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g*h
2
rt 两个蛋白,分子量差不多,动力学kon大概10e4,koff很小
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m*b
3
spr
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g*h
4
有没有真的懂的?
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U*t
5
不知你用何种方法测定的 “kon大概10e4,koff很小”。 如果 kon真的是~10e4,感
觉最终 KD 应在 low to sub-nanomolar.
准确测定 pM KD的方法有
KinExA,
MSD
BLI-ELISA
Gyros

SPR 大多时已经无法准确测定 sub-nanomolar affinity
参见
http://www.fortebio.com/interactions/Winter_2014/index6.html?LL
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g*h
6
非常感谢

【在 U*****t 的大作中提到】
: 不知你用何种方法测定的 “kon大概10e4,koff很小”。 如果 kon真的是~10e4,感
: 觉最终 KD 应在 low to sub-nanomolar.
: 准确测定 pM KD的方法有
: KinExA,
: MSD
: BLI-ELISA
: Gyros
: 等
: SPR 大多时已经无法准确测定 sub-nanomolar affinity
: 参见

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e*y
7
我用BLI/OctetRED最低测过小分子到700pM,kon大概5x10e5,koff大概10e-4.如果是蛋
白-蛋白作用,BLI应该最低能到10-20pM。但是同意楼上说的,如果你确定你的kon大概
10e4的话,不太可能会有pM的啊,也就sub nano级别。要不koff就要10e-6,-7的样子
。太慢了,BLI,SPR什么的也搞不定的。一般至少要10%的dissociation才能fit koff
,10e-6的koff, 10% off就要一天多。

【在 g*****h 的大作中提到】
: 非常感谢
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g*h
8
kon 是10e5, koff 用biacore dissociate了1个小时也看不到明显的解离,可能是10e
-7甚至10e-8级别的
BLI 或者spr只有在极端条件下才能测10pm的kd

koff

【在 e****y 的大作中提到】
: 我用BLI/OctetRED最低测过小分子到700pM,kon大概5x10e5,koff大概10e-4.如果是蛋
: 白-蛋白作用,BLI应该最低能到10-20pM。但是同意楼上说的,如果你确定你的kon大概
: 10e4的话,不太可能会有pM的啊,也就sub nano级别。要不koff就要10e-6,-7的样子
: 。太慢了,BLI,SPR什么的也搞不定的。一般至少要10%的dissociation才能fit koff
: ,10e-6的koff, 10% off就要一天多。

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e*y
9
对,10pM是理想状况了,实际上几乎没啥可能。照你描述的,所有kinetic based的
assay都没戏,koff太慢了。10e-7的话,10% dissociation是265小时。试试radio
labeled assay。或者看这一篇paper有没有帮助。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15711537

10e

【在 g*****h 的大作中提到】
: kon 是10e5, koff 用biacore dissociate了1个小时也看不到明显的解离,可能是10e
: -7甚至10e-8级别的
: BLI 或者spr只有在极端条件下才能测10pm的kd
:
: koff

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