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问一个很弱的microarray的问题
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问一个很弱的microarray的问题# Biology - 生物学
p*l
1
找了下没找到,好像以前在版上看过有朋友说chase的都不可以refer
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i*h
2
【 以下文字转载自 PDA 讨论区 】
发信人: ilvch (断肠人在天涯), 信区: PDA
标 题: 请教无线网设置问题
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Mar 5 12:38:19 2015, 美东)
我刚在家里新装了一个 wireless extender, 其实是一个把一个 router 设置成 wifi
extender mode.
有两个问题:
1。现在原有无线网和新的增幅信号用的不同的SSID,我在家里不同房间需要手动
切换。这个能设成同一个SSID和密码么?狗了一下没找到明确的答案
2。我家的有线网速实测是下行110M,上行10M。我把新加的router 放在原有
router边上,然后用网线连接新 router 和计算机测速,結果是上下行都是10M。两
个 router 都是 802.11n, 理论速度至少50M。现在的实际結果是不是太慢了点?可
能通过改设置提高么?
谢谢
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l*3
3
最近想建一个某基因高表达的细胞系,然后做microarray找一些该基因的关联基因,先
不谈这样找到的基因是否准确,单说建这个高表达的细胞系。
我能不能直接用慢病毒感染,然后做facs sorting?但是我想这样得到的population都
不是从一个单克隆来的,microarray的结果肯定相差很大。
我试着用pcDNA3.1做载体转细胞,然后用G418筛,但是转染效率不高(基因比较大,将
近7k),所以导致筛到后面克隆很少,因为用的细胞本身就长得很慢,所以仅有的几个
单克隆长了很久也没有长起来。
大家有没有什么好的建议呢?谢谢!
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g*n
4
没听说有
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t*j
5
新router 是通过无线连接入原有的router吧?
我用过一个extender, 可以使用相同的SSID,和密码。
应该可以通过移动位置,更换频道,等等。得到实测速率的。
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s*s
6

你筛个单克隆出来不就行了,还是因为长的慢?不是单克隆也没啥问题啊,
平均减小误差嘛。
G418是一个烂药,除非不得已,否则应该上puro

【在 l******3 的大作中提到】
: 最近想建一个某基因高表达的细胞系,然后做microarray找一些该基因的关联基因,先
: 不谈这样找到的基因是否准确,单说建这个高表达的细胞系。
: 我能不能直接用慢病毒感染,然后做facs sorting?但是我想这样得到的population都
: 不是从一个单克隆来的,microarray的结果肯定相差很大。
: 我试着用pcDNA3.1做载体转细胞,然后用G418筛,但是转染效率不高(基因比较大,将
: 近7k),所以导致筛到后面克隆很少,因为用的细胞本身就长得很慢,所以仅有的几个
: 单克隆长了很久也没有长起来。
: 大家有没有什么好的建议呢?谢谢!

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g*n
7
btw
lz这个ID是不是换人了?
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a*a
8
用lenti会比较好,因为lenti不是从单细胞来的,所以能排除单克隆基因型不稳定及目
的片段特异插入带来的问题。
基因比较大还是载体比较大?pc3.1大概5k,也就是说你的目的基因3k大,lenti还是放
得下的。如果是你的目的基因就7k,那就麻烦了
搞不好瞬转表达也有问题。

【在 l******3 的大作中提到】
: 最近想建一个某基因高表达的细胞系,然后做microarray找一些该基因的关联基因,先
: 不谈这样找到的基因是否准确,单说建这个高表达的细胞系。
: 我能不能直接用慢病毒感染,然后做facs sorting?但是我想这样得到的population都
: 不是从一个单克隆来的,microarray的结果肯定相差很大。
: 我试着用pcDNA3.1做载体转细胞,然后用G418筛,但是转染效率不高(基因比较大,将
: 近7k),所以导致筛到后面克隆很少,因为用的细胞本身就长得很慢,所以仅有的几个
: 单克隆长了很久也没有长起来。
: 大家有没有什么好的建议呢?谢谢!

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p*l
9
??咋了,从来没变过啊
赞真子记得我,感动哭泣Ing....

【在 g**n 的大作中提到】
: btw
: lz这个ID是不是换人了?

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l*3
10
是目的基因就有6k多,克隆到lentivirus载体里,在做流式sorting,可行吗?
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a*a
11
你的目的基因6k,再加上efgp marker就要奔7k去了。
首先很难表达(也许可以表达)其次很难包装。
如果过表达以后对细胞生长有不利影响则很难拿到纯population。
我做过3.xk的基因+ires gfp感染mES细胞,阳性率只有2%。
facs能得到50%阳性细胞,养几代后二次facs时发现阳性率又掉到10%
折腾了几个月最后放弃了。
也许你可以考虑用bac的方法做过表达稳定株
你去看一下Kristian Helin的tet1文章。记得他稳转了全长6k多的TET1,
TET1很长,我们尝试了很久始终不能有效表达。
当时他来我们实验室转的时候问过他这个问题,好像他是用bac解决的,记不清了。

【在 l******3 的大作中提到】
: 是目的基因就有6k多,克隆到lentivirus载体里,在做流式sorting,可行吗?
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C*S
12
我最近也在装一个载体,把一个5k的基因装到pEGFP-C1载体再把GFP fusion蛋白装到
pBabe retroviral里。酶切测序都对,就是转到293T细胞里只能看到极少数细胞GFP阳
性。真的是因为基因太大了?谢谢。

【在 a*******a 的大作中提到】
: 你的目的基因6k,再加上efgp marker就要奔7k去了。
: 首先很难表达(也许可以表达)其次很难包装。
: 如果过表达以后对细胞生长有不利影响则很难拿到纯population。
: 我做过3.xk的基因+ires gfp感染mES细胞,阳性率只有2%。
: facs能得到50%阳性细胞,养几代后二次facs时发现阳性率又掉到10%
: 折腾了几个月最后放弃了。
: 也许你可以考虑用bac的方法做过表达稳定株
: 你去看一下Kristian Helin的tet1文章。记得他稳转了全长6k多的TET1,
: TET1很长,我们尝试了很久始终不能有效表达。
: 当时他来我们实验室转的时候问过他这个问题,好像他是用bac解决的,记不清了。

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a*a
13
我不确定,不排除这个可能
我用pcdna3.1接6k多带n端和c端tag的tet1
转染後用if检测,只有不超过2%的细胞是阳性,换过ubc ef1a启动子都没什么改善。还
做过几个类似大小的蛋白都是类似现象。
但是转9k的lv载体加3k的蛋白再加1.5k的ires gfp,蛋白表达的就很好。排除质粒太大
转染效率不高的可能。
后来我的解决办法是不做这么大的基因了。

【在 C**S 的大作中提到】
: 我最近也在装一个载体,把一个5k的基因装到pEGFP-C1载体再把GFP fusion蛋白装到
: pBabe retroviral里。酶切测序都对,就是转到293T细胞里只能看到极少数细胞GFP阳
: 性。真的是因为基因太大了?谢谢。

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