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揭密!师弟因疫情半年没进实验室,却发了2篇5分SCI!天天在电脑前在搞啥?

揭密!师弟因疫情半年没进实验室,却发了2篇5分SCI!天天在电脑前在搞啥?

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疫情来了,人被隔离了。


待在宿舍不能动弹的日子其实也不错,平时总被导师鞭策,早点发高分,早点发高分,早点发高分。


是我不想发吗?是早发晚发的问题吗?不是我不努力,生信发文真的越来越难!发个3分左右的文章已经要了我的老命。



这下因为疫情,去不了实验室,啥也干不成,导师也闭麦了。真好啊~


同门里也有几个卷王早早发了5+的,但我不care。要问我心态为啥这么好,还不是因为有个只能发2分文章的师弟陪着我垫底,我俩常常互相调侃对方为学渣,建立了深厚的革命友谊。


正当我躺在床上享受岁月静好时,突然传来一连串微信提示音。我打开手机一看,师门群里好不热闹。


“恭喜师弟!”“师弟太厉害了吧!”“师弟闷声发大财啊!”


看着看着我人傻了,怪不得师弟最近稳如老狗,原来他发了2篇5分文章,原来只有我两手空空在寝室做咸鱼,原来只有我是学渣!



被同门后辈反超,我一下子不淡定了。怎么突然一下子差距拉开这么大?


“师弟,说好一起当低分学渣的呢?”我私聊师弟。


“哈哈哈师兄,我也没想到能发这么高呀,就是看别人说有个方法好使,就找来资料研究了研究,没想到真成了!”


“有好东西怎么不分享分享?”我酸了。


“拿去吧师兄,这份生信+机器学习进阶套路手册真的很顶!”师弟甩给我一份资料。


机器学习?接下来,我仔细研究了一下机器学习以及这份资料,感觉自己摆脱低分崽身份还真的有希望了。



1

PRAT

机器学习+生信=开挂?


仔细研究了2分左右的生信文章,发现它们主要聚焦在差异基因的筛选、功能富集分析、基因表达水平的检验、预后模型的建立和评估等等。


这些都是常规的生信分析思路,创新程度很低。


说到底还是套路重复,方法不及时迭代,这也是为什么现在纯生信想发高分越来越难,通常会被要求补实验才好发。


想要降低发文难度,必须升级方法和套路!


机器学习就是这样一个发高分利器。仅仅2021年一年,生信+机器学习的套路已经在10+SCI上发了近60篇文章!



所谓机器学习,是指利用算法来检测数据中的模式,而不需要明确的指示。一个学习系统可以利用训练数据集,学会找出输入信息(例如图片)的特征与输出信息(如标签)之间的关联。


机器学习在生信分析中的运用越来越常见,越来越重要。


比如在基因组数据方面,用深度学习检测突变逐渐成为主流方法。


比如群体基因组学领域的PRS,用于基于基因组数据预测生物性状,这就是个典型的机器学习预测问题。


比如非肿瘤研究中,可以用机器学习来评估我们诊断标志物的诊断效力。


临床预测模型、筛基因、二代测序、代谢通路、非编码RNA分析、蛋白质结构功能预测、疾病亚型分型、术后预测……机器学习在这些方面的运用已经越来越多见了。


所以啊,不要再观望了,速度学起来,才能先人一步发高分,而不是做被师弟师妹甩在身后的人(哭了)。


2

PRAT

资源包里有什么秘籍?


因此,解螺旋为你整理151页机器学习算法相关资料!KNN算法、kmeans 算法、决策树算法、贝叶斯公式、线性回归、非线性模型、神经网络、mlr3 包等超多实用算法一次性get!不仅告诉你机器学习是什么,更告诉你如何用机器学习发文。

今天给大家带来机器学习资料!

部分目录截图↓↓↓



部分截图:

1

12篇教程文详解如何利用机器学习发高分?

机器学习就是教计算机分析数据,发现其中规律,以便人们进行预测或决定的实践。解螺旋为大家整理12篇教程文,研究透彻之后,各种生信分析难题都不在话下!


1
筛基因


在部分研究过程中,我们往往同时包含了生存结局和生存时间两个维度的信息。因此,充分利用生存信息,通过构建随机森林模型,来筛选重要基因是十分重要的。



2
临床预测


我们常见的临床预测模型根据建模方法,也就是算法的不同分为参数化模型、非参数化模型以及半参数化模型,参数化模型我们主要需要掌握的是线性回归和广义线性回归。



3
生信可视化


我们为大家详细讲解生信可视化,理论和实践兼备,学会了生信小白也能掌握高逼格数据可视化方法!




4
生信分析


生信分析是运用新的高通量分子生物技术收集并分析大量组学数据, 进而在数据研究基础上对生物医学问题进行研究、开发,生信分析可以认为是生物信息学的重要组成部分之一。


......


2

超多实用算法一次get

机器学习算法太多了,分类、回归、聚类、推荐、图像识别领域等等,要想找到一个合适算法真的不容易。


解螺旋为大家整理超多实用算法,包括KNN算法、kmeans 算法、决策树算法、贝叶斯公式、线性回归、非线性模型、神经网络、mlr3 包等。


1
KNN算法


KNN 算法,属于一种有监督学习中的分类算法,是所有机器学习算法中最简单但十分高效的方法。



2
kmeans 算法


kmeans 算法最初是在 1967 年提出的,当设定 k 个不同的聚类分组后,通过选取 k 个不同的样品作为聚类种子,随后根据其余样本到达这 k 个样品的距离大小,最终将整个样本分成 k 个不同的分组。



3
决策树模型


决策树(Decision Tree),是一种应用十分广泛的归纳推理算法。通过不断的学习解析表达式的特征,找到针对目标的学习规律。





4
贝叶斯公式


贝叶斯不是一种模型,而是一类模型,是一类基于贝叶斯算法的模型,我们最常使用的是其中的一种模型被称为朴素贝叶斯(Naive Bayes)。



5
线性回归模型


针对线性回归(简单线性回归)来说,自变量为数值型变量(离散型&连续型),而因变量则是要求为连续型变量且建议正态分布。




6
非线性模型


当我们做多了线性模型,或者线性模型的结果不好解释,亦或者线性模型的结果不符合我们预期的时候,我们往往会产生一种疑问:数据之间的关系就一定是线性的吗?不一定吧!数据之间的关系应该可以是线性相关,也可以是非线性相关才对。





7
神经网络


从广义上来说,人工神经网络是一种通用模型,可以应用于几乎任何学习任务:分类、数字预测,甚至是无监督模式识别。



8
mlr3 包


我们完全可以把 mlr3 包当成是一个仓库,里面存放着一系列拥有统一端口的机器学习算法, 这样会大大降低 R 语言进行机器学习的成本,方便我们后续进行多模型性能的评估。


......

以上
仅是此次资料中的极少一部分目录
内容较多,整理不易
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