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copy number variation

copy number variation# Biology - 生物学

i*r2015-10-13 07:10

1 楼

最近家里把以前的旧wall oven给换了，但是，收垃圾的不收这么大的家伙，让找专门
的人处理，打了几个电话，好像还不便宜。
请问，大家是怎么处理这些换下来的大的电器的？
多谢先!

d*t2015-10-13 07:10

2 楼

看到大家说这两个都特别好。请问有什么区别么？
fremont那个nursery说没有tamopan.
谢谢。

a*e2015-10-13 07:10

3 楼

如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
谢谢

U*S2015-10-13 07:10

4 楼

我们这里市政府一年有2次免费回收。也可以买新的时候让商店拿走，经常是免费的。

i*o2015-10-13 07:10

5 楼

有什么特别好的品种吗？

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.0.1

【在 d*****t 的大作中提到】

: 看到大家说这两个都特别好。请问有什么区别么？
: fremont那个nursery说没有tamopan.
: 谢谢。

n*72015-10-13 07:10

6 楼

够了
也跟你的sample有关

N*E2015-10-13 07:10

7 楼

Try to call Public work of your township. They may come over and pick up
for household waste.

d*t2015-10-13 07:10

8 楼

大家说这两个都很好。就是不知道区别。

【在 i****o 的大作中提到】

: 有什么特别好的品种吗？
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.0.1

b*r2015-10-13 07:10

9 楼

看你可以允许漏掉多少百分比的CNV了
如果想抓到比如90%以上，20x差得远，估计起吗平均的一百以上，而且跟算法很有关系
，这些cnv一般都是重复性比较高的地方，很多algorithm直接就把这些reads给扔了，
算出来的会很不准

s*82015-10-13 07:10

10 楼

我们这儿county有专门的垃圾站，拉过去付5块钱回收。

【在 i****r 的大作中提到】

: 最近家里把以前的旧wall oven给换了，但是，收垃圾的不收这么大的家伙，让找专门
: 的人处理，打了几个电话，好像还不便宜。
: 请问，大家是怎么处理这些换下来的大的电器的？
: 多谢先!

r*e2015-10-13 07:10

11 楼

如果是whole-genome sequencing
大概30，40左右我觉得就差不多了
short reads的限制导致很多时候你就算测1000也未必ok
另外全基因测序你测too deep， cost上也很贵吧

【在 a***e 的大作中提到】

: 如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
: 谢谢

f*i2015-10-13 07:10

12 楼

craiglist, free

【在 i****r 的大作中提到】

r*e2015-10-13 07:10

13 楼

还有，
如果是deep seq，那么可以做各种各样的structural variation
CNV只是SV的一种而已

【在 a***e 的大作中提到】

: 如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
: 谢谢

i*r2015-10-13 07:10

14 楼

太大，车小，拉不了。

【在 s******8 的大作中提到】

: 我们这儿county有专门的垃圾站，拉过去付5块钱回收。

s*s2015-10-13 07:10

15 楼

足够了，我看15-20就行了，能call CNV/SV.
你去CGHub看一下TCGA里面HMS-RK做的low-pass WGS就行了，就是干这个的

【在 a***e 的大作中提到】

: 如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
: 谢谢

i*r2015-10-13 07:10

16 楼

多谢。

【在 f****i 的大作中提到】

: craiglist, free

s*s2015-10-13 07:10

17 楼

足够了，我看15就行了，能call CNV/SV，再低点也没啥问题.
你去CGHub看一下TCGA里面HMS-RK做的low-pass WGS就行了，就是干这个的

【在 a***e 的大作中提到】

: 如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
: 谢谢

m*t2015-10-13 07:10

18 楼

有的rental property修理时会需要的，放craiglist买个50-100块buffet钱

s*s2015-10-13 07:10

19 楼

足够了，我看15就行了，能call CNV/SV，再低点也没啥问题.
你去CGHub看一下TCGA里面HMS-RK做的low-pass WGS就行了，就是干这个的

【在 a***e 的大作中提到】

: 如果想用deep sequencing 检测 copy number variation，20 倍的覆盖度够吗？
: 谢谢

e*t2015-10-13 07:10

20 楼

还能用的话不要在craigslist上免费，让人觉得是处理垃圾。要个低价才能让人觉的检
了便宜。我的两分钱。

B*o2015-10-13 07:10

21 楼

取经验了

还能用的话不要在craigslist上免费，让人觉得是处理垃圾。要个低价才能让人觉的检
了便宜。我的两分钱。
★ Sent from iPhone App: iReader Mitbbs Lite 7.20

【在 e********t 的大作中提到】

: 还能用的话不要在craigslist上免费，让人觉得是处理垃圾。要个低价才能让人觉的检
: 了便宜。我的两分钱。

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