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有人做Autophagy吗?# Biology - 生物学
l*3
1
又到香肠季节了,求推荐熏香肠神器。
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c*e
2
很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
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c*e
4
我自己做发现用某一种东西induce了autophagy以后,increased LC3-II for sure, 但
也有很明显的p62 upregulation.
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l*3
5
谢谢!我慢慢领会领会。
现在不方便看youtube,但感觉你给的方法都是熏小批量的。我打算做2,30磅香肠,想
买个大点的,一,两次就可以熏完。

【在 B********n 的大作中提到】
: 有一种可以在煤气上烧的
: 叫stovetop smoker,买大概50刀左右
: 但是,
: 用家里现成的可以自制的,不花钱
: 只需要有点铝箔纸,一个可以干烧的锅子
: 一个镂空的rack就可以了
: 我抛给你2个link,你领会下就好了
: https://www.youtube.com/watch?v=WbpyFrE3s4o
: https://www.youtube.com/watch?v=57rlEXfpt5c

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c*g
6

p62可以结合ubiquitinated cargo,同时又结合LC3,所以autophagy inducation 可能
看到p62 upregulation。如果autophagosome-lysosome 被抑制,可以看到p62
accumulation.

【在 c********e 的大作中提到】
: 很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
: upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
: accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
: 。

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B*n
7
那就得找outdoor的,这个不难找的

【在 l****3 的大作中提到】
: 谢谢!我慢慢领会领会。
: 现在不方便看youtube,但感觉你给的方法都是熏小批量的。我打算做2,30磅香肠,想
: 买个大点的,一,两次就可以熏完。

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c*e
8
如果我in vitro看到加了药A,有LC3-II conversion, p62 upregulation, 在in vivo
的实验中做了p62的IHC,也看到了处理后的upregulation,我可以说in vivo也证明药A
induce autophagy吗?
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t*e
9
那种wood chips 能从公园捡些来吗?

【在 B********n 的大作中提到】
: 有一种可以在煤气上烧的
: 叫stovetop smoker,买大概50刀左右
: 但是,
: 用家里现成的可以自制的,不花钱
: 只需要有点铝箔纸,一个可以干烧的锅子
: 一个镂空的rack就可以了
: 我抛给你2个link,你领会下就好了
: https://www.youtube.com/watch?v=WbpyFrE3s4o
: https://www.youtube.com/watch?v=57rlEXfpt5c

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x*e
10
你这情况好像是autophagy flux blockage. chloroquine CQ是溶酶体抑制剂,你可以
处理的时候加CQ, 如果cq能够增强你的处理引起的LC3II 增加,那就是诱导autophagy,
如果没什么变化,那就可能是LC3II的降解受抑制导致LC3II增加,就可能是autophagy
flux blockage:fusion of autophagosome and lysosome is inhibited。p62是
autophagy的特异性受体,自噬增加会导致p62降解增加,减少p62蛋白量;flux受抑制
则会降低p62的降解,增加p62的蛋白量,所以你的情况看着像是flux blockage。 另外
,检测的时间点很关键的,没有记错的话饥饿2小时的时候LC3II 上升,4小时之后则
降低。 推荐:Guidelines for the use and interpretation of assays for
monitoring autophagy
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B*n
11
这个我不知道哎。。。

【在 t*****e 的大作中提到】
: 那种wood chips 能从公园捡些来吗?
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c*e
12
这也是我confuse的地方,in vitro的data很clear, in vivo p62 IHC upregulation是
处理了好多次,一个月以后收的sample。有这个paper说,很多人只用p62做autophagy
flux的底物,实际上,多等一段时间,p62表达又自己恢复了
https://www.landesbioscience.com/journals/autophagy/2012AUTO0626R1.pdf

【在 x*****e 的大作中提到】
: 你这情况好像是autophagy flux blockage. chloroquine CQ是溶酶体抑制剂,你可以
: 处理的时候加CQ, 如果cq能够增强你的处理引起的LC3II 增加,那就是诱导autophagy,
: 如果没什么变化,那就可能是LC3II的降解受抑制导致LC3II增加,就可能是autophagy
: flux blockage:fusion of autophagosome and lysosome is inhibited。p62是
: autophagy的特异性受体,自噬增加会导致p62降解增加,减少p62蛋白量;flux受抑制
: 则会降低p62的降解,增加p62的蛋白量,所以你的情况看着像是flux blockage。 另外
: ,检测的时间点很关键的,没有记错的话饥饿2小时的时候LC3II 上升,4小时之后则
: 降低。 推荐:Guidelines for the use and interpretation of assays for
: monitoring autophagy

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d*2
14
根据多年的经验,p62不consistent,很多时候跟lc3-ii共进退。用lc3的wb和gfp-lc3
就行了。
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s*l
15
测一下p62转录水平有没有变化

【在 c********e 的大作中提到】
: 很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
: upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
: accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
: 。

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c*e
16
谢谢,我也发现是这样,GFP-LC3, LC3-II,p62 in vitro都有上调,但我需要(老板
非要)看下in
vivo的IHC,很明显处理后p62的IHC表达增强。我可以说in vivo的finding也支持这个
要induce autophagy吗?

lc3

【在 d*2 的大作中提到】
: 根据多年的经验,p62不consistent,很多时候跟lc3-ii共进退。用lc3的wb和gfp-lc3
: 就行了。

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d*2
17
1. 首先看GFP-LC3, LC3-II,这个你做过了
2. In vitro 处理Bafilomycin或者Chloroquine,然后再看GFP-LC3, LC-II,这个
可以知道Flux
3. 或者用RFP-GFP-LC3看Flux
4. In vivo,染色看LC-3,如果可以的话,注射Bafilomycin,再看LC-3II的WB。或
者找reporter小鼠。P62可看可不看,毕竟能提供的信息量不多。

【在 c********e 的大作中提到】
: 谢谢,我也发现是这样,GFP-LC3, LC3-II,p62 in vitro都有上调,但我需要(老板
: 非要)看下in
: vivo的IHC,很明显处理后p62的IHC表达增强。我可以说in vivo的finding也支持这个
: 要induce autophagy吗?
:
: lc3

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