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如何解释过表达与敲减某一基因的表型一致？

如何解释过表达与敲减某一基因的表型一致？# Biology - 生物学

c*J2016-05-12 07:05

1 楼

之前申了张blue cash everyday 如果开卡十二个月后我想转成preferred的话还可以
再拿一次开卡的bonus么？
之前好像看到说转卡amex是可以重新给开卡bonus的不知道我是不是记错了
多谢大家了！！！

b*n2016-05-12 07:05

2 楼

western检测敲减效率有95%以上，过表达有10倍以上，但是敲减和过表达都导致细胞系
的生长变慢和致瘤能力下降，而且过表达的表型更加明显，打个比方说，对照肿瘤大小
平均是1，敲减的肿瘤大小平均是0.5，但是过表达的平均大小只有0.1不到，非常令人
吃惊。
如何解释这个现象呢？dominant negative的话也不会过表达的表型强于敲减啊。
如何进一步研究呢？
未来如何展示过表达的数据并让reviewer信服？

rh2016-05-12 07:05

3 楼

还有这样的好事？

【在 c********J 的大作中提到】

: 之前申了张blue cash everyday 如果开卡十二个月后我想转成preferred的话还可以
: 再拿一次开卡的bonus么？
: 之前好像看到说转卡amex是可以重新给开卡bonus的不知道我是不是记错了
: 多谢大家了！！！

N*e2016-05-12 07:05

4 楼

一个生物猥琐男要有充足的体力干活，不仅要吃饭，而且还需要喝水。 PI给了一碗饭
一杯水，可以保证一个猥琐男100%的工作效率。
现在PI觉得增加人干活，会发更多的paper，拿更多的房顶。于是在买买提上发广告
，又招了一个猥琐男加入实验室。现在的实验室共有两个猥琐男。问题是，PI仍然只
愿意提供一碗饭一杯水来养活猥琐男们。
两个猥琐男又饥又渴的情况下，争着去抢食物和水。两个猥琐男的战斗力相当，最后
的结果是，一个猥琐男抢到了饭，另一个猥琐男抢到了水。两个猥琐男一个饥而不
渴另一个渴而不饥，两个人都没有体力干活了。每个人的实验效率变成了0。
这个实验室还有另外一个老板最爱的baby博士后。baby博士后跟猥琐男有些partially
functional redundant（但是跟猥琐男不一样的是， baby一般吃香的喝辣的，粗活累
活从来不干，干的少paper还多）。两个猥琐男又饥又渴，很是不爽，把baby的
碗里的肉打翻了，结果导致baby干活效率也降低了。

z*n2016-05-12 07:05

5 楼

哪听说的就问谁去啊呵呵

b*r2016-05-12 07:05

6 楼

吃100碗饭和吃0碗饭，人都表现为死亡

s*g2016-05-12 07:05

7 楼

"不知道我是不是记错了"
u r

【在 c********J 的大作中提到】

k*22016-05-12 07:05

8 楼

It is a dosage-sensitive gene? Can you do more repeats across multiple
levels of over-expression / down-regulation?

h*s2016-05-12 07:05

9 楼

转卡从来就没有bonus。

【在 c********J 的大作中提到】

k*22016-05-12 07:05

10 楼

有时候过表达很浪费能量或者产生有毒的product~~~所以并不是越多越好~我觉得只要
有valid的证据，reviewer会理解透彻的。

s*g2016-05-12 07:05

11 楼

exception is discover's miles... targeted though

【在 h****s 的大作中提到】

: 转卡从来就没有bonus。

s*r2016-05-12 07:05

12 楼

两个机制不一定一样，过表达影响了其他东西，你的蛋白你熟啊应该能猜个大致方向出
来，比如根据功能试试换个tissue表达或者分段表达看看。起码要给个合理理由解释，
否则过不了reviewer那关

【在 b*****n 的大作中提到】

: western检测敲减效率有95%以上，过表达有10倍以上，但是敲减和过表达都导致细胞系
: 的生长变慢和致瘤能力下降，而且过表达的表型更加明显，打个比方说，对照肿瘤大小
: 平均是1，敲减的肿瘤大小平均是0.5，但是过表达的平均大小只有0.1不到，非常令人
: 吃惊。
: 如何解释这个现象呢？dominant negative的话也不会过表达的表型强于敲减啊。
: 如何进一步研究呢？
: 未来如何展示过表达的数据并让reviewer信服？

n*92016-05-12 07:05

13 楼

你做梦那，醒醒。。。。

j*n2016-05-12 07:05

14 楼

Knock down over expression 都很强
试试弱一点的？
可能对cell physiology影响太大

【在 b*****n 的大作中提到】

g*s2016-05-12 07:05

15 楼

正解，高手啊。
如果功能是通过ABC 3个蛋白质的Complex来实现的，就能解释楼主发现的现象。

partially

【在 N******e 的大作中提到】

: 一个生物猥琐男要有充足的体力干活，不仅要吃饭，而且还需要喝水。 PI给了一碗饭
: 一杯水，可以保证一个猥琐男100%的工作效率。
: 现在PI觉得增加人干活，会发更多的paper，拿更多的房顶。于是在买买提上发广告
: ，又招了一个猥琐男加入实验室。现在的实验室共有两个猥琐男。问题是，PI仍然只
: 愿意提供一碗饭一杯水来养活猥琐男们。
: 两个猥琐男又饥又渴的情况下，争着去抢食物和水。两个猥琐男的战斗力相当，最后
: 的结果是，一个猥琐男抢到了饭，另一个猥琐男抢到了水。两个猥琐男一个饥而不
: 渴另一个渴而不饥，两个人都没有体力干活了。每个人的实验效率变成了0。
: 这个实验室还有另外一个老板最爱的baby博士后。baby博士后跟猥琐男有些partially
: functional redundant（但是跟猥琐男不一样的是， baby一般吃香的喝辣的，粗活累

b*n2016-05-12 07:05

16 楼

也猜到了可能把这个基因同个family member的功能给破坏掉了。不过要证明起来很不
容易啊。

partially

【在 N******e 的大作中提到】

b*n2016-05-12 07:05

17 楼

以前在其它肿瘤中没有看到这个现象，很难猜。
现在想着把dominant negative的form给过表达看看什么结果。

【在 s******r 的大作中提到】

: 两个机制不一定一样，过表达影响了其他东西，你的蛋白你熟啊应该能猜个大致方向出
: 来，比如根据功能试试换个tissue表达或者分段表达看看。起码要给个合理理由解释，
: 否则过不了reviewer那关

N*e2016-05-12 07:05

18 楼

对，你原贴中已经提过dominant negative的可能性了。
基于生长变慢和致瘤能力这两个表型，实在不太好下结论。要是有specific的分子水平
的readout就好一些了。
更有可能像skycolor大侠说的那样，两个机制可能压根儿就不一样。

【在 b*****n 的大作中提到】

: 也猜到了可能把这个基因同个family member的功能给破坏掉了。不过要证明起来很不
: 容易啊。
:
: partially

m*e2016-05-12 07:05

19 楼

生长速度不是一个基因决定的。多基因共同决定表现型，functional redundancy.
另外一种可能就是你的基因在过表达和敲除后激活了不同的信号通路

n*72016-05-12 07:05

20 楼

做个表达谱看看影响了那些gene吧
还是挺有意思的
不过像楼上说的，我感觉OE有点过强了

f*f2016-05-12 07:05

21 楼

对于multi-subunit complex 过表达其中一个不一定会增强功能。
比如有大量研究通过过表达dynactin subunit dynamitin(p50)来抑制dynein-dynactin
-dependent transport。

【在 b*****n 的大作中提到】