现在发文章还需要2套siRNA吗？# Biology - 生物学
C*S
1 楼
如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
function反证？
或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
function反证？
s*y
2 楼
如果是没有人用过的话是会有这个风险，
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
C*S
3 楼
如果这个基因在我第一篇文章用了2个sirna来证明，第二篇文章可以只用一个了？谢谢。
【在 s******y 的大作中提到】
: 如果是没有人用过的话是会有这个风险，
【在 s******y 的大作中提到】
: 如果是没有人用过的话是会有这个风险，
s*y
4 楼
可以。
如果还是同一个基因的话。
谢。
【在 C**S 的大作中提到】
: 如果这个基因在我第一篇文章用了2个sirna来证明，第二篇文章可以只用一个了？谢谢。
如果还是同一个基因的话。
谢。
【在 C**S 的大作中提到】
: 如果这个基因在我第一篇文章用了2个sirna来证明，第二篇文章可以只用一个了？谢谢。
C*S
5 楼
谢谢。
【在 s******y 的大作中提到】
: 可以。
: 如果还是同一个基因的话。
:
: 谢。
【在 s******y 的大作中提到】
: 可以。
: 如果还是同一个基因的话。
:
: 谢。
m*m
6 楼
我用了两套siRNA，一个reviewer还说可能有offtarget，没办法KO，只能再加shRNA。
有些人非常喜欢overexpression，总觉得这个东西有些不可靠。尤其对那些体内组成型
高表达的genes，更有些奇怪了
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
有些人非常喜欢overexpression，总觉得这个东西有些不可靠。尤其对那些体内组成型
高表达的genes，更有些奇怪了
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
S*s
7 楼
一般至少要3 different oligos才能自己放心
siRNA的off target是非常严重的
最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
siRNA的off target是非常严重的
最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
【在 C**S 的大作中提到】
: 如题。现在的reviewer还会揪着这个问题不放吗？
: 或者是可以一个siRNA来做loss of function，但必须有overexpression来做gain of
: function反证？
g*5
8 楼
can't agree more...
recently found 2 oligo have some effects on one proteins expression,
but further study showed other 5 oligoes could not have similar results...
【在 S*********s 的大作中提到】
: 一般至少要3 different oligos才能自己放心
: siRNA的off target是非常严重的
: 最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
: shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
recently found 2 oligo have some effects on one proteins expression,
but further study showed other 5 oligoes could not have similar results...
【在 S*********s 的大作中提到】
: 一般至少要3 different oligos才能自己放心
: siRNA的off target是非常严重的
: 最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
: shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
C*S
9 楼
siRNA和shRNA在off target的问题上是不一样吗？
【在 S*********s 的大作中提到】
: 一般至少要3 different oligos才能自己放心
: siRNA的off target是非常严重的
: 最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
: shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
【在 S*********s 的大作中提到】
: 一般至少要3 different oligos才能自己放心
: siRNA的off target是非常严重的
: 最严谨的是shRNA KD,然后rescue with ectopic expression
: shRNA也需要2-3个independent clone to exclude clonal effect
l*1
10 楼
stable knockdown shRNA better performance from less off-target per cent age
details please refer
Klinghoffer RA at al. (2010)
Reduced seed region-based off-target activity with lentivirus-mediated RNAi.
RNA. 16: 879-84.
PubMed link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20348445
【在 C**S 的大作中提到】
: siRNA和shRNA在off target的问题上是不一样吗？
details please refer
Klinghoffer RA at al. (2010)
Reduced seed region-based off-target activity with lentivirus-mediated RNAi.
RNA. 16: 879-84.
PubMed link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20348445
【在 C**S 的大作中提到】
: siRNA和shRNA在off target的问题上是不一样吗？
g*5
11 楼
I used 7 oligoes on one gene...
C*S
12 楼
那最后怎么挑出用哪两个的？怎么判定没选中的siRNA是有非特异性knockdown的？
【在 g*********5 的大作中提到】
: I used 7 oligoes on one gene...
【在 g*********5 的大作中提到】
: I used 7 oligoes on one gene...
g*5
13 楼
4个上升3个下降.
md,很是不相信siRNA了
md,很是不相信siRNA了
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