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求推荐miR seq的pipeline

求推荐miR seq的pipeline# Biology - 生物学

k*42014-06-26 07:06

1 楼

情况是这样的，我毕业了，工作一直找不到，现在倒是找了个巨烂无比的intern，是业
内的大公司，他们好像着急要人，于是打了一个15分钟的电话，刚才说要给我发letter
,问我什么时候过去公司。我现在EAD大概还要2个月下来，最快的速度还需要1个月（加
急的情况下），但是我没说这个情况，只是说OPT已经开始了（确实已经开始了，只是
还没有卡）。我想拿到letter了以后马上办OPT加急，下周过去如果HR要卡我就明说，
但是说我可以unpay的做，volunteer的做。大家有什么主意么？

c*z2014-06-26 07:06

2 楼

miR的工具很多，但是不知道哪个比较好，试了mir analyzer，那个web server竟然不
work...
最近基本是无头苍蝇在到处撞，知道版上大牛很多，求大牛们分享一下comments
求推荐质量好的，比较好用的pipeline, 如果有教程最好
背景是这样的，会写R；php勉强会一点；目前比较倾向用biocondunctor的package
目前基本还是小打小闹，十几个到几十个样品，以后可能会有比较大量的，不过这个不
着急；工具是一个普通速度的PC，如果确定我能把bioinfo这块做起来可以考虑投资一
些硬件。
老板化学背景，周围人基本都是wet lab或者学医的出身，基本提供不了帮助
谢谢！
包子不多，对认真的回答尽可能发:)

d*62014-06-26 07:06

3 楼

没拿到卡OPT怎么就开始了？你在网上查到批了？那个开始时间不是你request什么时候
开始就开始的。

letter

【在 k********4 的大作中提到】

: 情况是这样的，我毕业了，工作一直找不到，现在倒是找了个巨烂无比的intern，是业
: 内的大公司，他们好像着急要人，于是打了一个15分钟的电话，刚才说要给我发letter
: ,问我什么时候过去公司。我现在EAD大概还要2个月下来，最快的速度还需要1个月（加
: 急的情况下），但是我没说这个情况，只是说OPT已经开始了（确实已经开始了，只是
: 还没有卡）。我想拿到letter了以后马上办OPT加急，下周过去如果HR要卡我就明说，
: 但是说我可以unpay的做，volunteer的做。大家有什么主意么？