请问R大牛或者懂RNA-SEQ分析的牛人，DESeq里面怎么对partially replicates的sample进行分析啊？谢！# Biology - 生物学
z*8
1 楼
请问在DESeq里面怎么对partially replicated的sample分析啊，我有4个组，2组有
replicates，2组没有，建完dataframe后，可以直接对没有replicate的组分析，用“
blind“，也可以对有replicates的组分析，现在我想放在一起分析，人家就报error
>cds=estimateDispersions(cds)
Error in .local(object, ...) :
None of your conditions is replicated. Use method='blind' to estimate across
conditions, or 'pooled-CR', if you have crossed factors.
请问用什么command实现啊？我看了下manual，没有看懂啊！非常感谢
replicates，2组没有，建完dataframe后，可以直接对没有replicate的组分析，用“
blind“，也可以对有replicates的组分析，现在我想放在一起分析，人家就报error
>cds=estimateDispersions(cds)
Error in .local(object, ...) :
None of your conditions is replicated. Use method='blind' to estimate across
conditions, or 'pooled-CR', if you have crossed factors.
请问用什么command实现啊？我看了下manual，没有看懂啊！非常感谢