求助密码子优化的策略# Biology - 生物学
h*3
1 楼
准备的差不多了，现在就剩主板和显卡了。
处理器买了amd fx 6300
想买个$100以下，最好$70左右的显卡。
跑跑中端游戏就行。
能推荐几款吗？
谢谢啦！
处理器买了amd fx 6300
想买个$100以下，最好$70左右的显卡。
跑跑中端游戏就行。
能推荐几款吗？
谢谢啦！
c*r
2 楼
最近在做密码子优化，原核的，几个人给了不同的建议，出来的结果也不同。
请问大家有什么好的建议？
谢谢！
请问大家有什么好的建议？
谢谢！
B*a
3 楼
上次那个1GB的460就很好，才50刀，可惜没抢到。。。
L*t
4 楼
CCC最好不要动，脯氨酸有两种构象，肽链合成太快的话容易折叠失败。其他的密码子
都可以改，尤其是AGG/AGA
还有就是遇到CCCC这种连续的，容易形成二级结构的序列最好能想办法打断它
都可以改，尤其是AGG/AGA
还有就是遇到CCCC这种连续的，容易形成二级结构的序列最好能想办法打断它
H*i
5 楼
7790 7770
650 ti
【在 B*********a 的大作中提到】
: 上次那个1GB的460就很好，才50刀，可惜没抢到。。。
650 ti
【在 B*********a 的大作中提到】
: 上次那个1GB的460就很好，才50刀，可惜没抢到。。。
c*r
6 楼
还有更多建议吗？非常感谢楼上的建议
a*1
7 楼
7770现在大部分85刀，newegg应该还有货，不知道还有没有其他的coupon可以叠加。
再往下的显卡就不推荐了。
再往下的显卡就不推荐了。
h*r
8 楼
直接把你的AA序列发给公司，像genscript.然后就可以拿到quote,保含cia,gc content
， mRNA二级结构，这一步是free的。
再决定要合成不。
avoid after initiating met: vla, lys, leu, tyr, arg, phe ,trp
best codons in e. coli: ala (gcg), gly (ggc, ggu)
也可以看看老paper:
Expression of Mammalian Cytochromes P450 in Yeast
Expression of Eukaryotic Cytochromes P450 in E. coli
虽然讲的是p450,有些策略还是可以借鉴的。
可以看下新的paper:
Design Parameters to Control Synthetic Gene Expression in Escherichia coli
Kudla, G. et al. Coding-sequence determinants of gene expression in
Escherichia coli. Science 324, 255–258 (2009)
反正paper是很多很多的，表达不出来的基因还是表达不出来。
， mRNA二级结构，这一步是free的。
再决定要合成不。
avoid after initiating met: vla, lys, leu, tyr, arg, phe ,trp
best codons in e. coli: ala (gcg), gly (ggc, ggu)
也可以看看老paper:
Expression of Mammalian Cytochromes P450 in Yeast
Expression of Eukaryotic Cytochromes P450 in E. coli
虽然讲的是p450,有些策略还是可以借鉴的。
可以看下新的paper:
Design Parameters to Control Synthetic Gene Expression in Escherichia coli
Kudla, G. et al. Coding-sequence determinants of gene expression in
Escherichia coli. Science 324, 255–258 (2009)
反正paper是很多很多的，表达不出来的基因还是表达不出来。
h*3
9 楼
tiger direct的吗？
我老早就看到了，就是不懂。
貌似是refurbished
【在 B*********a 的大作中提到】
: 上次那个1GB的460就很好，才50刀，可惜没抢到。。。
h*3
10 楼
MSI R7770-PMD1GD5 Radeon HD 7770和
SAPPHIRE 100358L Radeon HD 7770 GHz
这些不同的7770有啥区别呢？
该买哪家的呢？
【在 a******1 的大作中提到】
: 7770现在大部分85刀，newegg应该还有货，不知道还有没有其他的coupon可以叠加。
: 再往下的显卡就不推荐了。
h*3
11 楼
7790是不是比7770还好一点呢？
650ti呢？
我对显卡现在真是一窍不通
【在 H*****i 的大作中提到】
: 7790 7770
: 650 ti
H*i
12 楼
同样芯片看 core frequency
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 7790是不是比7770还好一点呢？
: 650ti呢？
: 我对显卡现在真是一窍不通
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 7790是不是比7770还好一点呢？
: 650ti呢？
: 我对显卡现在真是一窍不通
H*i
13 楼
goog)e
gaming video card hierarchy
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 7790是不是比7770还好一点呢？
: 650ti呢？
: 我对显卡现在真是一窍不通
gaming video card hierarchy
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 7790是不是比7770还好一点呢？
: 650ti呢？
: 我对显卡现在真是一窍不通
h*3
14 楼
1000MHz，和1100Mhz查的多吗？
很多都是1000Mhz的话，应该选哪个厂家比较好呢？
还是选便宜的？
【在 H*****i 的大作中提到】
: 同样芯片看 core frequency
h*3
15 楼
我去看看，谢谢啦
【在 H*****i 的大作中提到】
: goog)e
: gaming video card hierarchy
a*1
16 楼
7770有两个版本，一个是普通的，一个是Ghz版本。普通版本核心频率在900左右，Ghz
版本在1Ghz，当然有些厂商会有OC版本，就是超频版。不过必要性不大，因为一般的
Ghz版本都可以轻松超频到1100Ghz，显存到1250Ghz没问题，有些好点的卡，可以超到
1200Ghz core/1400Ghz memory。 你的Budget目前来看就7770最推荐了。不过我提醒一
下，7770玩Blizzard的游戏要降频，否则会有黑屏现象
版本在1Ghz，当然有些厂商会有OC版本，就是超频版。不过必要性不大，因为一般的
Ghz版本都可以轻松超频到1100Ghz，显存到1250Ghz没问题，有些好点的卡，可以超到
1200Ghz core/1400Ghz memory。 你的Budget目前来看就7770最推荐了。不过我提醒一
下，7770玩Blizzard的游戏要降频，否则会有黑屏现象
h*3
17 楼
Ghz
我在newegg看了下，大部分都在1000Mhz，Asus，Msi，sapphire，HIS，都在卖。
应该选哪个厂家比较好呢？
还是直接选最便宜的？
从来没玩过暴雪公司的游戏，对他们都不太感兴趣。
谢谢你的解释了
【在 a******1 的大作中提到】
: 7770有两个版本，一个是普通的，一个是Ghz版本。普通版本核心频率在900左右，Ghz
: 版本在1Ghz，当然有些厂商会有OC版本，就是超频版。不过必要性不大，因为一般的
: Ghz版本都可以轻松超频到1100Ghz，显存到1250Ghz没问题，有些好点的卡，可以超到
: 1200Ghz core/1400Ghz memory。 你的Budget目前来看就7770最推荐了。不过我提醒一
: 下，7770玩Blizzard的游戏要降频，否则会有黑屏现象
a*1
18 楼
都行，如果价格差不多，优先蓝宝石吧，他家A卡口碑不错。我入的是MSI的，也不错，
因为价格低。昨天newegg还有70的deal ar
因为价格低。昨天newegg还有70的deal ar
h*3
19 楼
谢谢啦。
那个好像是$79吧。
MSI的
【在 a******1 的大作中提到】
: 都行，如果价格差不多，优先蓝宝石吧，他家A卡口碑不错。我入的是MSI的，也不错，
: 因为价格低。昨天newegg还有70的deal ar
a*1
20 楼
恩，$79挺不错的。不过我听说有人可以combine google wallet的coupon什么的，可以
再减15，不过挺折腾貌似。如果没什么问题可以考虑入了
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 谢谢啦。
: 那个好像是$79吧。
: MSI的
再减15，不过挺折腾貌似。如果没什么问题可以考虑入了
【在 h*******3 的大作中提到】
:
: 谢谢啦。
: 那个好像是$79吧。
: MSI的
h*3
21 楼
google wallet前几天貌似作废了。
我已经用了两次了。
一个账号只能用一次，还得申请新账号
【在 a******1 的大作中提到】
: 恩，$79挺不错的。不过我听说有人可以combine google wallet的coupon什么的，可以
: 再减15，不过挺折腾貌似。如果没什么问题可以考虑入了
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