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ChatGPT-24:全球有哪些公开的医学生物数据库?

ChatGPT-24:全球有哪些公开的医学生物数据库?

科学

让科研和SCI论文成为临床工作的副产品。


关键词:数据库;ChatGPT;Q&A-22

医学生物领域的最新进展和知识通过论文传递,并通过逐渐升级的临床诊治指南体现出来
除此之外,对于一些基础性工作,尤其是基因组数据等耗费了大量人力物力完成的工作,犹如一座金矿,但挖掘出来才能成为推动医学生物进步;所以也会被公开。
所以今天的ChatGPT问答,就回复群友刘树林后台的问题:
全球有哪些公开的医学生物数据库?


ChatGPT的回复是:



以下是一些全球开放的医学生物领域数据库,以及它们的简介及链接:


1,PubMed Central (PMC):

由美国国立卫生研究院(NIH)维护的免费公开数据库,包括全文生物医学文献。PMC收录了来自世界各地的超过700万篇生物医学文献,其中很多已经过同行评审。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/


2,Europe PubMed Central: 

由欧洲分子生物学实验室(EMBL)维护的免费公开数据库,类似于PMC,但重点收录欧洲研究人员的生物医学文献。

https://europepmc.org/


3,ExPASy: 

由瑞士生物信息学研究所(SIB)维护的免费公开数据库,包括蛋白质序列和功能信息,以及其他生物学数据。ExPASy提供了多种工具和资源,以支持生物学家的研究工作。

https://www.expasy.org/


4,ProteomeXchange: 

由多个国际组织共同支持的免费公开数据库,包括蛋白质组学数据。ProteomeXchange致力于促进蛋白质组学数据的共享和重复利用,为蛋白质组学研究提供了一个全球性的资源。

https://www.proteomexchange.org/


5,UniProt: 

由多个国际组织维护的免费公开数据库,包括蛋白质序列和功能信息。UniProt整合了来自各种资源的蛋白质序列和功能信息,为生物学家提供了一个全面的蛋白质知识库。

https://www.uniprot.org/


6,PDB: 

由美国国家科学基金会(NSF)和美国国家卫生研究院(NIH)共同支持的免费公开数据库,包括蛋白质三维结构的信息。PDB收录了来自世界各地的超过18万个蛋白质结构,是结构生物学研究的重要资源。

https://www.rcsb.org/


7,Ensembl: 

由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)和Wellcome Trust Sanger研究所共同支持的免费公开数据库,包括人类和其他生物的基因组学数据。Ensembl提供了全面的基因注释信息,以帮助研究人员理解基因组的功能。

https://www.ensembl.org/


8,The Cancer Genome Atlas (TCGA): 

由美国国家癌症研究所(NCI)维护的免费公开数据库,包括多种癌症的基因组学数据。TCGA收录了来自超过11000名患者的多种癌症样本的基因组学数据,为癌症研究人员提供了重要的资源。

https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga


9,The Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID): 

由多个国际组织支持的免费公开数据库,包括流感病毒的基因组学数据。GISAID致力于促进流感病毒数据的共享和分析,以加强对流感病毒传播的全球监测。

https://www.gisaid.org/


10,The Human Protein Atlas: 

由瑞典皇家工学院和乌普萨拉大学共同支持的免费公开数据库,包括人类蛋白质的表达和定位信息。Human Protein Atlas为生物学家提供了一个全面的人类蛋白质图谱,以帮助他们理解人类生命的基本过程。

https://www.proteinatlas.org/


11,ClinicalTrials.gov: 

由美国国立卫生研究院(NIH)维护的免费公开数据库,包括全球临床试验的信息和结果。ClinicalTrials.gov提供了有关已注册的、进行中的和已完成的临床试验的信息,以及试验的结果。 

https://clinicaltrials.gov/


12,GenBank:

由NCBI维护的免费公开数据库,包括已知的DNA序列和相关的注释信息。GenBank收录了来自世界各地的超过2.5亿个核苷酸序列,是基因组研究的重要资源。 

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/


13,TCGA: 

由美国国家癌症研究所(NCI)维护的免费公开数据库,包括多种癌症的基因组学数据。TCGA收录了来自超过11000名患者的多种癌症样本的基因组学数据。

https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga


以上列举的数据库都是全球范围内的重要开放数据库,其中有些是由美国的机构或组织维护,有些则是由其他国际组织维护。它们为医学生物领域的研究人员提供了重要的资源和支持。




编者按:


非常非常好的问题。

充分利用这些数据库,才能站在巨人的肩膀上推动自己的研究更加深入。


我们也很愿意借此介绍我们长期的合作伙伴:美国Healsan Consulting公司的大数据分析项目。


A,这是一个快速发展、服务与科研共同发展的机构。



B,主要对五个数据库进行分析



C,形成对项目从专科、专病、专家、基金、热点、撤稿等六个维度的报告。

D,2022年为12个生物制药公司、8个人才中心、近百位医生/科学家/医院科研处生物大数据分析;包括有些材料被用于发表SCI论文。

最后,

您想问ChatGPT什么问题?发给我们

欢迎后台留言提问。

参考资料来源:

https://chat.openai.com/chat



编辑:Henry,微信号:Healsan助理:ChatGPT
封面图片制作:Healsan Consulting LLC©,委托OpenAI制作;原型:Jackson
报告机构:Healsan Consulting,主要利用大数据分析,为人才培育、制药公司及医生提供医学和生物领域的数据挖掘、分析和咨询服务。


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