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DNA高通量测序发展那么快,蛋白质怎么没进步?
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DNA高通量测序发展那么快,蛋白质怎么没进步?# Biology - 生物学
p*l
1
今年6月递交了一个R15到一个NIH的institute,10月份,我是否可以递交另一个R15到
另一个insitute?不同的proposal。第一个的review要到11月份才知道。是否允许?谢
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a*a
2
保险是可以100%COVER体检的,我在想对于儿童是不是也应该每年去体检一次,上次是
12月份去的,偶尔有点发烧咳嗽都是自己在家解决了。
这里的爸爸妈妈都是每年都带孩子去体检吗?IF YES,是PHYSICAL EXAM 还是
ANNUAL CHECK?
谢谢了
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o*o
3
如题。
版本是1。10。1
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C*4
4
二代测序,现在你要是不做这种实验,就落伍了。
可是蛋白质还是停留在质谱;即使有了定量质谱。
可是高通量分析蛋白质,灵敏度、更简单的定量手段 都没有进步!
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n*g
5
问PD吧,
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w*e
6
是PHYSICAL EXAM 还是
ANNUAL CHECK?
有区别吗?
你难道不想看看才4岁的孩子各方面发展如何?比如,身高体重百分比?
当然去。话说任何年龄都应该每年查一次,虽然在20来岁时好像都健康得没必要。
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t*b
7
形势终于要变了,公司的策略也在准备随之改动,优质内容要分出去做独立收费品牌(
白菜价),vego这个牌子只是作为一个sample app,不推了。
现在的盒子市场马上就要变天,广电新的政令已出,tvpad之类的也被告倒了,该到正
版喘口气的时候了。
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s*y
8
因为DNA/RNA 有polymerase, 但是蛋白没有

【在 C********4 的大作中提到】
: 二代测序,现在你要是不做这种实验,就落伍了。
: 可是蛋白质还是停留在质谱;即使有了定量质谱。
: 可是高通量分析蛋白质,灵敏度、更简单的定量手段 都没有进步!

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x*i
9
our insurance covers 1 well child visit per year. sick visits are another
story

【在 a*****a 的大作中提到】
: 保险是可以100%COVER体检的,我在想对于儿童是不是也应该每年去体检一次,上次是
: 12月份去的,偶尔有点发烧咳嗽都是自己在家解决了。
: 这里的爸爸妈妈都是每年都带孩子去体检吗?IF YES,是PHYSICAL EXAM 还是
: ANNUAL CHECK?
: 谢谢了

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o*o
10
这么说vego从现在起已经不可能看所有的电视了。
是不是新的收费品牌还是和vego一样?什么时候可以使用?怎么收费?

【在 t**b 的大作中提到】
: 形势终于要变了,公司的策略也在准备随之改动,优质内容要分出去做独立收费品牌(
: 白菜价),vego这个牌子只是作为一个sample app,不推了。
: 现在的盒子市场马上就要变天,广电新的政令已出,tvpad之类的也被告倒了,该到正
: 版喘口气的时候了。

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C*4
11
搞技术流的人,怎么不开发新的能高通量、定量(不需标记)、灵敏度高的分析蛋白质
的技术
要是有这样的技术,得能和二代测序一样,大大推动发展吧

【在 s******y 的大作中提到】
: 因为DNA/RNA 有polymerase, 但是蛋白没有
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a*l
12
大了一般每年生日之后去吧
上学也要医生的体检结果呀
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o*o
13
这么说vego从现在起已经不可能看所有的电视了。
是不是新的收费品牌还是和vego一样?什么时候可以使用?怎么收费?

【在 t**b 的大作中提到】
: 形势终于要变了,公司的策略也在准备随之改动,优质内容要分出去做独立收费品牌(
: 白菜价),vego这个牌子只是作为一个sample app,不推了。
: 现在的盒子市场马上就要变天,广电新的政令已出,tvpad之类的也被告倒了,该到正
: 版喘口气的时候了。

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s*y
14
不知道啊,可能是难度太高吧。
目前大部分人都是在研究Mass Spec. 但是我觉得或许突破会在single-molecule
Edman degradation这里出现。

【在 C********4 的大作中提到】
: 搞技术流的人,怎么不开发新的能高通量、定量(不需标记)、灵敏度高的分析蛋白质
: 的技术
: 要是有这样的技术,得能和二代测序一样,大大推动发展吧

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l*a
15
我们是要的,就是什么病都没有也要打疫苗

【在 a*****a 的大作中提到】
: 保险是可以100%COVER体检的,我在想对于儿童是不是也应该每年去体检一次,上次是
: 12月份去的,偶尔有点发烧咳嗽都是自己在家解决了。
: 这里的爸爸妈妈都是每年都带孩子去体检吗?IF YES,是PHYSICAL EXAM 还是
: ANNUAL CHECK?
: 谢谢了

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t*b
16
目前还不好透漏太多,但大家会陆续看到浙江,央视这样的正版app出现在appletv,
firetv,samsung,vizio,lg,sony,xbox这些平台上。 价格也都是白菜价,几块钱。收费
但都是海外服务器,速度杠杠的。
全免费的盗版聚合app会消失。

【在 o**o 的大作中提到】
: 这么说vego从现在起已经不可能看所有的电视了。
: 是不是新的收费品牌还是和vego一样?什么时候可以使用?怎么收费?

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C*4
17
嗯嗯,我觉得MS已经到头了,不可能再有新的突破
你说的single molecule Edman degradation会是一个有前景的呀
还有其他的高通量、高灵敏度、定量的蛋白质分析技术在开发咩

【在 s******y 的大作中提到】
: 不知道啊,可能是难度太高吧。
: 目前大部分人都是在研究Mass Spec. 但是我觉得或许突破会在single-molecule
: Edman degradation这里出现。

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R*i
18
奇怪你们以前不做healthy baby/kid check up吗?
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d*r
19
有这个想法很好,不过浙江,央视这样的正版免费都没人看,收费就更没戏了。
这个变化也就是茶杯里的风暴,看电视的用代理照样看国内电视。

【在 t**b 的大作中提到】
: 目前还不好透漏太多,但大家会陆续看到浙江,央视这样的正版app出现在appletv,
: firetv,samsung,vizio,lg,sony,xbox这些平台上。 价格也都是白菜价,几块钱。收费
: 但都是海外服务器,速度杠杠的。
: 全免费的盗版聚合app会消失。

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a*x
20
我觉得主要是蛋白没有互补法则。。。
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l*r
21
当然要了,就是well check check之类的名字吧,你们有儿医吧,问一下。一直到18岁
还是16岁,都应该有的。
不光检查身高体重,还有语言,各种milestone观察。你有任何问题也可以问。赶紧预
约一下吧。
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t*b
22
什么内容收费能力强也请给我们推荐一下。多谢。
现在的免费的好找,是因为大量投资人在后面买单,但这个情况国内和国外都在变化。
比如现在能用的好多方式,其实说没就没的。

【在 d********r 的大作中提到】
: 有这个想法很好,不过浙江,央视这样的正版免费都没人看,收费就更没戏了。
: 这个变化也就是茶杯里的风暴,看电视的用代理照样看国内电视。

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C*4
23
嗯,是没法用二代测序技术的思想做蛋白质
但是不要局限于老的思想啊,打开思路 。。。

【在 a*****x 的大作中提到】
: 我觉得主要是蛋白没有互补法则。。。
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d*r
24
这个问题还真问倒我了,我要看的电视乐视或者优酷都有,没有碰到啥不能看非要付费
的。如果说要付费,我希望看到的是高清的节目,至少是真正的720p. 现在看国内的高
清还是卡,看YouTube上的所谓高清中文节目很多都是假高清。

【在 t**b 的大作中提到】
: 什么内容收费能力强也请给我们推荐一下。多谢。
: 现在的免费的好找,是因为大量投资人在后面买单,但这个情况国内和国外都在变化。
: 比如现在能用的好多方式,其实说没就没的。

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s*y
25

好像没有。。。主要是这块骨头太难啃。。。牛叉的人都跑去搞基因测序了
因为比较容易而且来钱快。

【在 C********4 的大作中提到】
: 嗯嗯,我觉得MS已经到头了,不可能再有新的突破
: 你说的single molecule Edman degradation会是一个有前景的呀
: 还有其他的高通量、高灵敏度、定量的蛋白质分析技术在开发咩

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t*b
26
我的意思可能没有说清楚:乐视和优酷上有的东西,其实很容易让他们过滤海外ip(他
们好多其实没海外版权),而且也很容易让绕过ip过滤的插件对某些内容失效。
海外独家的内容是assumption,真高清和海外流畅播放也是assumption。在这种前提下
,哪些内容观众更愿意花几块钱订阅?电视剧?电影?直播?体育?少儿?

【在 d********r 的大作中提到】
: 这个问题还真问倒我了,我要看的电视乐视或者优酷都有,没有碰到啥不能看非要付费
: 的。如果说要付费,我希望看到的是高清的节目,至少是真正的720p. 现在看国内的高
: 清还是卡,看YouTube上的所谓高清中文节目很多都是假高清。

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u*d
27
DNA到RNA 到蛋白质既是一个信息传递的过程,也是信号放大的过程。我倒是比较看好
单细胞质谱。
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t*h
28
一次性收费,还是按月收费?

【在 t**b 的大作中提到】
: 目前还不好透漏太多,但大家会陆续看到浙江,央视这样的正版app出现在appletv,
: firetv,samsung,vizio,lg,sony,xbox这些平台上。 价格也都是白菜价,几块钱。收费
: 但都是海外服务器,速度杠杠的。
: 全免费的盗版聚合app会消失。

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C*4
29
哎呀,那要是啃下来这块骨头,不得炸药奖,也能扬名立万啊

【在 s******y 的大作中提到】
:
: 好像没有。。。主要是这块骨头太难啃。。。牛叉的人都跑去搞基因测序了
: 因为比较容易而且来钱快。

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F*y
30
电视剧吧,老人来没别的爱好就喜欢追电视剧看。收费的也无所谓,希望支持
chromecast
少儿节目也不错,可以给小孩子学中文。电影什么的就算了,一来版权太贵,你们价格
也不好定,二来其他的source太多,随随便便就看到免费的了
综艺类都是直接上YouTube看电视台的官方channel,反而不觉得有必要

【在 t**b 的大作中提到】
: 我的意思可能没有说清楚:乐视和优酷上有的东西,其实很容易让他们过滤海外ip(他
: 们好多其实没海外版权),而且也很容易让绕过ip过滤的插件对某些内容失效。
: 海外独家的内容是assumption,真高清和海外流畅播放也是assumption。在这种前提下
: ,哪些内容观众更愿意花几块钱订阅?电视剧?电影?直播?体育?少儿?

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O*e
31
如果谁能啃下来,炸药奖是必然的了。难度太大但又太重要了。

【在 C********4 的大作中提到】
: 哎呀,那要是啃下来这块骨头,不得炸药奖,也能扬名立万啊
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g*g
32
如果真能卡死其他来源,
热门的影视,综艺应该有人愿意看
体育节目,除了中国自己的联赛(愿意花钱看的估计有限),其它的也不容易有海外播
放权吧,比如英超,西甲,欧冠,世界杯啥的,或者nba, nfl。

【在 t**b 的大作中提到】
: 我的意思可能没有说清楚:乐视和优酷上有的东西,其实很容易让他们过滤海外ip(他
: 们好多其实没海外版权),而且也很容易让绕过ip过滤的插件对某些内容失效。
: 海外独家的内容是assumption,真高清和海外流畅播放也是assumption。在这种前提下
: ,哪些内容观众更愿意花几块钱订阅?电视剧?电影?直播?体育?少儿?

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s*9
33
我们在做基于protein display和in situ DNA sequencing的single molecule protein
array。可以不用分离蛋白,throughput到~1 billion protein molecules/slide,
可以screen library against library。希望文章不久能出来。
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t*b
34
youtube上的电视台的官方channel其实好多也是我们公司在运作,更好控制:)
问题还是什么类内容用户更容易支付,请大家多给建议,我们花钱也更有针对性。针对
老人的我也一直比较看好。少儿类的也很好,但问题更多在于优质内容少。我家小孩除
了巧虎,儿歌,西游记别的都没给看。

【在 F********y 的大作中提到】
: 电视剧吧,老人来没别的爱好就喜欢追电视剧看。收费的也无所谓,希望支持
: chromecast
: 少儿节目也不错,可以给小孩子学中文。电影什么的就算了,一来版权太贵,你们价格
: 也不好定,二来其他的source太多,随随便便就看到免费的了
: 综艺类都是直接上YouTube看电视台的官方channel,反而不觉得有必要

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u*d
35
不太明白

protein

【在 s******9 的大作中提到】
: 我们在做基于protein display和in situ DNA sequencing的single molecule protein
: array。可以不用分离蛋白,throughput到~1 billion protein molecules/slide,
: 可以screen library against library。希望文章不久能出来。

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wu
36
说实在,没觉得海外中国用户想掏钱。
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s*y
37
他们文章还没有出来,恐怕不能说太多技术细节。
但是根据我的直觉,应该就是利用co-transcritonal translation 来读氨基酸。
这个在某些应用里是有意义的,但是,恐怕对于做posttranslational modification(
比方说磷酸化)的人没有太大帮助。

【在 u**********d 的大作中提到】
: 不太明白
:
: protein

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t*b
38
如果有免费的选择,美国的人也一样。但没得选了,情况就不一样了,所以这是我的问
题的前提。而且这种局面已经逐渐开始。视频行业的大家都想成netflix,不想学
youtube。

【在 wu 的大作中提到】
: 说实在,没觉得海外中国用户想掏钱。
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s*9
39
文章在revision中,在技术上很难几句话就说请。但是原理简单,就是in vitro
generate DNA barcoded proteins,用DNA barcodes识别蛋白。
In situ sequencing是NGS未来一个重要分支,可以分析cluster的pattern,提供
更丰富的信息。
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y*z
40
理想很丰满,现实很骨感
哪个视频网站不是一开始就想收费的?可是现在鲜有成功者
国外的监管比国内严吧?Kodi不是也活得挺好。
这一块的漏洞太多,想全堵上没那么容易,活雷锋国内国外都有不少,呵呵

【在 t**b 的大作中提到】
: 如果有免费的选择,美国的人也一样。但没得选了,情况就不一样了,所以这是我的问
: 题的前提。而且这种局面已经逐渐开始。视频行业的大家都想成netflix,不想学
: youtube。

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s*9
41
未来的应用是直接将cDNA library变成barcoded protein library,不用分离蛋白,一
次可以screen a whole proteome (>100,000 different proteins) with hundreds
of probes。
具体等文章出来后再说了。
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t*b
42
是的,肯定非常难。但既然netflix能活的非常好,大方向上肯定有机会。

【在 y**z 的大作中提到】
: 理想很丰满,现实很骨感
: 哪个视频网站不是一开始就想收费的?可是现在鲜有成功者
: 国外的监管比国内严吧?Kodi不是也活得挺好。
: 这一块的漏洞太多,想全堵上没那么容易,活雷锋国内国外都有不少,呵呵

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K*S
43
are you from Colorado?

【在 s******9 的大作中提到】
: 未来的应用是直接将cDNA library变成barcoded protein library,不用分离蛋白,一
: 次可以screen a whole proteome (>100,000 different proteins) with hundreds
: of probes。
: 具体等文章出来后再说了。

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d*w
44
我觉得cctv5之类的体育台直播,很少能找到好的,适合老人的简易的方法。
特别明年还要奥运,我觉得体育做好了,这个明年到时候会用户很多。

【在 t**b 的大作中提到】
: youtube上的电视台的官方channel其实好多也是我们公司在运作,更好控制:)
: 问题还是什么类内容用户更容易支付,请大家多给建议,我们花钱也更有针对性。针对
: 老人的我也一直比较看好。少儿类的也很好,但问题更多在于优质内容少。我家小孩除
: 了巧虎,儿歌,西游记别的都没给看。

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K*S
45
you can amplify DNA/RNA but not proteins. That's the key issue. If someone
can come up with a way to amplify proteins, s/he will be very rich.
High throughput: you can do thousands of MALDI-TOF in one day.
sensitivity: MRM constantly detect compounds with low atto-molar
concentration.
Quantitation: a handful of ways to do that. But you've gotta respect the
chemistry. For DNA/RNA, you only have a few different n.a. while for
proteins, you have 20 a.a.
Personally, I don't think high-throughput is the bottleneck now. It is how
you analyze the data. You can't even get high overlapping with DNA and RNA-
Seq, let alone integrate all the -omics data. In proteomics, ppl still dont'
know how to analyze thousands of proteins or phosphorylation events.

【在 C********4 的大作中提到】
: 二代测序,现在你要是不做这种实验,就落伍了。
: 可是蛋白质还是停留在质谱;即使有了定量质谱。
: 可是高通量分析蛋白质,灵敏度、更简单的定量手段 都没有进步!

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t*b
46
这个正版反而没机会。除了国内的体育,cctv5自己买的奥运节目版权都是只能国内放。

【在 d****w 的大作中提到】
: 我觉得cctv5之类的体育台直播,很少能找到好的,适合老人的简易的方法。
: 特别明年还要奥运,我觉得体育做好了,这个明年到时候会用户很多。

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s*9
47
其实楼主的问题我以前问过,当时没有什么讨论。再跟进一点想法:
高通量蛋白分析可以分in vivo(proteins in natural environment)和in vitro方法
。in vitro主要是protein array和Y2H,in vivo当然是MS。不用多说,各有明显优缺
点。
NGS的优点在于它是separation independent & single-molecule based。其他的
single-molecule技术都不能做high-throughput,原因是受限于limited fluorophores
。同理,蛋白分析能够也做到SM sensitivity和separation independent,将是true
breakthrough。
MS的优势很明显,但是sensitivity, throughput和cost-effectiveness都有瓶颈的。
所以in vivo基本无法做到single-molecule proteomics。但是对于in vitro,如果
protein被DNA barcoded(比如ribosome display),就可以嫁接到已有的NGS平台做
single-molecule proteomics。
就像1000刀human genome一样,未来也可能几百刀就能做de novo proteome analysis
,比如1)identify components in signaling pathways,2)biosynthetic pathways
for important compounds, or 3)large-scale analysis of human antigen-antibody
interactions...
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t*b
48
这个正版反而没机会。除了国内的体育,cctv5自己买的奥运节目版权都是只能国内放。

【在 d****w 的大作中提到】
: 我觉得cctv5之类的体育台直播,很少能找到好的,适合老人的简易的方法。
: 特别明年还要奥运,我觉得体育做好了,这个明年到时候会用户很多。

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C*4
49
能不能展开说说protein被DNA barcoded是什么意思?
我想的还是in vivo的,能定量、高通量、高灵敏度,比如纯化蛋白复合物或者IP,可
以直接测得到的蛋白跟control比较;能做基于蛋白质的screen;像GWAS做病人样本测
序一样做蛋白质分析

fluorophores

【在 s******9 的大作中提到】
: 其实楼主的问题我以前问过,当时没有什么讨论。再跟进一点想法:
: 高通量蛋白分析可以分in vivo(proteins in natural environment)和in vitro方法
: 。in vitro主要是protein array和Y2H,in vivo当然是MS。不用多说,各有明显优缺
: 点。
: NGS的优点在于它是separation independent & single-molecule based。其他的
: single-molecule技术都不能做high-throughput,原因是受限于limited fluorophores
: 。同理,蛋白分析能够也做到SM sensitivity和separation independent,将是true
: breakthrough。
: MS的优势很明显,但是sensitivity, throughput和cost-effectiveness都有瓶颈的。
: 所以in vivo基本无法做到single-molecule proteomics。但是对于in vitro,如果

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t*b
50
这个正版反而没机会。除了国内的体育,cctv5自己买的奥运节目版权都是只能国内放。

【在 d****w 的大作中提到】
: 我觉得cctv5之类的体育台直播,很少能找到好的,适合老人的简易的方法。
: 特别明年还要奥运,我觉得体育做好了,这个明年到时候会用户很多。

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s*y
51
他们做的和我们想要的不是一会事。
他们其实是用生物工程的思路来做一个容易定位的蛋白库,以供下游测试来
使用,并不涉及对蛋白的检测。实际上,他们根本不对蛋白进行任何检测。
而我们想要的是直接测细胞里提出的endogenous蛋白,所以这个其实是两个不同
的事情。
当然,他们做的事情也是很有意思的一个应用。

【在 C********4 的大作中提到】
: 能不能展开说说protein被DNA barcoded是什么意思?
: 我想的还是in vivo的,能定量、高通量、高灵敏度,比如纯化蛋白复合物或者IP,可
: 以直接测得到的蛋白跟control比较;能做基于蛋白质的screen;像GWAS做病人样本测
: 序一样做蛋白质分析
:
: fluorophores

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s*i
52
关键是内容,收费,质量,你如果像netflix一样大部分时髦节目都有,能同步跟播最
好,月费低于10块,保证streaming质量,我愿意付钱。
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I*W
53
个人认为:蛋白从头测序最有可能的解决方法是Nanopore,但现在Nanopore的技术还处
于初始阶段,用于DNA测序已经由公司在做,号称年底能有样机出来,等DNA/RNA解决了
,就是protein了。
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j*u
54
想收费:俩字:弃之!
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a*x
55
我在想最近的Aptamer技术,可以用DNA特异性识别蛋白。如果可以把这个解码出来,应
该就可以高通量蛋白测序了。
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s*r
56
re这个.只要像netflix全一点和稳定一点,大家还是愿意的,毕竟隔段时间折腾一次还
是挺费神的。
可惜vego在天猫盒子不能放(闪退)。roku和fire stick可以vego么?

【在 s********i 的大作中提到】
: 关键是内容,收费,质量,你如果像netflix一样大部分时髦节目都有,能同步跟播最
: 好,月费低于10块,保证streaming质量,我愿意付钱。

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s*y
57
是的,我也对这个技术看好。
这个技术原则上是只要是聚合物都能做,不限制于DNA/RNA。
其实类似的东西细胞里就有,那就是proteasome。

【在 I***W 的大作中提到】
: 个人认为:蛋白从头测序最有可能的解决方法是Nanopore,但现在Nanopore的技术还处
: 于初始阶段,用于DNA测序已经由公司在做,号称年底能有样机出来,等DNA/RNA解决了
: ,就是protein了。

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g*g
58
fire stick可以,roku现在不行,txbb说等dish networks的谈判结果,不知如何了

【在 s**********r 的大作中提到】
: re这个.只要像netflix全一点和稳定一点,大家还是愿意的,毕竟隔段时间折腾一次还
: 是挺费神的。
: 可惜vego在天猫盒子不能放(闪退)。roku和fire stick可以vego么?

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s*s
59
这个我估计会有人做。pilot实验应该不难,不过真实sample
几千种蛋白的mixture, non-specific binding的作用实在太强了

【在 a*****x 的大作中提到】
: 我在想最近的Aptamer技术,可以用DNA特异性识别蛋白。如果可以把这个解码出来,应
: 该就可以高通量蛋白测序了。

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t*b
60
roku现在还是摆脱不了dish,当时他们还挺乐观的,但谈了几个月目前还是没结果。

【在 g*g 的大作中提到】
: fire stick可以,roku现在不行,txbb说等dish networks的谈判结果,不知如何了
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s*y
61
因为其实就是一个抗体库,用来检测蛋白表达应该可以,用来真正测序则有难度,
特别是因为蛋白会折叠,所以很多地方是检测不到的。如果用trpsin digestion
然后把切出来的小肽用来做底物的话,则复杂度大大增加。

【在 s******s 的大作中提到】
: 这个我估计会有人做。pilot实验应该不难,不过真实sample
: 几千种蛋白的mixture, non-specific binding的作用实在太强了

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a*g
62
如果可以有cctv5的高清稳定直播 我愿意30订阅 如果有回放 可以40

【在 t**b 的大作中提到】
: 我的意思可能没有说清楚:乐视和优酷上有的东西,其实很容易让他们过滤海外ip(他
: 们好多其实没海外版权),而且也很容易让绕过ip过滤的插件对某些内容失效。
: 海外独家的内容是assumption,真高清和海外流畅播放也是assumption。在这种前提下
: ,哪些内容观众更愿意花几块钱订阅?电视剧?电影?直播?体育?少儿?

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l*1
63
microfluidic platforms plus nanopore
pls refer
1)
Choi JW et al. (2012)
High-Throughput Analysis of Protein–Protein Interactions in Picoliter-
Volume Droplets Using Fluorescence Polarization
Anal. Chem. 84: 3849–3854
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ac300414g
2)
Rudenko MI et al. (2011)
Controlled gating and electrical detection of single 50S ribosomal subunits
through a solid-state nanopore in a microfluidic chip.
Biosens Bioelectron. 29: 34-9.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21855314
3)
one review:
Maerkl SJ. (2011)
Next generation microfluidic platforms for high-throughput protein
biochemistry.
Curr Opin Biotechnol. 22: 59-65.
web link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20832278
or
http://infoscience.epfl.ch/record/162324/files/2010_Maerkl.pdf
more
4)
Nigel R. Sharma et al. (2008)
Development of an evaporation-based microfluidic sample concentrator.
Proc. of SPIE Vol. 6886 68860R-1
web link:
http://144.206.159.178/ft/CONF/16411303/16411328.pdf
5)
or PPT document (now already converted to PDF format)
web link:
http://esonn.fr/esonn2012/cours/salmon.pdf
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a*g
64
如果可以有cctv5的高清稳定直播 我愿意30订阅 如果有回放 可以40

【在 t**b 的大作中提到】
: 我的意思可能没有说清楚:乐视和优酷上有的东西,其实很容易让他们过滤海外ip(他
: 们好多其实没海外版权),而且也很容易让绕过ip过滤的插件对某些内容失效。
: 海外独家的内容是assumption,真高清和海外流畅播放也是assumption。在这种前提下
: ,哪些内容观众更愿意花几块钱订阅?电视剧?电影?直播?体育?少儿?

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l*1
65
Continue:
Microfluidic tools for high-throughput applications
Microfluidic strategies might hold the key towards fast, simple and
inexpensive high-throughput screening platforms These platforms could
revolutionize basic research in biology and medicine, in addition to
dramatically reduce costs in key industrial areas such as drug discovery. To
this end the development of microfluidic tools, capable of dealing with
miniaturized samples (and therefore with large amounts of information) are
needed. One of the key areas of this research involves developinginnovative
tools for microfluidic droplet platforms: Microdroplets are highly
monodisperse water‐in‐oil emulsions generated in microfluidic channels.
These aqueous plugs can be produced with exquisite control over composition
at rates in excess of 1 KHz, and each can be used as an isolated microscopic
experimental platform. Furthermore, other strategies involving continuous
flow microfluidics for high-throughput manipulation of living organisms are
also being developed in the scope of this project.
http://www3.imperial.ac.uk/edelgroup/group/xevi
Reference:
6)
Casadevall I et al. (2012)
Microfluidic evaporator for on-chip sample concentration.
Lab Chip. 12: 4049-54.
web link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22918490
7)
Miles MN et al. (2012)
Single Molecule Sensing with Solid-State Nanopores: Novel Materials, Methods
, and Applications.
Chemical Society Reviews, doi:10.1039/C2CS35286A
web link:
http://www3.imperial.ac.uk/edelgroup/publications

【在 C********4 的大作中提到】
: 搞技术流的人,怎么不开发新的能高通量、定量(不需标记)、灵敏度高的分析蛋白质
: 的技术
: 要是有这样的技术,得能和二代测序一样,大大推动发展吧

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s*n
66
线性polymers(DNA/RNA/protein)理论上应该都可以,但有分枝的估计不行,比如
oligosaccharides.

【在 s******y 的大作中提到】
: 是的,我也对这个技术看好。
: 这个技术原则上是只要是聚合物都能做,不限制于DNA/RNA。
: 其实类似的东西细胞里就有,那就是proteasome。

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e*s
67
说得真好!

【在 K******S 的大作中提到】
: you can amplify DNA/RNA but not proteins. That's the key issue. If someone
: can come up with a way to amplify proteins, s/he will be very rich.
: High throughput: you can do thousands of MALDI-TOF in one day.
: sensitivity: MRM constantly detect compounds with low atto-molar
: concentration.
: Quantitation: a handful of ways to do that. But you've gotta respect the
: chemistry. For DNA/RNA, you only have a few different n.a. while for
: proteins, you have 20 a.a.
: Personally, I don't think high-throughput is the bottleneck now. It is how
: you analyze the data. You can't even get high overlapping with DNA and RNA-

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u*d
68
你说的这个方法有人报道过没?

【在 s******y 的大作中提到】
: 他们文章还没有出来,恐怕不能说太多技术细节。
: 但是根据我的直觉,应该就是利用co-transcritonal translation 来读氨基酸。
: 这个在某些应用里是有意义的,但是,恐怕对于做posttranslational modification(
: 比方说磷酸化)的人没有太大帮助。

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u*d
69
你这个估计找酶底物的人挺喜欢

【在 s******9 的大作中提到】
: 未来的应用是直接将cDNA library变成barcoded protein library,不用分离蛋白,一
: 次可以screen a whole proteome (>100,000 different proteins) with hundreds
: of probes。
: 具体等文章出来后再说了。

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u*d
70
以前看过的一些protein array都是每个蛋白的位置已知了,你这个barcode也是为了知
道蛋白的信息对吧,优势是体现在不用点点阵了么?

fluorophores

【在 s******9 的大作中提到】
: 其实楼主的问题我以前问过,当时没有什么讨论。再跟进一点想法:
: 高通量蛋白分析可以分in vivo(proteins in natural environment)和in vitro方法
: 。in vitro主要是protein array和Y2H,in vivo当然是MS。不用多说,各有明显优缺
: 点。
: NGS的优点在于它是separation independent & single-molecule based。其他的
: single-molecule技术都不能做high-throughput,原因是受限于limited fluorophores
: 。同理,蛋白分析能够也做到SM sensitivity和separation independent,将是true
: breakthrough。
: MS的优势很明显,但是sensitivity, throughput和cost-effectiveness都有瓶颈的。
: 所以in vivo基本无法做到single-molecule proteomics。但是对于in vitro,如果

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u*d
71
恩,第一步做到能区分20种aa,然后是不同aa的修饰

【在 I***W 的大作中提到】
: 个人认为:蛋白从头测序最有可能的解决方法是Nanopore,但现在Nanopore的技术还处
: 于初始阶段,用于DNA测序已经由公司在做,号称年底能有样机出来,等DNA/RNA解决了
: ,就是protein了。

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