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Mitbbs水平挺高的，纯从科学家角度质疑韩春雨

Mitbbs水平挺高的，纯从科学家角度质疑韩春雨# Biology - 生物学

d*m2017-05-21 07:05

1 楼

软枣猕猴桃来自长白山的神奇果树，俗称“枣圆子”
它是是一种可观赏性极高，口感和味道非常好，果肉香甜，甜度达到23%，吃起来非常
的爽口，是唯一可以带皮也能吃的猕猴桃，家中如果养2株，结果一年有果吃！
它非常好养活易结果，它耐寒抗旱，冬天零下十几度也冻不坏，对土壤要求不高，酸性
和碱性土壤都没关系，每次浇透水就可以了，十分简单易学，而且还是自花授粉，结果
挂果2月不落地，没有栽种经验也不会影响开花结果。

q*y2017-05-21 07:05

2 楼

给一个全正数的数组，大小为N。将其分成连续的K段。要求每段的和尽量平均。也就是
最大化最小段的和。这个DP公式怎么列啊？

w*y2017-05-21 07:05

3 楼

虽然上个月忙的要吐血了。。。但现在不那么忙了，觉的很失落啊。
不知道要做什么好。今天又是写计划又是看菜谱的，但觉的没有什么
用。。。

R*A2017-05-21 07:05

4 楼

http://boston.craigslist.org/bmw/pho/1665993599.html

m*s2017-05-21 07:05

5 楼

2016年5月2日，英国《自然》杂志子刊《自然生物技术》刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所谓基因组编辑技术，就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序列。
http://tv.cctv.com/2017/05/20/VIDEBZRf7rQNg2Y1ExpBhpQM170520.shtml
一、学界和媒体的热议Mitbbs.com
一年前，英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文。论文的负责人"一鸣惊人"，得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文，通常表明，该科研成果走在了世界科学研究的最前沿，并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出，在站内引起站内相关专业人士的热议。
国内科研水平不得了了，河北科技大学在Nature Biotechnoligy发表重要成果
http://mitbbs.com/article_t/Faculty/31803583.html
感觉韩春雨做科研的境界比颜宁高
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32019973.html
二、实验结果被质疑
1.一般来说Ago蛋白C端加tag，无论是来自于那个物种，蛋白就没有活性了，主要由Ago蛋白自身结构folding决定。文中用的几个construct，好像只有1-2个C端是没有tag的。那么，用C端带tag的Ago作出的实验，是否有意义呢？当然，不能够排除NgAgo本身特殊，能够tolerate C端tag，只是从预测的结构上讲，可能性很小。
2.Ago催化酶切的核心domain实际是一个RNaseH fold，催化cleavage时应该结合双链（无论DNA或RNA），而双链其中一个是guide，另外一个是target。我无法想象gDNAguided NgAgo是如何切割双链DNA的。文章开始用2个guide，也许还有些道理（说不定细胞DNA会有瞬时的单链状态）；后来直接上一个guide也能行，确实比较神奇。当然，不能够排除NgAgo本身特殊，就是能够切双链，只是从其类似蛋白结构上讲，可能性很小。
3.文章说如果同时转入Ago表达质粒和gDNA，就能行。如果先转Ago质粒，8小时候再转gDNA，就不行。这里我无法理解。难道先转Ago质粒8小时候，这个质粒就不表达了？如果继续表达，那8小时候再加gDNA跟同时一起转细胞又有什么区别呢？难道transfection效率太低，以至于2次transfect的东西无法进入同一细胞，因而不行？至少从这个角度来讲，文章的一个主要figure的结果有点奇怪。
4. Minor points:文章用bacteria codon 的construct在真核细胞表达蛋白，能有表达真心不容易。如果用humanized codon，效果岂不更好？文末作者declare nofinancial interest，如果这个东西将来有大用途了，还不能有专利呀，太失策了。
纯从science角度分析一下韩春雨的文章
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32021669.html
韩春雨的NgAgo效率怎么样？有人试过么?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32022589.html
韩春雨的NgAgo版上同志们进展如何
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025033.html
方舟子:韩春雨"诺贝尔奖级"实验的重复性问题. 附韩答复
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32026229.html
Ng-Ago 重复进展（集合贴）
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025503.html
三、重复证明结果
一位朋友最近在和韩老师交流，他只上国内虎扑不上MITBBS，所以我征得他同意发到这里，希望对正在重复这个实验的各位有所帮助。
for 24 well plate, 300ng NgAgo expression plasmid, 30-40ng GFP-N1, 200-500ng 5'P ssDNA guide----co-transfection. after 24 hours, detect GFP expressionunder fluorescnet microscopy. do not use electric trasnfection. NgAgo canremove 24bp from target, we suggest you do silver stain PAGE to observ T7E1results; the "Protocol of NgAgo/gDNA-mediated genome editing and examination(T7E1 assay) and a representative experiment" in ONLINE METHODS is veryhelpful! good luck!
韩春雨老师给的实验建议
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025735.html
韩春雨在985贴吧发言了?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025929.html
韩春雨说的可控的事情可否理解为可以操控？
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32027677.html
四、实验带来的疑问
国内知识产权形势比较复杂，自我保护意识都比较强。我老自己原来博士老板，985学校，搞出来个新东西，写课题和项目的时候，特意嘱咐我师兄把关键蛋白写成别的，比如说本来是Cdc42，就给写成Cdc47。
相信我，这不是个例，在国内混的都得会这一手。当然，韩这个已经不是课题，而是发表在著名公共期刊上的文章了，肯定不能写错太明显，那么很可能就会在一些protocol上动手脚。仅供参考。
我来说一下NgAgo
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028347.html
拜读韩春雨的论文
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028409.html
看看老外怎么评价韩春雨的NgAgo
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028447.html
NgAgo文章里Fig S4的NgAgo染色是怎么拿到的
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028491.html
五、被质疑的科学家
到目前为止，所谓的仇子龙看到了Indel，根本无法证明那个是NgAgo引起的，有常识的做过测序的人都知道，即使你拿同一个样品去测一百遍，你肯定会在其中的少许几个测序结果中发现会有所谓的indel，这种indel不是真实的indel，而只是测序本身带有的误差（这个是很正常的，喷子喷之前请先做功课）。要想证明NgAgo具有基因组层面的编辑功能，请参照CRISPR-Cas9的检测标准。搞了这么久，韩春雨所谓的全国20个实验室重复出来，原来是这种重复结果，真的令人觉得可笑。现在应该是时候给杂志社写comment了。
韩春雨NgAgo的Nature Biotechnology存在篡改结果科学不端行为
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32029651.html
韩春雨有义务为大家释疑
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32032859.html
一个搞物理的悄悄地评论一下大家对韩春雨老师论文的争论
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32029939.html
韩文到底有没有被重复?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030451.html
韩春雨的文章刚刚发表，有人就有看法
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030543.html
关于韩春雨是否造假，个人看法
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030565.html
六、实验证明
《自然》调查员戴维的访谈报告是亲自调查的结果吗？
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32043485.html
仇子龙的申明中说他们实验室用韩春雨的NgAgo在293细胞中看到测
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32070491.html
韩春雨回应质疑：对重复实验充满信心
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32032263.html

z*82017-05-21 07:05

6 楼

painter partition problem, 真难啊
http://www.leetcode.com/2011/04/the-painters-partition-problem.

D*R2017-05-21 07:05

7 楼

踢飞～～～要进来安慰你的，结果发现是变相潜在无意识地BSO贴。。。

c*y2017-05-21 07:05

8 楼

Looked at Nikon, Sony, Pentax and other Full Frame options, but decided I'll
just go back to Canon crop.
很奇怪

【在 R********A 的大作中提到】

: http://boston.craigslist.org/bmw/pho/1665993599.html

a*m2017-05-21 07:05

9 楼

最后再说一句，灌水的大方向肯定是货币化，不给钱，就不可能有长期
的繁荣，特别是在别的很多地方都给钱的情况下，看看微信公众号，
微博，付出都是有回报的。就算你不愿意出钱，弄个可货币化的伪币，
搞个打赏功能会死人吗？至少可以测试一下吧！
不过相比金钱而言，对核心竞争的维护，对灌水朋友的尊重也很重要。
这么多牛逼ID都走了，你自己不想想，不写信问问都是什么原因？怎么样
才能把他们搞回来吗？
这么多年的连续瞎胡搞，管理员像个脑残一样，结果是什么，自己看到了吧。
以前不少人给你提建议，不管好听，难听，基本是好心吧，结果你听就算了，
还忙着删帖封人，真是醉了！

q*y2017-05-21 07:05

10 楼

原来leetcode上有啊，多谢

l*e2017-05-21 07:05

11 楼

人家不愿意搞全副，回到佳能aps啊。
问题吗？

ll

【在 c********y 的大作中提到】

: Looked at Nikon, Sony, Pentax and other Full Frame options, but decided I'll
: just go back to Canon crop.
: 很奇怪

a*m2017-05-21 07:05

12 楼

当然老邢还是有点理想的，言论比较自由，让大家随便说，这一点beat国内
大多数网站，也不算是坏人。
你这个宣传贴，我看至少可以置顶一个月！
不用谢了，走了！

c*y2017-05-21 07:05

13 楼

pentax full frame?

【在 l********e 的大作中提到】

: 人家不愿意搞全副，回到佳能aps啊。
: 问题吗？
:
: ll

c*62017-05-21 07:05

14 楼

稍微有一丁点科学常识的人都不会介意你对于一个发现的评论。
但是很奇怪的是，当时大家在评论韩春雨的这个NgAgo的时候，大量的水军在后面跟帖
讽刺挖苦，或许不能叫做水军，很有可能是拥有国内三流四流大学背景没有接受过正规
科研训练的人，这个很不正常。更不正常的是这个NgAgo已经被认定为无法重复的时候
，韩春雨居然还能够继续保留自己的实验室自己的2.24亿基金。让说什么好呢？

编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获
得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化
出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所
谓基因组编辑技术，就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序
列。
文的负责人"一鸣惊人"，得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属
期刊上发表论文，通常表明，该科研成果走在了世界科学研究的最前沿，并有可能对未
来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出，在站内引起站内相关专业人士的
热议。

【在 m****s 的大作中提到】

: 2016年5月2日，英国《自然》杂志子刊《自然生物技术》刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所谓基因组编辑技术，就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序列。
: http://tv.cctv.com/2017/05/20/VIDEBZRf7rQNg2Y1ExpBhpQM170520.shtml
: 一、学界和媒体的热议Mitbbs.com
: 一年前，英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文。论文的负责人"一鸣惊人"，得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文，通常表明，该科研成果走在了世界科学研究的最前沿，并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出，在站内引起站内相关专业人士的热议。
: 国内科研水平不得了了，河北科技大学在Nature Biotechnoligy发表重要成果
: http://mitbbs.com/article_t/Faculty/31803583.html
: 感觉韩春雨做科研的境界比颜宁高
: http://mitbbs.com/article_t/Biology/32019973.html
: 二、实验结果被质疑
: 1.一般来说Ago蛋白C端加tag，无论是来自于那个物种，蛋白就没有活性了，主要由Ago蛋白自身结构folding决定。文中用的几个construct，好像只有1-2个C端是没有tag的。那么，用C端带tag的Ago作出的实验，是否有意义呢？当然，不能够排除NgAgo本身特殊，能够tolerate C端tag，只是从预测的结构上讲，可能性很小。

v*a2017-05-21 07:05

15 楼

你又点人家死穴

【在 c********y 的大作中提到】

: pentax full frame?

c*a2017-05-21 07:05

16 楼

不错，有思想

x*c2017-05-21 07:05

17 楼

胶片。。。

【在 c********y 的大作中提到】

: pentax full frame?

h*x2017-05-21 07:05

18 楼

有后续的跟踪调查了吗？

c*y2017-05-21 07:05

19 楼

“nikon, sony, pentax and other full-frame system.”
如果是胶片，就别和sony放一起了

【在 x****c 的大作中提到】

: 胶片。。。

e*o2017-05-21 07:05

20 楼

你真替老邢操心。
mitbbs 死了，还有其它的论坛，何必呢

【在 a*******m 的大作中提到】

: 最后再说一句，灌水的大方向肯定是货币化，不给钱，就不可能有长期
: 的繁荣，特别是在别的很多地方都给钱的情况下，看看微信公众号，
: 微博，付出都是有回报的。就算你不愿意出钱，弄个可货币化的伪币，
: 搞个打赏功能会死人吗？至少可以测试一下吧！
: 不过相比金钱而言，对核心竞争的维护，对灌水朋友的尊重也很重要。
: 这么多牛逼ID都走了，你自己不想想，不写信问问都是什么原因？怎么样
: 才能把他们搞回来吗？
: 这么多年的连续瞎胡搞，管理员像个脑残一样，结果是什么，自己看到了吧。
: 以前不少人给你提建议，不管好听，难听，基本是好心吧，结果你听就算了，
: 还忙着删帖封人，真是醉了！

x*c2017-05-21 07:05

21 楼

sony好歹也吞了美能达？

【在 c********y 的大作中提到】

: “nikon, sony, pentax and other full-frame system.”
: 如果是胶片，就别和sony放一起了

f*y2017-05-21 07:05

22 楼

老韩还在煮熟的鸭子，就是想逃避造假惩罚。早认错还能往作实验的学生身上推，现在
是没得退了。这种让他逃了，以后造假会更明目张胆。
最简单就是让他寄一盘NgAgo编辑后的细胞，大家帮他测序。全世界的细胞都可能支原
体或未知菌污染，但测序仪不会污染吧？什么？实验室没经费，液氮罐坏了，细胞没有
了。那你声称分分秒秒的可以重复，那就再作一个。

编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获
得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化
出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所
谓基因组编辑技术，就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序
列。
文的负责人"一鸣惊人"，得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属
期刊上发表论文，通常表明，该科研成果走在了世界科学研究的最前沿，并有可能对未
来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出，在站内引起站内相关专业人士的
热议。

【在 m****s 的大作中提到】

c*y2017-05-21 07:05

23 楼

把人家的名字都给彻底咔嚓了。。。

【在 x****c 的大作中提到】

: sony好歹也吞了美能达？

P*R2017-05-21 07:05

24 楼

中国都是韩春雨这种包子人物，就不会有中国威胁了。

【在 c********6 的大作中提到】

: 稍微有一丁点科学常识的人都不会介意你对于一个发现的评论。
: 但是很奇怪的是，当时大家在评论韩春雨的这个NgAgo的时候，大量的水军在后面跟帖
: 讽刺挖苦，或许不能叫做水军，很有可能是拥有国内三流四流大学背景没有接受过正规
: 科研训练的人，这个很不正常。更不正常的是这个NgAgo已经被认定为无法重复的时候
: ，韩春雨居然还能够继续保留自己的实验室自己的2.24亿基金。让说什么好呢？
:
: 编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获
: 得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
: 医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化
: 出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所

c*t2017-05-21 07:05

25 楼

......
明媒正娶的

【在 x****c 的大作中提到】

: sony好歹也吞了美能达？

a*u2017-05-21 07:05

26 楼

我不能理解他，无论是从开始造假到被质询的反应到现在的态度。不晓得是今日令中第
一人出类拔萃与众不同，还是禽兽之变诈几何哉止增笑耳？

【在 f****y 的大作中提到】

: 老韩还在煮熟的鸭子，就是想逃避造假惩罚。早认错还能往作实验的学生身上推，现在
: 是没得退了。这种让他逃了，以后造假会更明目张胆。
: 最简单就是让他寄一盘NgAgo编辑后的细胞，大家帮他测序。全世界的细胞都可能支原
: 体或未知菌污染，但测序仪不会污染吧？什么？实验室没经费，液氮罐坏了，细胞没有
: 了。那你声称分分秒秒的可以重复，那就再作一个。
:
: 编辑工具"的论文，论文负责人的英文署名是"Chunyu Han"，这篇论文在华人生物界获
: 得广泛赞誉。论文发表的第二天，韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
: 医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始，经过不断分裂，可分化
: 出大约60兆亿个构建人类身体的细胞，每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组，所

m*n2017-05-21 07:05

27 楼

as cold as boston

【在 R********A 的大作中提到】

: http://boston.craigslist.org/bmw/pho/1665993599.html

j*i2017-05-21 07:05

28 楼

老韩把科学的上争论上升到了哲学上的争论。只有他能做出来，你们都做不出来，这在
哲学上没错吧?