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最全的生物样本数据库(Biobank)收集;及部分公开数据库的大数据分享

最全的生物样本数据库(Biobank)收集;及部分公开数据库的大数据分享

科学

让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。


(仅限于医生和生物医学研究者)

关键词:临床科研;生物样本数据库

数据库是做科研最重要的资源之一。
除了创建自己的高质量的数据库(如医生自己的患者数据库)之外,充分利用公共数据库也是非常好的方法。

我们之前介绍过UK Biobank和Biobank Japan这些开发的公共数据库,后台很多朋友问是否有中国人群的生物样本数据库、及还有哪些数据库?
频发顶刊!利用数据库UK Biobank,中国学者也发了980篇SCI论文
Biobank Japan:利用同为东亚人群的公共数据库,中国学者发了所有SCI论文的21%!

在进行检索后,我们借用Cell Genomics杂志于2022年10月一篇文章的数据【1】,展示全球23个生物样本数据库及其链接。

(目前全球23个生物样本数据库总览图)


生物样本数据库的名称、所属地区/机构、网站链接如下:

1,Biobank Japan (BBJ)

Japan

https://biobankjp.org/en/index.html

2,BioMe

USA

https://icahn.mssm.edu/research/ipm/programs/biome-biobank


3,BioVU

USA

https://victr.vumc.org/biovu-description/?_ga=2.238124995.2111368117.1624912981-1722622661.1624912981


4,China Kadoorie Biobank (CKB)

China

https://www.ckbiobank.org/site/


5,Colorado Center for Personalized Medicine (CCPM)

USA

cobiobank.org


6,deCODE Genetics

Iceland

www.decode.com


7,Estonian Biobank (ESTBB)

Estonia

https://genomics.ut.ee/en/content/estonian-biobank


8,FinnGen

Finland

https://www.finngen.fi/en


9,Generation Scotland (GS)

Scotland

https://www.ed.ac.uk/generation-scotland


10,Genes & Health (GNH)

UK

https://www.genesandhealth.org/


11,Lifelines Biobank (Lifelines)

Netherlands

https://www.lifelines.nl/researcher/cohort-and-biobank


12,Michigan Genomics Initiative (MGI)

USA


13,Mass General Brigham Biobank (MGB)

USA


14,The QSkin Sun and Health Study (Qskin)

Australia

https://www.qimrberghofer.edu.au/study/qskin/


15,Taiwan Biobank (TWB)

Taiwan

https://www.twbiobank.org.tw/


16,Trøndelag Health Study (HUNT)

Norway

https://www.ntnu.edu/hunt/about-hunt


17,UCLA ATLAS Community Health Initiative (UCLA)

USA

https://www.uclahealth.org/precision-health/atlas


18,UK Biobank

UK

https://www.ukbiobank.ac.uk/


19,Canadian Partnership for Tomorrow’s Health (CanPath)

Canada

https://canpath.ca/


20,National Biobank of Korea

Korea

https://nih.go.kr/contents.es?mid=a50401010100


21,Qatar Biobank

Qatar

https://www.qatarbiobank.org.qa/ ;

https://www.qatargenome.org.qa/


22,Biobank of the Americas

USA


23,Penn Medicine BioBank

USA

https://pmbb.med.upenn.edu/


附我们已经做过解读的公开数据库:
Biobank Japan:利用同为东亚人群的公共数据库,中国学者发了所有SCI论文的21%!
频发顶刊!利用数据库UK Biobank,中国学者也发了980篇SCI论文
开放数据库发不了好文章?利用NHANES,已有73篇JAMA论文;中国学者也发了1,666篇SCI!

利用公开数据库研究的辅助措施:
但是利用开放数据库也面临着越来越难的问题,就是越来越难以提出“重要而未解决的问题”;这时候,采用更严谨或者新的统计分析方法就更为重要。
多基因风险评分2023:个体化医疗的利器,临床科研的宠儿
孟德尔随机化:减少混杂因素干扰的析因利器,1/3论文发在6+ SCI期刊
倾向性评分匹配2023:有效消除混杂因素的影响,在真实世界的临床科研中迅速推广

美国恒祥咨询公司(Healsan Consulting LLC, HS)从2016年开始大数据分析项目,特别擅长于医学统计分析(如孟德尔随机等)和数据库构建。
如果您需要找专家协助完成统计分析,可以通过我们的科研助手与美国Healsan Consulting联系。


参考文献:

【1】 https://www.cell.com/cell-genomics/pdf/S2666-979X%2822%2900141-0.pdf



编辑:Henry,微信号:Healsan助理:ChatGPT
分析机构:
Healsan Consulting,擅长医学生物大数据分析、临床数据库利用及医学统计分析;成为越来越多生物制药公司、科研机构和医生科学家“外挂医学科研部”。


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(添加科研助手,请务必说清添加理由,如“统计分析”)

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