怎么找一个motif是否在这个gene存在,求助# Biology - 生物学
t*l
1 楼
我现在想研究一个gene是否和CCCTC-Binding Factor 有关系。
我想知道这个CTCF的consensus sequence: CCGCGNGGNGGCAG 时候存在我想研究的这个
gene的上下游和内含子中。我应该怎么入手,从来没做个bioinfo方面的工作。还有就
是想biochemially 证明这个CTCF可以结合到这个gene的DNA,但是我不知道哪个地方,
要是做CHIP,怎么选primer呢,总不能一上来就chip-seq,
我想知道这个CTCF的consensus sequence: CCGCGNGGNGGCAG 时候存在我想研究的这个
gene的上下游和内含子中。我应该怎么入手,从来没做个bioinfo方面的工作。还有就
是想biochemially 证明这个CTCF可以结合到这个gene的DNA,但是我不知道哪个地方,
要是做CHIP,怎么选primer呢,总不能一上来就chip-seq,