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小白问一下DNA甲基化的问题

小白问一下DNA甲基化的问题# Biology - 生物学

t*t2016-09-05 07:09

1 楼

已经测得三种甲基化转移酶在一肿瘤组织中的表达呈现上调，但pyrosequencing 的结
果显示
该肿瘤组织样品中整个基因组的甲基化修饰却是降低的，这个逻辑上怎么解释呢？因
为无论是正常的RT-PCR，蛋白水平，以及 RNA seq，都可以看到dnmt均是上调的。

n*72016-09-05 07:09

2 楼

RNA-Seq 怎么看整个基因组的甲基化？

t*t2016-09-05 07:09

3 楼

笔误，已修改，谢谢关注

【在 n******7 的大作中提到】

: RNA-Seq 怎么看整个基因组的甲基化？

l*12016-09-05 07:09

4 楼

代偿？

z*t2016-09-05 07:09

5 楼

tumor的global hypomehylation是一个挺consistent的现象。和dnmt的表达其实没有关
系。

：已经测得三种甲基化转移酶在一肿瘤组织中的表达呈现上调，但pyrosequencing 的
结果显示
：该肿瘤组织样品中整个基因组的甲基化修饰却是降低的，这个逻辑上怎么解释呢？
因为无论是正常的RT-PCR，蛋白水平，以及 RNA seq，都可以看到dnmt均是上调的。

【在 t*****t 的大作中提到】

: 笔误，已修改，谢谢关注

a*r2016-09-05 07:09

6 楼

楼上说的对，global hypomethylation 已经测出来很多次了。
癌症里还要看cancer suppressor gene 会有hypermethylation，特别是promoter
话说dnmt expression 跟 methylation level 好像没有必然联系，这个我不记得
citation 不过没看过强调有联系的。欢迎指正