问一下做chip-seq的版友# Biology - 生物学s*e2013-08-16 07:081 楼看了一个房子,发现一点白蚁的痕迹。因为里面新装修过的,所以很多地方没法检查。请问如果这个房子以前做过白蚁的treatment,有地方可以查到记录吗?多谢了
p*h2013-08-16 07:082 楼一篇chip-seq的paper,dataset可以下载到(.bed or .bedgraph format)。用什么工具可以呈现出那种whole genome的peak 图,就是看这个蛋白在基因组哪个地方分布的多。或者需要怎么处理一下下载到的dataset才能看?
F*d2013-08-16 07:085 楼如果文件不太大,直接用UCSC Genome Browser的custom track就好。如果要看多个大文件,IGV很不错。把bed换成tdf格式会更快。这里有一个详细的用IGV看CHIP-Seq数据的说明。http://bioinforx.com/lims1/blog.php?id=1000022?wm