方面没有考虑进去。。。以后有机会了再慢慢介绍?.
3)打星号的如果感兴趣,可以追踪他们实验室的研究进展,会很有收获。
系统生物学大牛们
2011-11-24 12:38:08| 分类: 默认分类 |字号 订阅
这个推荐给以后想做系统生物学的同学,大概是我这两年半的时间里,看过的一些文章
的通讯作者。因为系统生物学本身暂时没有一个特别固定的研究套路,但是会有几个比
较有前途的方向,list里面的这些人大都是系统生物学领域里提出过很多新方法和新想
法的人,当然系统生物学并不是一个新的学科,只是系统生物学这个名词出现于1999年
左右,因为目前深入到分子水平以后,生物系统的复杂性超出人们的想象。所以目前我
们所说的系统生物学只是处于起始阶段,有很多人提出了很多种观点和研究方法,也有
很多人风光一时,但是后来又被时代的马车抛弃了。
鉴于我水平有限,这个只是介绍一下我知道的一些实验室,大部分是通过读文章了解的
,所以应该也比较有限,也许会涉及到一些Synthetic Biology的,不会太多。
Leroy [email protected]
此人就是第一个系统生物学研究所的所长,现在貌似做董事去了。。。Hood是比较早提
出系统生物学概念的人,追求高通量技术。。。不过我认为这个太依赖于技术的发展了
,看高通量技术何时能够高精度的quantitatively测量生物系统再说。。。Hood最近好
像在搞microfluidic方面的东西,他很有商业头脑,diagnostic是一个利润非常大的领
域,ISB站在前端。。。
类似的还有
Douglas [email protected]
Micheal [email protected]
* Tony [email protected]
这个并没有特别强调过systems biology的概念,但是做的都是高通量的研究,而且主
功信号转导方向。。。有很多重要的结果,比如最近的那个信号转到系统是以domain为
基础的进化的论文,在science signaling上的
Stanislas [email protected]
此人及其牛,是因为他座下出了三个牛人,下面会说。。。这个mitbbs上有人说他天才
级人物。。。
这三个人物分别是:
* Micheal [email protected]
* Uri [email protected] Institute
Peter [email protected]
这三个人都是他的弟子,尤其是前两个在系统生物学里面做的风声水起,虽然师出同门
但是做的研究方向却不同,而且三个人的研究方向是三个philosophically different
areas…而且这三个方向都是源于Stanislas的研究领域
跟Peter Swain相似的研究方向的是
* Johan [email protected]
这个人是数学出身,曾在乌普萨拉大学一年拿了数学和生物的双硕士学位然后在剑桥读
的博士,普林斯顿做的薄厚,在普林斯顿的时候,一个人发表了那片 summing up the
noise in gene network。。。一篇数学文章发表在Nature。基本上所有做
stochasticity in biological systems的人都会知道他了。不过现在在Harvard比较受
限于数学背景,做试验要跟其他lab合作,很不爽,现在在招生物背景的人,估计想实
验理论两手抓。。。Peter Swain跟他是同样的处境而且做的方向比较相近
* Sunney [email protected]
Sunney Xie 是北大物理出来的,非常牛的一个人,做单分子荧光的,不要跟我辩论单
分子荧光跟系统生物学有什么关系,囧。。。这个谢晓亮(他的中文名)算是生物光学
领域里的执牛耳者了。。。具体可以去看一下他的文章,实验,技术,理论。。。各个
都是牛X得很,他不仅做单细胞单分子实验研究生物系统的dynamics,也做物理仪器方
面的光学实验研究,还有生物大分子动力学方面的理论研究。。。对这个人仰慕的一塌
糊涂。。。确实是牛人,一个人居然在三个领域都如此精通而且做到最前沿,,,无语
了。
Zhuang [email protected] 这个跟Sunney Xie是相似领域,不过专注于RNA
* James [email protected]
这个人么我就不介绍了,也是很风云的一个人物
Jeff [email protected] 是他的弟子
Bernhard [email protected]
这个人原来做metabolism二十多年前就一直认为整个代谢系统应该从整体的角度上考虑
,他那个flux balance analysis解决代谢系统很有效。。。
* Adam [email protected] Berkeley
* Frances H. [email protected]
非常elegant的一个大婶(从照片上看),做的研究也很elegant。。。而且这个大婶桃
李满天下,有二三十个现在在做PI。。。里面我知道的一个是
* Linchong [email protected] 是Arnold的弟子,
大学毕业那年的暑假去北大听讲座就有他讲,当时还跟他谈了几句,很nice 的一个人
* van [email protected]
不说了,牛的一塌糊涂
** Wendell [email protected]
下面隆重介绍我认为最make sense的一个人的研究,Wendell Lim原来是做structure的
,然后focus在信号转导领域,他做过一系列的scaffold protein的研究,发表的那些
文章perfect,而且他最近的一篇review讲的想法就是我原来一直希望能够出现的。。
。以后详尽介绍一下Wendell Lim的研究工作。
PS:给陈JQ同学推荐一下Tony Pawson和Wendell Lim的研究工作,他们两个做信号转导
,但是并不是单纯的阐明某个蛋白的机制,怎么影响其他蛋白,而是想的是更深层次的
问题,可以详细的看看他们的文章。。。
备注:1)这个list不全阿,有很多其他国家的都没有考虑进去ETH就貌似有两位做的很
出色。
2)其他还有很多方面没有考虑进去。。。以后有机会了再慢慢介绍?.
3)打星号的如果感兴趣,可以追踪他们实验室的研究进展,会很有收获。