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Oxford Nanopore 纽约 opening
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t*z
3
最近有篇Genome Research的paper讲ONT+MiSeq的pipeline,号称可以大幅降低error
rate,不知ONT官方有何评价?

【在 s******s 的大作中提到】
: 这玩意儿有人用么?出来之前宣传的太牛X,出来以后我听到过用的人,没说过这个的
: 好话

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n*7
4
link plz?
前几年pacbio要死的时候,也是这种hybrid 策略救了一命
目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
不知道还有救没有
ONT的直接竞争者应该就是pacbio

【在 t*****z 的大作中提到】
: 最近有篇Genome Research的paper讲ONT+MiSeq的pipeline,号称可以大幅降低error
: rate,不知ONT官方有何评价?

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s*r
5
用这种hybrid就是彻底承认自己不行了,饮鸠止渴来续命
对投资者来说打击巨大,对使用者来说,反正也没多少人正在用或者将要用

【在 n******7 的大作中提到】
: link plz?
: 前几年pacbio要死的时候,也是这种hybrid 策略救了一命
: 目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
: 不知道还有救没有
: ONT的直接竞争者应该就是pacbio

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n*7
6
nanopore和pacbio的特点是long reads
在splicing,genome sv, de novo assembly等领域还是很有用的

【在 s******r 的大作中提到】
: 用这种hybrid就是彻底承认自己不行了,饮鸠止渴来续命
: 对投资者来说打击巨大,对使用者来说,反正也没多少人正在用或者将要用

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h*9
7
只要coverage 够高,那点error rate算啥,校正一下就行。这种数据,statistician
的最爱。

【在 n******7 的大作中提到】
: nanopore和pacbio的特点是long reads
: 在splicing,genome sv, de novo assembly等领域还是很有用的

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t*z
8
链接在这:
http://genome.cshlp.org/content/early/2015/10/07/gr.191395.115.abstract
这种策略对de novo assembly确实很有帮助。
PacBio已经出了牛逼的Sequel,ONT更加没希望了。

【在 n******7 的大作中提到】
: link plz?
: 前几年pacbio要死的时候,也是这种hybrid 策略救了一命
: 目前ONT的error rate比pacbio还高一个数量级
: 不知道还有救没有
: ONT的直接竞争者应该就是pacbio

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