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ITC （等温滴定量热法）请教

ITC （等温滴定量热法）请教# Biology - 生物学

h*e2012-06-11 07:06

1 楼

毕业前待的center发信来告诉我要清除我的账户和affiliation，但是我在准备发表之
前的工作，发现需要做一些additional 的simulation，需要比较强大的cluster。现在
工作的地方没有这个条件，能跟原来的老板说让他给我authorization用原来center的
cluster让我跑一个星期的程序么？不知道这种要求和不合理。以为会一直保留我的账
户，就想着真正准备用的时候说一声，但看来人家要把我cut off了所以我想不问可能
就比较麻烦了。

a*y2012-06-11 07:06

2 楼

求教？

a*e2012-06-11 07:06

3 楼

x220,原来能用6hrs,现在4hr不到就不行了
看了一下，175cycle,电量只有设计值70%了
NND,这个充电上下限设什么好？

s*l2012-06-11 07:06

4 楼

ITC 可以用来检测蛋白之间的相互作用，计算出结合常数，但是我的两个蛋白之间会发
生反应，就是酶和作用底物，酶会降解作用底物，但是我又想测量酶和底物的结合常数
，不知道 ITC 能不能用，或是有什么其他的方法。请大家不吝赐教！谢谢！

x*52012-06-11 07:06

5 楼

当然可以
我师弟就这么保留账户了
而且你发paper肯定要挂你原老板的名，所以没看出来有什么不乐意的
当然你得提前和人家说明，不然数据删除了再恢复就麻烦了

【在 h******e 的大作中提到】

: 毕业前待的center发信来告诉我要清除我的账户和affiliation，但是我在准备发表之
: 前的工作，发现需要做一些additional 的simulation，需要比较强大的cluster。现在
: 工作的地方没有这个条件，能跟原来的老板说让他给我authorization用原来center的
: cluster让我跑一个星期的程序么？不知道这种要求和不合理。以为会一直保留我的账
: 户，就想着真正准备用的时候说一声，但看来人家要把我cut off了所以我想不问可能
: 就比较麻烦了。

s*i2012-06-11 07:06

6 楼

ttpod

[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]

【在 a*****y 的大作中提到】

: 求教？

B*e2012-06-11 07:06

7 楼

基本正常

【在 a***e 的大作中提到】

: x220,原来能用6hrs,现在4hr不到就不行了
: 看了一下，175cycle,电量只有设计值70%了
: NND,这个充电上下限设什么好？

p*u2012-06-11 07:06

8 楼

itc能否用，还要看你的结合常数大小，如果结合常数太弱就不行，还有你的蛋白质浓
度也很重要，还要保证蛋白质不变性，另外滴定的那个ligand不能太粘否则剂量就不准
了。你的这个情况基本不能用itc，可以考虑spr（表面质子共振），快速便宜还方便。
就是在chip上连接你的蛋白质，然后看激光的折射率变化，如果有binding那折射率就
变化了，根据变化可以计算出结合常数。

h*e2012-06-11 07:06

9 楼

多谢！

j*d2012-06-11 07:06

10 楼

duomi

【在 a*****y 的大作中提到】

: 求教？

r*e2012-06-11 07:06

11 楼

lenovo的电池是真烂
当初的x60随机6芯电池，不到一年就挂了
赶上recall，换了一块新的，又是不到一年就不行了，只能撑一个小时

【在 a***e 的大作中提到】

: x220,原来能用6hrs,现在4hr不到就不行了
: 看了一下，175cycle,电量只有设计值70%了
: NND,这个充电上下限设什么好？

p*u2012-06-11 07:06

12 楼

也许也能用itc，不过可能要费些事儿，因为你要满足itc的s曲线的种种苛刻要求。

a92012-06-11 07:06

13 楼

基本上所有电池都这样吧。

【在 r*******e 的大作中提到】

: lenovo的电池是真烂
: 当初的x60随机6芯电池，不到一年就挂了
: 赶上recall，换了一块新的，又是不到一年就不行了，只能撑一个小时

b*y2012-06-11 07:06

14 楼

If binding is much faster than enzymatic activity, you can. However, it
normally takes up to a few hours to finish an ITC experiments. Not a whole
lot of enzymes are that lousy.
To do it right, you have to make an inactive mutant that doesn't perturb
substrate binding.
In M-M curve analysis, you can back up a term, Km, which is close to an
apparent KD.

s*c2012-06-11 07:06

15 楼

显然不是 lenovo的电池是出了名的烂过1年基本上就完蛋

【在 a9 的大作中提到】

: 基本上所有电池都这样吧。

i*02012-06-11 07:06

16 楼

co楼上的SPR，比ITC省蛋白。

s*p2012-06-11 07:06

17 楼

也没那么差
用过T40，X31，T61，T400，没有一台在一年以内电池挂了
09年的T400，现在391个充电cycle，4 cell电芯，现在省着点用，一个小时40分钟没问题

【在 s****c 的大作中提到】

: 显然不是 lenovo的电池是出了名的烂过1年基本上就完蛋

V*32012-06-11 07:06

18 楼

最关键你的结合必须有热效应
有些结合时没有热效应的
可以用dead mutant做，但是这个方法不是现在流行的

【在 s******l 的大作中提到】

: ITC 可以用来检测蛋白之间的相互作用，计算出结合常数，但是我的两个蛋白之间会发
: 生反应，就是酶和作用底物，酶会降解作用底物，但是我又想测量酶和底物的结合常数
: ，不知道 ITC 能不能用，或是有什么其他的方法。请大家不吝赐教！谢谢！

p*n2012-06-11 07:06

19 楼

My two yrs old E420 still have 2 hour battery life left. Originally it had 3
.5 hours.

p*u2012-06-11 07:06

20 楼

如果没有热效应，怎么会自发结合？随机碰撞吗？
用结合的热来克服熵值或者去溶剂能，然后最后也没有热效应，值得做不？
——————————————————————————————————————
对于酶反应最好不要用itc，但是，ITC可以做。并且可以求得Km Kcat deltaH.
仅仅用Km不知道能不能满足你的需要

【在 V**3 的大作中提到】

: 最关键你的结合必须有热效应
: 有些结合时没有热效应的
: 可以用dead mutant做，但是这个方法不是现在流行的

w*y2012-06-11 07:06

21 楼

放在车里面在太阳下面烤过么？热量是电池的大敌。

【在 a***e 的大作中提到】

: x220,原来能用6hrs,现在4hr不到就不行了
: 看了一下，175cycle,电量只有设计值70%了
: NND,这个充电上下限设什么好？