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无敌!TCGA、GEO、STRING等14个数据库挖掘教程,0代码即可实现!

无敌!TCGA、GEO、STRING等14个数据库挖掘教程,0代码即可实现!

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今天,给大家带来解螺旋这份生信热点数据挖掘教程,足足1000页+,包含肠道菌群、外泌体、细胞自噬、甲基化、基因调控等生信热点挖掘教程,更有14个基础数据库详细教程,学完就能上手!

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信热点数据挖掘教程  足足1000页+


 热点 1 

肠道菌群


AMDB数据库整合34个研究项目的2530个样本测序数据,提供467种动物的10478个肠道微生物分布及群落结构信息,为基于肠道微生物角度探讨宿主健康与疾病诊疗相关研究提供极大便利。



 热点 2 

外泌体


近几年里,外泌体越来越火热,成为国自然“新宠”,今天带大家了解九大外泌体数据库,帮助你了解和使用这些数据资源,更好地开展外泌体研究工作。




 热点 3 

细胞自噬


就细胞而言,自噬的“亦正亦邪”就是一把双刃剑,它可与凋亡相互协同,共同促进细胞死亡,也可促进细胞存活而拮抗凋亡效益。


HADb数据库提供直接或间接调解自噬过程的人类基因/蛋白质信息,我们为大家准备了详细的HADb数据库使用教程,你真的不能错过




 热点 4 

甲基化


EWAS Data Hub是由国家基因组科学数据中心开发并维护的表观遗传组关联分析数据库,提供 DNA 甲基化图谱数据,快一起来看看~


 热点 5 

微生物和免疫

GIMICA 数据库提供塑造人类微生物群的宿主遗传与免疫相关因子信息,及环境因子信息外部数据库链接,为基于宿主和环境因素探讨微生物与疾病发病机制及诊疗相关性研究提供极大便利。


 热点 6 

基因调控

转录因子(TFs)及其下游靶基因形成的基因调控网络(Gene regulatory networks,GRNs)在基因表达调控中扮演重要角色,我们将带大家来学习 GRNdb 数据库,帮助小伙伴们更方便进行基因调控相关机制研究。


14个基础数据库详细教程  学完就能上手


我们还为大家准备了14个基础数据库详细教程,学完就能上手!


包括CCLE数据库、UALCAN数据库、DAVID数据库、KM plotter数据库、Genecards数据库、NetworkAnalyst数据库、GEO数据库、shinyGEO、GSEA软件、STRING数据库、ICGC数据库、TARGET 数据库、JASPAR数据库、 TCGA数据库。




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